RNAをターゲットとしたHIV複製の阻害剤の遺伝的スクリーニング

HIV复制RNA靶向抑制剂的基因筛查

基本信息

  • 批准号:
    11161211
  • 负责人:
  • 金额:
    $ 1.34万
  • 依托单位:
  • 依托单位国家:
    日本
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (A)
  • 财政年份:
    1999
  • 资助国家:
    日本
  • 起止时间:
    1999 至 无数据
  • 项目状态:
    已结题

项目摘要

我々は、これまでにRNA-タンパク質相互作用を細胞内で検出する系を開発し、HIVの複製において重要な役割を果すRev-response element(RRE)に結合する新規ペプチドをコンビナトリアル・ライブラリーから同定することができた。また、これらのペプチドがRREの結合相手であるRevタンパク質によるRNAの核外輸送を阻害することを明らかにした。このことから、特定のRNAを標的とするペプチドを用いることにより、HIV複製をさまざまなステップで制御できることが示唆された。しかし、このスクリーニング法を用いてRRE以外のRNA構造と結合するペプチドの同定を試みたが、成功に至っていない。そこで、多様なRNAと結合するペプチドの同定が可能となるよう、これまでに二つの改良を行ってきた。まず、上述の実験系を用いてより多くの配列を検索できるよう、レポーター遺伝子であるLacZの代りにカナマイシン耐性遺伝子(NPT II)を挿入した。その結果、RNAとポリペプチドの結合活性と対応するカナマイシン耐性が得られ、原理的には10^8〜10^9のペプチド配列からの「セレクション」が可能となったことを既に報告した。そこで、本研究期間は、このカナマイシン耐性遺伝子を用いたレポーター系を最適化するとともに、コンビナトリアル・ライブラリーのデザイン法の改良を行った。具体てきには、ポリアルギニンに高い割合いで変異を導入した形のライブラリーを作製し、RRE結合ペプチドをスクリーニングしたところ、高いRRE結合能を有するペプチドを容易に同定できた。現在、種々のHIV RNA構造を標的としたスクリーニングを行っている。また、既に同定したRRE結合ペプチド(RSG-1.2)がRevタンパクの阻害剤のリード化合物であると考え、in vivo RNA selection法によるRSG-1.2との結合において重要なRRE上のヌクレオチドを同定し、Revとの結合様式の違いを解析している。
We have a new regulation of RNA-protein interactions in the intracellular detection system, the development of HIV replication, and the binding of an important service element(RRE). The binding of RNA to the nucleus of a plant is a problem. This is the first time that the virus has been detected. This method is successful in combining RNA constructs other than RRE with RNA constructs. For example, if you have multiple RNA combinations, you may have multiple RNA combinations, and you may have multiple RNA combinations. In addition, the above mentioned implementation system is used to implement the multi-component allocation system, such as the multi-component allocation system, the multi-component allocation system and the multi-component allocation system. The results showed that the RNA binding activity was higher than that of the RNA binding activity. The RNA binding activity was higher than that of the RNA binding activity. The RNA binding activity was higher than that of the RNA binding activity. In this study, the improvement of the method of optimization of the system of resistance genes was carried out In particular, RRE binding energy can be easily determined by changing the shape of RRE binding energy. Now, the structure of HIV RNA is very important. In vivo RNA selection method, RSG-1.2 binding is very important for RRE binding. RSG-1.2 binding is very important for RRE binding.

项目成果

期刊论文数量(3)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
K.Harada and A.D.Frankel: "Screening RNA-binding libraries using a bacterial transcription antitermination reporter assay"in RNA-Protein Interaction Protocols,Methods in Molecular Biology Vol.118 Humana Press. 118. 177-187 (1999)
K.Harada 和 A.D.Frankel:“使用细菌转录抗终止报告基因测定筛选 RNA 结合文库”,载于 RNA-蛋白质相互作用方案,分子生物学方法第 118 卷 Humana Press。
  • DOI:
  • 发表时间:
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
  • 通讯作者:
原田和雄: "新規RNA結合ポリペプチドの創製―コンビナトリアル・ライブラリーからの分子進化的スクリーニング"蛋白質核酸酵素. 44・9. 1572-1583 (1999)
Kazuo Harada:“新型 RNA 结合多肽的创建 - 从组合文库中进行分子进化筛选”蛋白质核酸酶 44・9(1999)。
  • DOI:
  • 发表时间:
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
  • 通讯作者:
S.A. Robertson, K. Harada, A.D. Frankel, nd D.E. Wemmer: "Structure determination and binding kinetics of a DNA aptamer-argininamide comples"Biochemistry. 39. 946-954 (2000)
S.A. 罗伯逊、K. 原田、A.D. 弗兰克尔和 D.E.
  • DOI:
  • 发表时间:
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
  • 通讯作者:
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