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集合系マシーナリーのモデル細胞としての高度好熱菌T.thermophilus

嗜热嗜热菌作为集体机器的模型细胞

基本信息

批准号：
11169224
负责人：
倉光成紀
金额：
$ 5.25万
依托单位：
Osaka University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (A)
财政年份：
1999
资助国家：
日本
起止时间：
1999 至 2000
项目状态：
已结题

来源：
https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-11169224/
关键词：
MutM MutY UvrA UvrB UvrC UvrD MutS MutL 高度好熱菌 Thermus thermophilus HB8 構造生物学構造ゲノム科学ゲノム解析 X線結晶解析 DNA修復系アミノ酸代謝系

项目摘要

高度好熱菌Thermus thermophilus HB8のゲノム解析をほぼ完了した(理化学研究所との共同研究)。その結果によれば,T.thermophilus HB8のゲノムサイズは2Mbpで,約2000個の遺伝子からなり,DNA修復に関与する酵素は約50種類存在することが明らかになった。これまでに,塩基除去修復系のMutM,MutY,EndoV,ヌクレオチド除去修復系のUvrA,UvrB,UvrC,UvrD,組換え修復系のRecA蛋白質,その他,DNA polymerase I,DNA ligase等についての,遺伝子のクローニング・蛋白質の量産化・精製・結晶化を行った。さらに,UvrB,MutM,photolyase,DNA polymerase Iについては,立体構造解析を行った。その中で,UvrA,UvrB,UvrCの他,ミスマッチ修復系のMutS,MutLは,集合系マシーナリーを形成していた。また,酸化傷害修復系のMutMとMutYは,酸化された塩基を修復するための基質特異性が相補し合っていることが示唆された。MutMについては立体構造解析を完了したので,その結果を基にして,酸化傷害DNA基質との反応機構を推定することができた。それを基にして,触媒基と考えられる2つのグルタミン酸やリジン残基を置換した変異型酵素を作製し,傷害DNAを含む基質との反応を解析した結果,より詳細な反応機構が明らかにすることができた。

The analysis of the highly thermophilic bacterium Thermus thermophilus HB8 has been completed (joint research by the Institute of Physical Chemistry). As a result,T.thermophilus HB8 has about 2000 genes and about 50 kinds of enzymes involved in DNA repair. This is the first step in the development of a new type of protein, including MutM,MutY,EndoV, UvrA,UvrB,UvrC,UvrD, RecA protein,DNA polymerase I,DNA ligase, etc.さらに,UvrB,MutM,photolyase,DNA polymerase Iについては,立体构造解析を行った。UvrA,UvrB,UvrC, MutS,MutL, set system MutM and MutY of the acidified damage repair system complement each other in the matrix specificity of acidified damage repair. MutM is the result of a complete analysis of the three-dimensional structure of DNA. Acidification damages the DNA matrix. 2. The enzyme activity of the enzyme was determined by enzyme analysis. The enzyme activity of the enzyme was determined by enzyme analysis.