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蛍光ラベルPCRに基づくDNA画像解析の法医遺伝学的有用性についての検討

基于荧光标记 PCR 的 DNA 图像分析的法医遗传学实用性检验

基本信息

批准号：
05770294
负责人：
黒崎久仁彦
金额：
$ 0.58万
依托单位：
Chiba University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
财政年份：
1993
资助国家：
日本
起止时间：
1993 至 1994
项目状态：
已结题

来源：
https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-05770294/
关键词：
DNA多型 STR 集団遺伝学古人骨法医学

项目摘要

本研究の目的は、蛍光ラベルしたPCR産物をDNA画像解析システムにより解析する方法が、法医学的実務試料においてもSTR(Short Tandem Repeat)多型のタイビングに有用であることを実験的に検証することである。以下に本年度の研究実績の概要について示す。1)DNAシークエンサー及びDNA画像解析ソフトウェアを用い、すでに(コーカソイド集団において)多型性が報告されている20のSTR座位について、複数の現代日本人個体から抽出したDNAをテンプレートとして多型検出を試みたところ、いずれの座位においても容易にタイピングが可能であった。これらのSTR座位についてそれぞれ日本人集団の多型頻度を求めた。2)STR多型頻度分布を、現代日本人とコーカソイド集団との間で比較したところ、その分布はこれまでに知られているどの多型マーカーに比べても、概して著しく異なっており、その違い方は4つのパターンに分類することが可能であった。また座位によってはヘテロ接合度及びPICの値にも著しい差が生じている場合があった。このことは、STR多型の遺伝的情報量が人種など対象集団の違いにより異なることを示唆しており、法医学的応用にあたっては、日本人集団において実用可能なSTR領域及びその組み合わせを選択する必要があることが改めて確認された15EA04:3)年単位で様々な保存環境下におかれていた陳旧試料(骨・組織片毛髪など)からDNAを抽出し、STR多型のタイピングを行なったところ、高熱環境や水中にさらされていた試料を除いて、概ねアリルの検出は可能であった。更に、弥生時代の遺跡より出土した古人骨についてもタイピングは可能であり、このSTR多型を用いて初めて遺跡古人骨の親子鑑別に成功した。以上

The purpose of this study, the DNA image analysis method of the PCR product and the analysis method of the forensic medicine, the STR (Short Tandem) Repeat) The multi-type のタイビングに is useful であることを実験’s に検证することである. The following is an overview of this year's research achievements. 1)DNA image analysis tool and DNA image analysis toolコーカソイド集団において) polymorphism report されている20のSTR seat について, plural のmodern Japanese individual からdraw out したDNA をテンプレートとして polytype 検出みたところ、いずれのseat においてもeasy にタイピングがpossible であった.これらのSTR seat についてそれぞれ日本人集団の多式 Frequencyをquestめた. 2) STR polytype frequency distribution を, modern Japanese とコーカソイド集団との间で comparison したところ, その distribution はこれまでに知られているどの多式マーカーに比べても、性して之しく同なっており、そのviolationい方は4つのパターンにcategorizationすることがpossibleであった.またseatによってはヘテロjointness and びPICの値にも出しいdifferentが生じているoccasionがあった.このことは, STR polytype の缝's information amount がethnic など対肖集団のviolation いによりdifferent なることをshow 唆しており, forensic science 応用にあたっては, Japanese collection of において実possibleなSTR field and びそのgroupみ合わせを选択するrequisite があることがchangeめてconfirmされた1 5EA04:3) Extraction of DNA from aged specimens (bone and tissue slices hairy hair) under the same preservation environment, STR Multi-type のタイピングを行なったところ, high-heat environment and underwater にさらされていたsample をexcept いて, and ねアリルの検出はpossible であった. More information, it is possible to unearth ancient human bones from the ruins of the Yayoi period. The paternity identification of ancient human bones using the original STR polytype was successful. above