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RNA-ポリペプチド相互作用のコンビナトリアル解析

RNA-多肽相互作用的组合分析

基本信息

批准号：
15030213
负责人：
原田和雄
金额：
$ 4.1万
依托单位：
Tokyo Gakugei University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
财政年份：
2003
资助国家：
日本
起止时间：
2003 至 2004
项目状态：
已结题

项目摘要

申請者は、ヒト免疫不全症ウイルス(HIV) Revタンパク質とその結合相手であるRev response element (RRE)をモデル・システムとしたRNA-ポリペプチド相互作用のメカニズムの解析を行ってきた。その最大の特徴・独創的な点は、申請者らが開発した細胞内RNA-ポリペプチド相互作用検出系を用いて、RNAとペプチドの双方のコンビナトリアル解析を行っている点である。これまで、アルギニンを主体とするコンビナトリアル・ライブラリーを用いたRRE結合ペプチドの探索により、本来の結合相手であるRevペプチドよりも強くRREと結合し、Revペプチドとは異なる結合様式を持つRSG-1.2、重要なグルタミン残基を持つK1およびDLAペプチドペプチドを同定した(Harada et al.,PNAS,1997;Peled-Zehavi et al.,RNA,2003)。本研究期間は、まずRSG-1.2ペプチドとの結合に重要な、RREヌクレオチドを同定し、RREによるRevおよびRSG-1.2ペプチドとの結合の特異性を1塩基置換により容易にスイッチ出来ることを見いだした(Iwazaki et al.,submitted)。また、K1およびDLAペプチドとRREとの相互作用のメカニズムをコンビナトリアルおよび生化学的な手法を用いて解析を行い、その結合の様式およびアミノ酸要求性に関する知見を得た(Sugaya et al.,in preparation)。

The applicants and recipients of immune deficiency syndrome (HIV) Rev immune deficiency syndrome (HIV) immune deficiency virus were combined with hand-linked immune deficiency syndrome (RRE) antibody, immune deficiency virus (RRE), immune deficiency virus (RNA-), immune interaction, immune interaction, immune response, immune response, and immune response. On the basis of the maximum special information, the applicant and the applicant are responsible for the interaction between the intracellular RNA- and the RNA. both parties are required to analyze the data point. In this paper, we use the combination of RRE and hardware to explore the problem, and to use the combination of hand and Rev to strengthen the RRE bond, and to use the combination of Rev and hardware to explore the RSG-1.2. Important amino acid residues hold the same sequence (Harada et al.) K1, DLA, and Harada et al. PNAS,1997 Peled-Zehavi et al.,RNA,2003). During the period of this study, it is easy to verify the results of the combination of important RSG-1.2, RRE, Rev, Rev, RSG-1.2, and Iwazaki et al.,submitted. K1, DLA, RRE, interaction, biochemistry, biochemistry