コムギと近縁種を用いたRNA編集の分子機構に関する研究

利用小麦及相关物种进行RNA编辑的分子机制研究

• 批准号: 05760009
• 负责人: 寺地 徹
• 金额: $ 0.58万
• 依托单位: Kyoto Sangyo University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
• 财政年份: 1993
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 1993 至 无数据
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-05760009/
• 关键词: ミトコンドリア; RNA編集; パンコムギ; coxII遺伝子; RT-PCR

本奨励研究では高等頭植物のミトコンドリアにおけるRNA編集という奇妙な現象について、その原因を分子レベルで明らかにすることを最終的な目標とする。そのため,遺伝志学知見の豊富なパンコムギとエギロプス属植物を実験材料に、in vivoにおけるRNA編集の実態の詳細な把握と、in vitroにおけるRNA編集系の再現の、いわゆるvivo/vitro両面からこの現象を究明すべく実験計画を立てた。しかしながら、前者に関しては後述するように一定の成果があがったものの、後者、特にRNA編集に関与する因子の探索については、時間的な制約から実験が大幅に遅れており、今後の課題として残っている。In vivoにおけるRNA編集の研究では、まずパンコムギからミトコンドリアを常法により単離してRNAをAGPC法により抽出した。次に幼植物から全RNAを同じ方法で抽出した。これらのRNAを鋳型として、ミトコンドリアのatpA-atp9、coxl両遺伝子領域を標的としてRT-PCRを行ったところ、いずれのRNA調製物からも期待されるcDNA増幅産物を得ることができた。このことは、比較的抽出が容易な、全RNAからミトコンドリアのRNA編集を解析する道が開けたことを意味しており、その後の実験系を確立する上で大きな意義があった。一方、このRT-PCRを主体とする分析手法では、RNA抽出物に僅かに混入するDNAが問題になること、しかもこれを完全に除くことが極めて困難なことが今回の研究によりわかった。従ってイントロンを含む遺伝子をRNA編集の分析対象とするのが望ましいと考え、計画時のatpA-atp9からcoxl遺伝子へ分析対象を変更した。また、非 環境下での塩基配列決定法を改良し、SSCPではなく塩基配列によりRNA編集の頻度を決めることが可能となったので、この手法により、パンコムギ、細胞質置換コムギのcoxl遺伝子のRNA編集の正確さを比較した(進行中)。

The purpose of this study is to study the characteristics of higher plants, such as the RNA editing set, the magic image, the cause molecule, the cause molecule, the most important object. You should know that there is a lot of information about the genus plants, such as material, in vivo, RNA, vivo/vitro, and so on. For the first time, the former will improve the results, the latter, the special RNA editing collection and the exploration of the factors, the system of time will greatly improve the performance of the system, and the future problem will be affected. In vivo RNA Editing set Research, Research, AGPC, AGPC, extraction. The whole RNA of the second juvenile plant is the same as that of the extraction method. In the sub-domain of RNA, coxl, RT-PCR, RNA, etc., we are looking forward to receiving the information from the cDNA. It is easy to pull out the data, it is easier to pull out the data, and the whole RNA file is available. If you want to open the computer, you will need to make sure that you need to make sure that you have a large number of messages on your computer. On the one hand, the main body of RT-PCR, the method of analysis, the RNA extract is only mixed with the problem of DNA, and the problem is completely removed. You need to know that the RNA editing set is not available for analysis, and that you are looking forward to the examination and planning of the time atpA-atp9 for coxl analysis. In the environment, the basic allocation method is improved, the SSCP system is based on the RNA editing set, and it is possible to determine the accuracy of the RNA editing set. It is possible to determine the accuracy of the RNA editing set (in progress).