Comprehensive analysis of functional non-coding RNAs in cancer genome on multistage carcinogenesis

癌症基因组中功能性非编码RNA对多阶段癌变的综合分析

• 批准号: 23241066
• 负责人: SAKAKIBARA Yasubumi
• 金额: $ 31.12万
• 依托单位: Keio University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (A)
• 财政年份: 2011
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2011-04-01 至 2015-03-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-23241066/
• 关键词: 発がん; 非コードRNA; 遺伝子発現解析; 次世代シークエンサー; 腫瘍; マウス

项目成果

A Machine Learning Based Approach to de novo Sequencing of Glycans from Tandem Mass Spectrometry Spectrum

• DOI: 10.1109/tcbb.2015.2430317
• 发表时间: 2015-11-01
• 期刊: IEEE-ACM TRANSACTIONS ON COMPUTATIONAL BIOLOGY AND BIOINFORMATICS
• 影响因子: 4.5
• 作者: Kumozaki, Shotaro;Sato, Kengo;Sakakibara, Yasubumi
• 通讯作者: Sakakibara, Yasubumi

機械学習を用いたタンパク質とRNAのコンタクト予測

使用机器学习预测蛋白质-RNA 接触

• 发表时间: 2014
• 作者: 前田佳孝;鈴木聡;他;佐藤健吾，柏木駿也，榊原康文
• 通讯作者: 佐藤健吾，柏木駿也，榊原康文

DAFS: simultaneous aligning and folding of RNA sequences via dual decomposition

• DOI: 10.1093/bioinformatics/bts612
• 发表时间: 2012-12-01
• 期刊: BIOINFORMATICS
• 影响因子: 5.8
• 作者: Sato, Kengo;Kato, Yuki;Sakakibara, Yasubumi
• 通讯作者: Sakakibara, Yasubumi

Congenic mapping and allele-specific alteration analysis of Stmm1 locus conferring resistance to early-stage chemically induced skin papillomas.

• DOI: 10.1371/journal.pone.0097201
• 发表时间: 2014
• 期刊: PloS one
• 影响因子: 3.7
• 作者: Okumura K;Saito M;Isogai E;Miura I;Wakana S;Kominami R;Wakabayashi Y
• 通讯作者: Wakabayashi Y

ヒト膵臓がんにおける臓器内真正細菌のゲノム解析

人类胰腺癌真细菌的基因组分析

• 发表时间: 2013
• 作者: N. Ioku;K. Ishige and E. Yanagida;舟木直久;榊原康文，鈴木秀和
• 通讯作者: 榊原康文，鈴木秀和