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共生型ウイルスの真の多様性をキノコで解く

利用蘑菇揭示共生病毒的真正多样性

基本信息

批准号：
22KJ0440
负责人：
趙彦杰
金额：
$ 2.83万
依托单位：
University of Tsukuba
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
财政年份：
2023
资助国家：
日本
起止时间：
2023-03-08 至 2025-03-31
项目状态：
未结题

来源：
https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-22KJ0440/
关键词：
マイコウイルスきのこ環境ウイルス

项目摘要

本研究では、自然界生態系における「宿主と共生するウイルス」の真の多様性を解明することを目的としている。実験計画初年度である2022年度は、上記目的達成のために、まず“キノコ子実体から共生型ウイルスの多様性”を解析した。研究材料は自然界の子実体から分離した菌株を用いた。2022年度はアガロースゲル電気泳動方法 (AGE)およびdsRNA シーケンシング (FLDS方法)により担子菌類とチャワンタケ (子嚢菌類)のウイルススクリーニングを実施した。その結果、担子菌類の51分離株のうち、5株はウイルス保持株として検出された。さらに、FLDS法を用いて、ウイルス保持株から5種の二本鎖RNA（dsRNA）ウイルス、1種のプラスセンス一本鎖RNA（+ssRNA）ウイルス、および1種のプラスセンス一本鎖RNA（-ssRNA）ウイルスの新規ゲノム配列を同定した。また、同定されたウイルスの配列情報を用いて、特異プライマーを設計して、長期保存の子実体標本からRT-PCRにより各ウイルスも検出できた。分離株及び子実体標本からウイルスを検出したことで、上記行われた方法は有効的にウイルスを探索できることを証明した。さらに、上記確立した方法でチャワンタケ (子嚢菌類)の57分離株からウイルススクリーニングを実施した結果、13株はウイルスを保持することが解明した。また、FLDS法によりウイルス配列を決定し、検出できた11種のウイルスのうち、MitovirusとEndornavirusはそれぞれ4種であることがわかった。現在は各ウイルス配列の特徴と分類地位を進んでいる。今後はウイルス検出しやすい菌種に注目して、環境中におけるウイルスの機能に進む予定である。

In this study, the aim of this study is to understand the purpose of this study. In the first year of the project, in the year 2022, the above records show that there are symbiosis, symbiosis, multiplicity and multiplicity. The research material "nature", "seed", "isolation", "strain" and "strain" were used. In the year 2022, the method of electrophoretic mobility (AGE), the method of electrophoretic mobility (AGE), the method of electrophoretic mobility (FLDS), the method of electrophoretic mobility (FLDS), the method of electrophoretic mobility (EAE), the method of electrophoretic exercise (FLDS), the method of electrophoretic mobility (EAE), the method of electrophoretic mobility (EAE), the method of electrophoretic mobility (EAE) and the method of electrophoretic mobility (FLDS) were used. The results showed that 51 strains of basidiomycetes were isolated and 5 strains of basidiomycetes were isolated. The original RNA (dsRNA) license, one RNA (+ ssRNA) license, and one RNA (- ssRNA) license were used in the RNA (- ssRNA) license of the same standard. For example, if you want to use your information, how to use it, how to design your RT-PCR for a long time, and how to save it for a long period of time. The separated plant and sub-body headers are listed in this document and recorded on the above line to find out that the method is available. The results of the test results and the results of the 13 strains were maintained in 57% of the total number of strains (fungus). In addition, the FLDS method has been used to determine the number of customers, to produce 11 kinds of brand names, and to produce four kinds of brand names, namely, Mitovirusses Endornavirus license, and so on. At present, the status of special classification has been assigned to each and every one of them. In the future, we will be able to pay attention to the number of bacteria and the environment will be able to achieve the desired results.