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RNA-ペプチド複合体を介した配列情報の伝達

通过 RNA-肽复合物传输序列信息

基本信息

批准号：
12029209
负责人：
原田和雄
金额：
$ 1.41万
依托单位：
Tokyo Gakugei University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (A)
财政年份：
2000
资助国家：
日本
起止时间：
2000 至无数据
项目状态：
已结题

项目摘要

本研究では、RNA-ペプチド間の形の相補性に基づいた配列情報の伝達が可能ではないかと考え、ペプチド鋳型上での特定のRNA配列の会合・縮合反応を試みた。モデル反応構築の枠組みとして、ヒト免疫不全症ウイルス(HIV)RevタンパクのRNA結合ドメインに相当する短いペプチド(Revペプチド)、および、Revの結合相手であるRev-responsive element(RRE)との複合体を用いた。また、Revペプチドよりも強くRREと結合する人工ペプチド(RSG-1.2)について検討した。まず、RREをいくつかの特定の位置で切断した形のRNA断片を調製し、ゲル・シフト法によりこれらのRNA断片のRevおよびRSG-1.2との複合体形成を調べたところ、RSG-1.2の場合のみその形成が確認できた。そこで、RSG-1.2ペプチド存在下でのRNA断片の縮合反応を化学縮合剤EDACを用いて行ったところ、期待されたペプチドによる縮合反応の促進は見られなかった。次に、二つのRNA断片を繋ぎ止めているステム領域の相補性を無くすことにより、ペプチドが存在しない時の反応の効率が著しく低下し、その結果、反応の特異性(ペプチドの有無における反応の効率の割合)が向上した。現在、より大きなペプチドによる縮合反応の促進効果が見られるよう、基質のデザインの改良を行っている。具体的には、ダンベル型RREをステム領域を残した形で、2ケ所で切断した基質の縮合反応について検討している。また、牛免疫不全症ウイルス(BIV)TARRNAとBIV Tatペプチドとの複合体をモデルとした反応についても検討している。さらに、RNA上のどの位置でのカップリングが可能であるか明らかにするため、circular permutation analysisを行ない、ペプチドとの結合に影響しないRNA上の切断位置を解析している。

In this study, it is possible that the specific RNA arrangement will meet the requirements of the specific RNA arrangement on the basis of the correlation between the two groups in this study. The combination of anti-immune syndrome (HIV) Rev antibody (RNA) and immune deficiency syndrome (RRE) is equivalent to the combination of short-term immune response (Rev), immune deficiency syndrome (RRE) and immunodeficiency syndrome (RRE). The combination of RRE, Rev, and manual equipment (RSG-1.2) will result in a lot of damage. RRE fragments, Rev fragments, RSG-1.2 fragments, Rev fragments, RSG-1.2 fragments, Rev fragments, Rev fragments, RSG-1.2 fragments, Rev fragments, RSG-1.2 fragments, Rev fragments, DNA fragments, DNA fragments In the presence of RNA fragments and RSG-1.2 fragments, the chemical combination of RNA fragments and EDAC is expected to promote the reverse reaction. The second and second RNA fragments show that there is no fault in the field of correlation, and that the rate of response is affected by the low temperature, the result of the test, and the reversal characteristic (the rate of response is higher than that of the control). At present, it is necessary to improve the quality of the system and improve the quality of the system. The specific type of RREEs in the field is broken in shape, and the base is closed and closed in the field of 2. BIV, bovine immune insufficiency (BIV) TARRNA immune deficiency virus, bovine immune insufficiency, bovine immune deficiency, bovine immune insufficiency, bovine immune deficiency, bovine immune insufficiency, bovine immune deficiency, bovine immune insufficiency, bovine immune insufficiency, bovine immune deficiency, bovine immune insufficiency, bovine The location on the RNA, the location on the RNA, the location, and the location on the RNA.