The role of the encounter complexes studied by molecular simulations of the protein complex formation processes.

通过蛋白质复合物形成过程的分子模拟研究相遇复合物的作用。

• 批准号: 23247027
• 负责人: AKINORI Kidera
• 金额: $ 30.04万
• 依托单位: Yokohama City University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (A)
• 财政年份: 2011
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2011-04-01 至 2015-03-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-23247027/
• 关键词: タンパク質複合体; 分子シミュレーション; 遭遇複合体; マルチスケールモデル; 過渡的複合体; 生物物理; タンパク質間相互作用; 分子動力学シミュレーション; 自由エネルギー; 構造・機能予測; サンプリング; 拡張サンプリング; 経路探索

项目成果

Multiscale enhanced sampling simulation of protein interaction

蛋白质相互作用的多尺度增强采样模拟

• 发表时间: 2012
• 作者: 西野優紀;尾上靖宏;小嶋誠司;西岡典子;本間道夫;Kei Moritsugu
• 通讯作者: Kei Moritsugu

全原子モデル-粗視化モデルの連成シミュレーションによる蛋白質複合体形成過程の解析

全原子模型与粗粒度模型耦合模拟分析蛋白质复合物形成过程

• 发表时间: 2014
• 作者: 大森聡;森次圭;木寺詔紀
• 通讯作者: 木寺詔紀

Structural ensemble of protein encounter complex revealed by Multiscale Essential Sampling

多尺度基本采样揭示蛋白质遭遇复合物的结构整体

• 发表时间: 2013
• 作者: Satoshi Omori;Kei Moritsugu;Akinori Kidera
• 通讯作者: Akinori Kidera

Comparative molecular dynamics simulations study of crystal environment effect on protein structure

晶体环境对蛋白质结构影响的比较分子动力学模拟研究

• DOI: 10.1021/jp2125558
• 发表时间: 2012
• 期刊: J.Phys.Chem.B.
• 作者: T.Terada;A.Kidera
• 通讯作者: A.Kidera

全原子モデル- 粗視化モデル連成法を用いた蛋白質複合体形成過程の分子シミュレーション

全原子模型-粗粒模型耦合方法分子模拟蛋白质复合物形成过程

• 发表时间: 2013
• 作者: 大森 聡;森次 圭;木寺 詔紀
• 通讯作者: 木寺 詔紀