ミトコンドリアDNA塩基配列解析による日本沿岸におけるシロウリガイの新種分化の研究

利用线粒体 DNA 序列分析研究日本沿海白蜗牛新物种

基本信息

批准号：
05740519
负责人：
小島茂明
金额：
$ 0.45万
依托单位：
The University of Tokyo
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
财政年份：
1993
资助国家：
日本
起止时间：
1993 至 1994
项目状态：
已结题

来源：
https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-05740519/
关键词：
シロウリガイミトコンドリアDNA 塩基配列分子系統種分化

项目摘要

シロウリガイ類3種5集団の各10〜20個体について、ミトコンドリアDNAのCO1、12SrRNA各領域をPCR法により増幅し制御酵素断片長多型(RFLP)分析を行ったところ、相模湾のシロウリガイ(C.soyoae)に2つのハプロタイプがみられたのを除き、集団内変異は検出されなかった。次に、相模湾のシロウリガイ2タイプおよび記載済みの全ての日本産シロウリガイ6種(カイコウ、ノチール、テンリュウ、ナギナタ、エンセイ、スルガシロウリガイ)と沖縄トラフ伊平屋海嶺産のシロウリガイ各1〜5個体について、CO1およびCO3領域の塩基配列(各300塩基対)を決定した。CO1領域では、2種で1ヶ所のアミノ酸置換が生じていたのを除き全ての塩基置換は同義的なものであったのに対し、CO3領域では多くのアミノ酸置換がみられた。これらのデータおよび既知のムラサキガイのデータを用いて、シロウリガイ類の系統関係を解析したところ、奥谷ら(1993)の形態による分類大系とほぼ一致した。しかしいくつかの点で相違があり、今後形態の再検討を含めた吟味が必要である。相模湾産のシロウリガイの2つのタイプ間では、5%程度の塩基が置換しておりCO3領域では2ヶ所のアミノ酸の置換がみられた。これは種内変異としてはかなり大きく2つのタイプが別種である可能性もある。生殖的隔離の有無はミトコンドリアDNAからは判定できないので、アイソザイム分析などの核遺伝子の解析によって明らかにする必要がある。一方、伊平屋海嶺で採集されたシロウリガイは、相模湾産シロウリガイの片方のタイプと極めて相同性の高い配列を持つことが明らかになった。このことは10〜200万年前と推定されている沖縄トラフの熱水活動開始後、シロウリガイ(C.soyoae)の伊平屋海嶺への移入が起こり、その後が両者の間に遺伝的交流がないことを示唆する。

在三种麻风病的三种种群中的每一个中，在10至20个个体中，线粒体DNA的Co1和12sRRNA区域通过PCR扩增，并进行调节酶片段长度多态性（RFLP）分析。除了在萨加米湾的麻风病（大豆）中发现了两种单倍型外，未检测到肠内突变。接下来，确定两种类型的萨加米湾和六种日本鲑鱼鲑鱼（kaiko，notil，notil，tenryu，naginata，ensei，ensei和surugashira salmon salmon salmon salmon salmon salmon salmon salmon salmon salmon salmon salmon salmon salmon salmon salmon salmon salmon salmon salmon salmon salmon salmon salmon salmon salmon salmon salmon salmon salmon salmon salmon salmon salmon salmon salmon salmon salmon salmon salmon salmon salmon salmon salmon salmon salmon salmon salmon salmon salmon salmon salmon salmon salmon salmon salmon salmon salmon salmon鲑鱼鲑鱼三文鱼鲑鱼鲑鱼三文鱼鲑鱼鲑鱼鲑鱼三文鱼鲑鱼鲑鱼三文鱼鲑鱼鲑鱼三文鱼鲑鱼三文鱼鲑鱼鲑鱼鲑鱼鲑鱼鲑鱼鲑鱼鲑鱼鲑鱼鲑鱼鲑鱼鲑鱼鲑鲑鱼鲑鱼鲑鱼鲑鱼萨尔在二氧化碳区域中，所有碱基替代品都是同义词，除了两种类型的氨基酸替代品，而许多氨基酸替代品，许多氨基酸替代品都在该二氧二氧化碳中。使用这些数据和已知的麻雀sl，分析了sl的系统发育关系，根据Okutani等人的形态，它与分类系统几乎是一致的。（1993）。但是，几个方面存在差异，有必要检查将来的形式，包括对形式的重新审查。在两种类型的萨加米湾之间取代了大约5％的碱基，并且在CO3区域观察到了两个氨基酸取代。这是一个非常大的种内突变，两种类型的不同物种可能不同。无法通过线粒体DNA确定生殖隔离的存在或不存在，因此有必要通过分析核基因（例如同工酶分析）来阐明。同时，据透露，在Iheya Ridge收集的麻雀的麻雀具有与来自Sagami Bay的一种麻雀相同的序列。这表明，在冲绳槽中的水热活动开始后，估计为100,000至200万年前，将大豆C. c. c. iheya Ridge引入了，两者之间没有遗传交换。