STR多型の型判定に悪影響を及ぼす因子に関する実験的研究

STR多态性分型不良影响因素的实验研究

• 批准号: 07770310
• 负责人: 黒崎 久仁彦
• 金额: $ 0.64万
• 依托单位: Chiba University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
• 财政年份: 1995
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 1995 至 无数据
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-07770310/
• 关键词: STR(Short Tandem Repeat)多型; PCR(Polymerase Chain Reaction)プライマー; PLA2; ポリアクリルアミドゲル; 塩基組成; 泳動度; 塩基欠失

本研究の目的は、STR多型の正確な型判定に悪影響を及ぼす因子について、その成因・出現傾向について検討することにより、STR多型を法医実務に応用するための基礎固めをすることにある。この方針に基づいて研究を行い、以下のような新しい知見を得た。1、PLA2座位におけるSTR近傍領域の3塩基欠失基本単位3塩基対のSTRを有するPLA2座位において、既にコーカソイド集団で報告されているPCRプライマーを用いて、日本人集団内におけるアリル頻度を算出した。また、この座位についてプライマーの位置を当初設定されたものより外側に再設定してPCRを行ったところ、当初ホモ接合と考えられた2個体について新しいアリルが出現し、これらが実はヘテロ接合の個体であることが明らかになった。この事象の成因について検討したところ、当初増幅されなかったアリルにおいては、設定されたプライマーの3'末端に一致する部位に3塩基の欠失があることが確認された。この結果、単一アリルしか検出されない場合でも、ホモ接合の個体とは限らないことを認識する必要性が示唆された。2、変性ポリアクリルアミドゲルにおける一本鎖DNAの泳動度と塩基組成との関係STR多型の検出において、同一アリルであるにもかかわらず、各相補鎖をそれぞれ別個に放射性標識し変性ポリアクリルアミドゲルで泳動すると、1〜3塩基相当の範囲で泳動度に"ずれ"が生じることが明らかになった。この"ずれ"と各相補鎖を構成する塩基成分との関係について検討したところ、各相補鎖におけるアデニン及びシトシン塩基の総数と泳動距離との間に正の相関関係が認められた。このような"ずれ"の存在は、標識される鎖の違いによりアリルを誤判定する可能性があることを示唆しており、STR多型を法医学的に応用する上で検出方法の統一及び詳細な記載の重要性を再認識させるものである。

The purpose of this study is to determine the impact of STR polymorphism on the correct type of STR and to determine the causes of STR polymorphism. This policy is based on research and implementation, and the following new knowledge is available. 1. The 3-base missing basic position of STR near the 3-base missing STR at PLA2 locus is calculated by PCR selection and frequency calculation in the Japanese locus. In addition, the position of the pull-up button in this seat was originally set and then set to the outside of the seat. PCR was performed. When the two seats were joined and tested, new and detached elements appeared. This is actually the case with the two seats joined together. The cause of the event is to be determined by the initial amplitude of the event, and by the initial amplitude of the event. The results of this study indicate the necessity of identifying individuals who are involved in the study. 2. The relationship between the mobility and the base composition of a single lock DNA and the relationship between STR polymorphism, the same lock, the complementary lock of each phase, and the radioactive identification of a different lock DNA. The relationship between the basic components of each phase and the total number of swimming distances of each phase is recognized. The existence of such "hidden patterns" and the possibility of false identification of such patterns are discussed. The importance of uniform and detailed documentation of such patterns in forensic medicine is re-recognized.