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リボソーム蛋白質構造データの分子進化学的解析

核糖体蛋白质结构数据的分子进化分析

基本信息

批准号：
05780216
负责人：
橋本哲男
金额：
$ 0.51万
依托单位：
The Institute of Statistical Mathematics
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
财政年份：
1993
资助国家：
日本
起止时间：
1993 至无数据
项目状态：
已结题

来源：
https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-05780216/
关键词：
リボソーム蛋白質分子進化相同性解析アライメント

项目摘要

リボソーム蛋白質を対象とした分子進化学的解析の基礎資料を得ることを目的として研究を行なった。国際的な遺伝情報データベースに登録されている約1,000種のリボソーム蛋白質一次構造データの全てに対し、各種相同性解析のアルゴリズムを適用して、これらを大腸菌の54蛋白質に相同と考えられる54個のファミリー、および、大腸菌には相同なものが存在しないと考えられる45個のファミリー、にそれぞれ分類した。さらに、アミノ酸の物理化学的性質から推定される高次構造の類似度を指標として相同蛋白質同士の相似度マトリクスを構成し、これらをもとに全てのファミリーに関するアライメントを構築した。その結果、以下に示すことが明らかとなった。(1)三大生物群を通して存在が認められるファミリーが少なからざる数にのぼる、(2)多くのアライメントは、挿入、欠失、分子伸長等の変化を生じているものの、分子のN末端からC末端にかけてほぼ一対一対応のパターンを示す、しかし、分子内転座(大腸菌L7/L12相当)、二分子融合(L10相当)などの大きな変異も稀に見受けられる、(3)大幅な挿入、欠失、分子伸長などの変化は、三大生物群同士の間で見いだされる、逆に、同一群の中では、アミノ酸置換が主たる変異の要因となっている。一方、各ファミリーの中で、比較的データ数が多いものに関して、系統関係の推定、アミノ酸置換速度の推定などの分子系統学的解析を行ない、いくつかの新しい知見を得た。

The purpose of this study is to analyze the chemical properties of proteins and proteins, such as the chemical analysis of molecular chemistry. The international market has registered about 1000 kinds of protein in one time, and all kinds of proteins have been tested in the same way. The same kind of protein has been tested in 54 brands. In the same laboratory of large bacteria, there is an examination for the classification of 45 medical schools and medical schools. The physical and chemical properties of the same protein, the same protein and the same protein. The results are shown below to show that you are aware of the results. The main results are as follows: (1) in the three biota, there are three major biota: (1) the number of genes in the three biota, (2) the number of genes in the biota, the number of genes in the three biota, the number Bimolecular fusion (L10 is equivalent), (3) large molecular fusion (L10), molecular elongation (L10), molecular elongation (L10), biota (L10), bilayer fusion (L10). On the one hand, the number of variables in each group is much higher than that of the other, the presumption of system temperature, the presumption of acid speed, the analysis of molecular systematics, and the conclusion of new insights have been obtained.