Short Tandem Repeat領域の多型性を用いた古人骨のDNA解析

本研究の目的は、STR多型による古人骨DNAの解析を、複数の遺跡集団間における遺伝的系統関係を解明するための方法として確立することである。この方針に基づいて、以下の具体的手順により研究を実施した。1.古人骨への実用可能なSTR座位の選択古人骨集団の解析を行なうに先立って、既に現代日本人DNAから多型検出が可能であることを確認済みである30座位について、実際に古人骨サンプルを用いてその検出性(検出感度・再現性など)についての検討を行なった。その結果、古人骨由来の超微量かつ断片されたDNAにも実用可能と考えられた、基本単位2〜5塩基対のSTR10座位を選択した。2.古人骨集団におけるSTR多型の解析九州北部の3箇所の弥生遺跡(花浦・託田西分・志波屋六本松)より出土した古人骨サンプル(各30〜40個体)よりDNAを抽出し、上述のSTR10座位のそれぞれについて多型頻度を算出した。その頻度分布を現代日本人のもとの比較すると、3遺跡とも個々のアリル頻度に有意差のある座位はあったものの、頻度分布の分散そのものはほぼ共通であった。また3遺跡間の頻度分布を比較すると、1座位中4座位で花浦遺跡と託田西分及び志波屋六本松遺跡との間で出現頻度に有意差のあるアリルが存在した。この結果から花浦遺跡と託田西分及び志波屋六本松遺跡集団との間の系統に違いのある可能性が示唆された。今後被検サンプル数を増やし、更に周辺遺跡についての検討も加えることにより統計学的データを蓄積し、これらの古人骨集団間の系統関係について検討を進めていく計画である。

本研究の目的は、STR多型による古人骨DNAの解析を、複数の遺跡集団間における遺伝的系統関係を解明するための方法として確立することである。この方針に基づいて、以下の具体的手順により研究を実施した。1.古人骨への実用可能なSTR座位の選択古人骨集団の解析を行なうに先立って、既に現代日本人DNAから多型検出が可能であることを確認済みである30座位について、実際に古人骨サンプルを用いてその検出性(検出感度・再現性など)についての検討を行なった。その結果、古人骨由来の超微量かつ断片されたDNAにも実用可能と考えられた、基本単位2〜5塩基対のSTR10座位を選択した。2.古人骨集団におけるSTR多型の解析九州北部の3箇所の弥生遺跡(花浦・託田西分・志波屋六本松)より出土した古人骨サンプル(各30〜40個体)よりDNAを抽出し、上述のSTR10座位のそれぞれについて多型頻度を算出した。その頻度分布を現代日本人のもとの比較すると、3遺跡とも個々のアリル頻度に有意差のある座位はあったものの、頻度分布の分散そのものはほぼ共通であった。また3遺跡間の頻度分布を比較すると、1座位中4座位で花浦遺跡と託田西分及び志波屋六本松遺跡との間で出現頻度に有意差のあるアリルが存在した。この結果から花浦遺跡と託田西分及び志波屋六本松遺跡集団との間の系統に違いのある可能性が示唆された。今後被検サンプル数を増やし、更に周辺遺跡についての検討も加えることにより統計学的データを蓄積し、これらの古人骨集団間の系統関係について検討を進めていく計画である。