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植物の乾燥ストレス応答におけるゲノムワイドな転写開始点制御の機能解析

植物干旱胁迫反应中全基因组转录起始位点调控的功能分析

基本信息

批准号：
22K19170
负责人：
梅澤泰史
金额：
$ 4.16万
依托单位：
Tokyo University of Agriculture and Technology
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Challenging Research (Exploratory)
财政年份：
2022
资助国家：
日本
起止时间：
2022-06-30 至 2025-03-31
项目状态：
未结题

项目摘要

生物が環境の変化に応答するとき、一般的にはゲノムワイドな遺伝子発現の変化を伴う。これによって、細胞内のタンパク質の構成比が変化し、様々な応答機構を誘導することができる。一方、遺伝子の転写開始点が変化すると、プロモーターの調節領域が変化したり、翻訳産物のアミノ酸配列に影響を与えるので、一つの遺伝子領域から機能の異なる複数のタンパク質を作り出すことができる。そこで、申請者らは植物の乾燥ストレス応答における転写開始点制御の研究に着手した。Hi-Seq3000シーケンサー（illumina社）を用いて、転写開始点を網羅するTSS-seq解析を行ったところ、シロイヌナズナにおいて乾燥ストレスの際に転写開始点が大規模に変化することを突き止めた。したがって、転写開始点制御が植物の乾燥ストレス応答の一環として機能している可能性がある。今年度は、転写開始点のデータをさらに蓄積するとともに、転写開始点制御を受ける遺伝子の機能解析を進めた。まず転写開始点制御を確認するために、5'-RACE法を用いて合計9種類の遺伝子について確認した。さらに、それらの遺伝子の機能を調べるために、遺伝子破壊株を確立した。現在、これらの遺伝子破壊株の表現型を解析しているところである。

The biological environment changes in response to the general environment changes in response to the development of biological agents. The composition ratio of the intracellular protein and the response mechanism are changed. The starting point of a gene is changed, the regulatory domain is changed, and the acid sequence of the inverted product is affected. Therefore, the applicant began to study the starting point control when he responded to the drying of plants. Hi-Seq3000: Use, Write Start Point, TSS-Seq Analysis: Use, Write Start Point, Write Start Point, Mass Change The first step is to control the possibility of drying plants. This year, the function analysis of the storage of the starting point and the control of the starting point is advanced. 9 types of genes are identified by the 5'-RACE method. The function of the gene is regulated, and the gene is established. Now, the phenotype analysis of these plants is very important.