共生型ウイルスの真の多様性をキノコで解く

利用蘑菇揭示共生病毒的真正多样性

• 批准号: 22KJ0440
• 负责人: 趙 彦杰
• 金额: $ 2.83万
• 依托单位: University of Tsukuba
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for JSPS Fellows
• 财政年份: 2023
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2023-03-08 至 2025-03-31
• 项目状态: 未结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-22KJ0440/
• 关键词: マイコウイルス; きのこ; 環境ウイルス

本研究では、自然界生態系における「宿主と共生するウイルス」の真の多様性を解明することを目的としている。実験計画初年度である2022年度は、上記目的達成のために、まず“キノコ子実体から共生型ウイルスの多様性”を解析した。研究材料は自然界の子実体から分離した菌株を用いた。2022年度はアガロースゲル電気泳動方法 (AGE)およびdsRNA シーケンシング (FLDS方法)により担子菌類とチャワンタケ (子嚢菌類)のウイルススクリーニングを実施した。その結果、 担子菌類の51分離株のうち、5株はウイルス保持株として検出された。さらに、FLDS法を用いて、ウイルス保持株から5種の二本鎖RNA（dsRNA）ウイルス、1種のプラスセンス一本鎖RNA（+ssRNA）ウイルス、および1種のプラスセンス一本鎖RNA（-ssRNA）ウイルスの新規ゲノム配列を同定した。また、同定されたウイルスの配列情報を用いて、特異プライマーを設計して、長期保存の子実体標本からRT-PCRにより各ウイルスも検出できた。分離株及び子実体標本からウイルスを検出したことで、上記行われた方法は有効的にウイルスを探索できることを証明した。さらに、上記確立した方法でチャワンタケ (子嚢菌類)の57分離株からウイルススクリーニングを実施した結果、13株はウイルスを保持することが解明した。また、FLDS法によりウイルス配列を決定し、検出できた11種のウイルスのうち、MitovirusとEndornavirusはそれぞれ4種であることがわかった。現在は各ウイルス配列の特徴と分類地位を進んでいる。今後はウイルス検出しやすい菌種に注目して、環境中におけるウイルスの機能に進む予定である。

This study で は, nature ecosystem に お け る と symbiotic す "host る ウ イ ル ス" の is の multiple others を interpret す る こ と を purpose と し て い る. Be 験 plan at the beginning of the annual で あ る 2022 は, written in the purpose to achieve の た め に, ま ず "キ ノ コ son be body か ら symbiotic type ウ イ ル ス の many others in sex" を parsing し た. The research materials are ら the real body of the natural rat ら the isolation of the た strain を using ら た. 2022 annual は ア ガ ロ ー ス ゲ ル electric 気 swimming method (AGE) お よ び dsRNA シ ー ケ ン シ ン グ (FLDS) に よ り basidiomycete と チ ャ ワ ン タ ケ (a 嚢 fungi) の ウ イ ル ス ス ク リ ー ニ ン グ を be applied し た. Youdaoplaceholder0 そ results, basidiomycetes <s:1> 51 isolates うち, and 5 ウ ウ and <s:1> ス maintained strains と て検 て検 produced された. さ ら に, FLDS を with い て, ウ イ ル ス keep strains か ら five の 2 lock RNA (dsRNA) ウ イ ル ス, 1 kind of の プ ラ ス セ ン ス a lock RNA (+ ssRNA) ウ イ ル ス, お よ び one の プ ラ ス セ ン ス a lock RNA (ssRNA) ウ イ ル ス の new rules ゲ ノ ム match column を be し た. ま た, with さ れ た ウ イ ル ス の matched with the column intelligence を い て, specific プ ラ イ マ ー を design し て, long-term preservation の be body specimen か ら rt-pcr に よ り each ウ イ ル ス も 検 out で き た. Isolates and び son be body specimen か ら ウ イ ル ス を 検 out し た こ と で, written わ れ た は have sharper に ウ イ ル ス を explore で き る こ と を prove し た. さ ら に, written establish し た method で チ ャ ワ ン タ ケ 57 isolates (a 嚢 fungi) の か ら ウ イ ル ス ス ク リ ー ニ ン グ を be applied し た results, 13 strains は ウ イ ル ス を keep す る こ と が interpret し た. ま た, FLDS に よ り ウ イ ル ス match column を decided し, 検 で き た 11 の ウ イ ル ス の う ち, Mitovirus と Endornavirus は そ れ ぞ れ four で あ る こ と が わ か っ た. Now, each ウ and ウ ス ス is assigned a <s:1> characteristic と classification status を into んで and る る. Future は ウ イ ル ス 検 out し や す い strains に attention し て, environment に お け る ウ イ ル ス の function に into む designated で あ る.

项目成果

土壌環境における宿主とリンクした持続型RNAウイルスの研究基盤構築

建立与土壤环境中宿主相关的持久性 RNA 病毒的研究基础设施

• 发表时间: 2022
• 作者: 趙彦杰;浦山俊一;萩原大祐
• 通讯作者: 萩原大祐

野生キノコの分離株から新たに検出できたRNAマイコウイルスの同定について

从野生蘑菇分离物中鉴定新检测到的 RNA 真菌病毒

• 发表时间: 2022
• 作者: 勝浦哲夫;石橋彰吾;下村義弘;李スミン;趙彦杰・白水貴・千葉悠斗・保坂健太郎・森山裕充・裏山俊一・萩原大祐
• 通讯作者: 趙彦杰・白水貴・千葉悠斗・保坂健太郎・森山裕充・裏山俊一・萩原大祐