The three-dimensional structure of the bacterial ribosome; the transition to atomic revolution

细菌核糖体的三维结构；

• 批准号: 5224816
• 负责人: Richard Brimacombe, Ph.D.
• 金额: --
• 依托单位: Max-Planck-Institut für molekulare Genetik (MPIMG)
• 依托单位国家: 德国
• 项目类别: Research Grants
• 财政年份: 1999
• 资助国家: 德国
• 起止时间: 1998-12-31 至 2001-12-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://gepris.dfg.de/gepris/projekt/5224816?language=en
• 关键词: three; dimensional; structure; bacterial; ribosome

Untersuchungen des Ribosoms durch Röntgen-Kristallographie bzw. Kryo-Elektronen-Mikroskopie (EM) haben zu Strukturen mit einer Auflösung von 5-10 Å geführt. Allerdings wird die Aufklärung der atomaren Struktur eines Ribosoms - auch bei noch höherer Auflösung - keinesfalls durch diese Untersuchungen automatisch erfolgen; dafür ist die Komplexität des Ribosoms und die Vielfalt seiner Bestandteile einfach zu groß. Unsere Strategie bezüglich dieses Problems besteht darin, biochemisch abgeleitete 3D-Modelle für das Ribosom mit den EM-Rekonstruktionen zu kombinieren, um sie schrittweise der atomaren Struktur anzunähern. Auf diese Weise haben wir vor kurzem eine erstes vollständiges 3D-Modell für die gesamte rRNA (d.h. 5S, 16S und 23S rRNA) erstellt, das einer 13 Å EM-Rekonstruktion angepaßt wurde. In der nächsten Phase wird das Modell mit Hilfe der neueren (höher auflösenden) EM-Rekonstruktionen verfeinert. Die Anpassung der zur Verfügung stehenden atomaren Strukturen von einzelnen ribosomalen Komponenten wird ebenfalls verbessert, bzw. ergänzt. Unsere experimentellen Untersuchungen werden sich gezielt auf "Lücken" in den vorhandenen strukturellen Kenntnissen konzentrieren. Abbendum: Im Laufe des Jahres 2000 sind atomare Strukturen für die 30S ribosomale Untereinheit aus Thermus thermophilus bzw. die 50S Untereinheit aus Haloarcula marismortui veröffentlicht worden. Allerdings weisen diese Ribosomen - im Bergleich zu dem biochemisch am meisten untersuchten Ribosom aus Escherichi coli - wesentliche Unterschiede auf. in Neuantrag, der sich mit diesem Problem befaßt, wird zur Zeit vorbereitet.

用X射线晶体照相法研究核糖体Kryo-Elektronen-Mikroskopie（EM）haben zu Strukturen mit einer Auflösung von 5-10 geführt. Allerdings wird die Aufklärung der atomaren Struktur eines Ribosoms - auch bei noch höherer Auflösung - keinesfalls durch diese Untersuchungen automatisch erfolgen; dafür ist die Komplexität des Ribosoms und die Vielfalt seiner Bestandteile einfach zu groupy.目前存在的问题主要是，利用EM-结构模型建立了核糖体的生物化学三维模型，并将其与原子结构模型进行了比较。在此之前，我们已经建立了一个用于核糖体RNA（d.h.）的三维模型。5S、16 S和23 S rRNA），这是一个13碱基的重组体。在下一个阶段，我们将使用新的（更高的）电磁干扰装置。通过对核糖体组分的原子结构进行验证，可以获得更好的结果。ergänzt.我们的实验韦尔登使我们能够在“Lücken”上进行更深入的研究。Abbendum：In Laufe des Jahres 2000 sind atomare Strukturen für die 30S ribosomale Untereinescence aus Thermus thermophilus bzw. 50年代的海洋盐囊菌已经沃登。所有这些核糖体都是通过生物化学方法从土壤中检测到的，这是一种对大肠杆菌的了解。在Neuantrag，如果这个问题被解决，我们将在未来的时间里继续前进。