分子進化学的解析に基づく抗マラリア薬剤の標的分子探索

基于分子进化分析的抗疟药物靶分子搜寻

• 批准号: 10166227
• 负责人: 橋本 哲男
• 金额: $ 0.58万
• 依托单位: The Institute of Statistical Mathematics
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (A)
• 财政年份: 1998
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 1998 至 无数据
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-10166227/
• 关键词: マラリア原虫; Plasmodium; Alveolata; Stramenopiles; 色素体; apicoplast; 真核生物; 葉緑体関連遺伝子

マラリア原虫Plasmodiumと宿主との間に存在する分子生物学的差異を明確化し、治療薬の開発や標的分子の解明のための基礎資料を提供することを目的として、分子進化学解析を中心とした研究を進めている。本年度は、Plasmodium falciparumのペプチド鎖伸長因子(EF-2),ヴァリン-及びイソロイシンtRNA合成酵素(ValRS,IleRS)、及び最近の小亜粒子リボソームRNA(SSU-rRNA)の解析からStramenopiles(褐藻や珪藻を含む分類群)への所属が示唆されている原虫Blastocystis hominisのEF-2,70kDa熱ショック蛋白質(hsp70),液胞型ATP邸e(v-ATPase)に関する遺伝子解析を実施しこれらのオリジナルデータを得た。EF-2,valRS,ileRS,hsp70,v-ATPaseについては、得られたオリジナルデータをデータベースから収集した他の真核生物、古細菌、真正細菌の全相同アミノ酸配列データとともにアライメントした。さらに、PlasomodiumやAlveolata(Plasmodiumを含む分類群)の他の生物種のデータが存在する他の分子種についても全データの収集・アライメントを行なった。これらをもとに、最尤法により真核生物全体の系統樹を推定した。さらに、個々の解析結果を総合評価することにより、真核生物内部の系統的位置関係を統計的視点から詳細に検討した。その結果、AlveolataがStramenopilesの姉妹群になるという可能性の高いことが明らかとなった。一方、上記分子種以外にもPlasmodium類及びToxoplasma gondii類で配列が明らかとなっているものについては、データベースサーチを定期的に行なってデータ収集とアライメントの作業を継続してきた。とくに、P.falciparum及びT.gondiiの色素体様オルガネラ(apicoplast)にコードされている分子種については、それら全てのアライメントを終了した。分子系統樹解析の結果、apicoplastは明らかに植物や藻類の色素体と同一の起源をもつと考えられた。また、核コードのものを含めapicoplast関連分子種に関する分子進化学的データ解析を将来網羅的に実施するための準備として、葉緑体関連遺伝子群の分子系統樹解析を行なった。

マ ラ リ ア parasite Plasmodium と host と の に exist between す る fraught を し difference of molecular biology, treatment 薬 の open 発 や target molecules の interpret の た め の based information is provided を す る こ と を purpose と し て analytical を center, molecular evolutionary と し を た research into め て い る. This year youdaoplaceholder2, Plasmodium Falciparum の ペ プ チ ド lock elongation factor (EF - 2), ヴ ァ リ ン - and び イ ソ ロ イ シ ン tRNA synthetase (ValRS IleRS), and a small 亜 び recently の particle リ ボ ソ ー ム RNA (SSU rRNA) の parsing か ら Stramenopiles (brown algae や stating algal を containing む taxa) が へ の belong to show business さ れ て い る parasite Blastocystis hominis の EF - 2 kDa heat シ ョ ッ ク protein (hsp70), liquid type cell ATP di e (v - ATPase) に masato す る posthumous son 伝 parsing を be applied し こ れ ら の オ リ ジ ナ ル デ ー タ を た. EF - 2, valRS ileRS, hsp70, v - ATPase に つ い て は, ら れ た オ リ ジ ナ ル デ ー タ を デ ー タ ベ ー ス か ら 収 set し た he の eukaryotic organisms, the archaea, bacteria の entire real same ア ミ ノ acid with column デ ー タ と と も に ア ラ イ メ ン ト し た. さ ら に, Plasomodium や Alveolata (Plasmodium を containing む taxa) の he の biological の デ ー タ が exist す る he の molecular に つ い て も full デ ー タ の 収 set, ア ラ イ メ ン ト を line な っ た. Youdaoplaceholder2 れらを とに, most eukaryotic によ によ, the entire <s:1> system tree of eukaryotes を, presumption of た. Analytical results を さ ら に, a 々 の 総 close review 価 す る こ と に よ り, the position of the eukaryotes internal の system, masato is を statistical point of view か ら detailed に beg し 検 た. そ の results, Alveolata が Stramenopiles の and sisters group に な る と い likely の う い こ と が Ming ら か と な っ た. Party, written molecular outside に も Plasmodium classes and び Toxoplasma gondii class で match column が Ming ら か と な っ て い る も の に つ い て は, デ ー タ ベ ー ス サ ー チ を regular line に な っ て デ ー タ 収 set と ア ラ イ メ ン ト の homework を 継 続 し て き た. と く に, P.f alciparum and び T.g ondii の chromatophore others オ ル ガ ネ ラ (apicoplast) に コ ー ド さ れ て い る molecules of に つ い て は, そ れ ら full て の ア ラ イ メ ン ト を end し た. Molecular phylogenetic tree parsing の results, apicoplast は Ming ら か に plants や algae の chromatophore と same origin を の も つ と exam え ら れ た. ま た, nuclear コ ー ド の も の を containing め apicoplast masato even molecules of に masato す る molecules into chemical デ ー タ parsing を future net に be applied す る た め の prepare と し て, chloroplast masato heritage 伝 subgroup の molecular phylogenetic tree line を な っ た.

项目成果

Hashimoto,T.et al.: "Secondary absence of mitochondria in Giardia lamblia and Trichomonas vaginalis revealed by valyl-tRNA synthetase phylogeny" Proc.Natl.Acad.Sci.USA. 95. 6860-6865 (1998)

Hashimoto,T.et al.：“缬氨酰-tRNA 合成酶系统发育揭示贾第鞭毛虫和阴道毛滴虫中线粒体的二次缺失”Proc.Natl.Acad.Sci.USA。