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散在性反復配列(SINE)を指標とした哺乳類の目内,目間レベルでの系統関係の解析

散在性反復配列(SINE)を指標とした哺乳類の目内,目間レベルでの系統関係の解析
使用散布重复序列 (SINE) 作为指标分析哺乳动物目内部和之间的系统发育关系
批准号:
00J10229
负责人:
二階堂 雅人
金额:
$1.92万
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
财政年份:
2000
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2000 至 2002

项目摘要

项目成果

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本年度においては、ゾウ、ジュゴン、ハイラックス、キンモグラ、テンレツク、ツチブタ、ハネジネズミのゲノムに特異的に分布するSINE配列の単離に成功した。これらのグループは独立した6個の目を含んでおり、形態学的研究からはそれらの単系統性を示唆する様なデータは得られていない.しかし近年の分子系統学的解析からは、これらのグループが単系統群を形成する可能性も示唆されており、おそらく今から8000万年ほど前にゴンドワナ大陸から分離・孤立したアフリカ大陸において、1つの共通祖先から独立に進化を遂げた哺乳類群なのではないかと予想されていた。この新規SINEの発見はハイラックスゲノムの網羅的探索によってなされたものであり、その後にこのSINE配列を指標にしてPCRプライマーを設計し、他の哺乳類中におけるこのSINEの分布を確認した所、これらのグループに特異的に分布することかわかった。本研究は哺乳類の伝統的分類体系における大きな矛盾点を明らかにしたと共に、大陸移動と哺乳類の進化が密接に関与していることを示した重要なものであると考えている。この結果は現在Molecular Biology and Evolution誌において印刷中である。また本研究に附随してアフリカを起源とする哺乳類のミトコンドリア全長配列を用いた包括的系統解析をおこない、それらの単系統性に加えて、その内部系統に関しても詳細に解析した。その結果はGenes and Genetic System誌およびMdecular Phylogenetics and Evolution誌において現在印刷中である。
期刊论文(7)
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会议论文
Murata Y, Nikaido M, Sasaki T, Cao Y, Hasegawa M, Okada N: "Afrotherian Phylogeny as Inferred from Complete Mitochondrial Genomes."Molecular Phylogenetics and Evolution. (in press). (2003)
Murata Y、Nikaido M、Sasaki T、Cao Y、Hasekawa M、Okada N:“从完整线粒体基因组推断的非洲兽系统发育。”分子系统发育与进化。
DOI: --
发表时间:
期刊:
影响因子: --
作者: []
通讯作者:
Kawai K, Nikaido M, Harada M, Matsumura S, LinL, Wu Y, Hasegawa M, Okada N: "The status of the Japanese and East Asian Bats of the Genus Myotis (Vespertilionidae) in the world based on mitochondrial sequences"Molecular Phylogenetics and Evolution. (in pre
Kawai K、Nikaido M、Harada M、Matsumura S、LinL、Wu Y、Hasekawa M、Okada N:“基于线粒体序列的日本和东亚蝙蝠属蝙蝠(Vespertilionidae)在世界上的地位”分子系统发育
DOI: --
发表时间:
期刊:
影响因子: --
作者: []
通讯作者:
Nikaido M, Cao Y, Okada N, Hasegawa M: "The Phylogenetic Reladonships of Insectivores with special reference to the lesser hedgehog tenrec as Inferred from the Complete Sequence of their Mitochondria"Genes and Genetic System. 78. 107-112 (2003)
Nikaido M、Cao Y、Okada N、Hasekawa M:“食虫动物的系统发育关系,特别是从线粒体的完整序列推断出的小刺猬”基因和遗传系统。
DOI: --
发表时间:
期刊:
影响因子: --
作者: []
通讯作者:
Nikaido M, Nishihara H, Hukumoto Y, Okada N.: "Ancient SINEs from African Endemic Mammals"Molecular Biology and Evolution. (in press). (2003)
Nikaido M、Nishihara H、Hukumoto Y、Okada N.:“来自非洲特有哺乳动物的古代 SINE”分子生物学和进化。
DOI: --
发表时间:
期刊:
影响因子: --
作者: []
通讯作者:
7
    脊椎動物が共有する鋤鼻受容体ancV1Rを介したフェロモン受容機構とその適応的意義
    • 批准号:
      24K02074
    • 项目类别:
      Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
    • 资助金额:
      $11.15万
    • 财政年份:
      2024
    • 负责人:
      二階堂 雅人
    • 依托单位:
    Understanding the genetic mechanism of adaptive evolution and parallel evolution in East African cichlids
    • 批准号:
      20KK0167
    • 项目类别:
      Fund for the Promotion of Joint International Research (Fostering Joint International Research (B))
    • 资助金额:
      $10.73万
    • 财政年份:
      2020
    • 负责人:
      二階堂 雅人
    • 依托单位:
    Understanding the generation of biodiversity based on whole genome comparison
    • 批准号:
      18F18385
    • 项目类别:
      Grant-in-Aid for JSPS Fellows
    • 资助金额:
      $1.41万
    • 财政年份:
      2018
    • 负责人:
      二階堂 雅人
    • 依托单位:
    大量ゲノム情報を活用したDNA解析による哺乳類の進化多様性に関する研究
    • 批准号:
      03J01833
    • 项目类别:
      Grant-in-Aid for JSPS Fellows
    • 资助金额:
      $2.11万
    • 财政年份:
      2003
    • 负责人:
      二階堂 雅人
    • 依托单位:
    国内基金
    海外基金
    Double Sine-Gordon方程长时间动力学问题的数值方法研究
    • 批准号:
      2026JJ50109
    • 项目类别:
      省市级项目
    • 资助金额:
      --
    • 批准年份:
      2026
    • 负责人:
      宋怀玲
    • 依托单位:
    拟南芥KASH蛋白SINE3在减数分裂中的功能和分子机制研究
    • 批准号:
      32300296
    • 项目类别:
      青年科学基金项目
    • 资助金额:
      30万元
    • 批准年份:
      2023
    • 负责人:
      蔡博伟
    • 依托单位:
    SINE转座子插入FRZB基因增强子影响猪生长发育的作用机制研究
    • 批准号:
      --
    • 项目类别:
      青年科学基金项目
    • 资助金额:
      30万元
    • 批准年份:
      2022
    • 负责人:
      赵鹏举
    • 依托单位:
    Sine-MVT采样方法的能量性能影响因素与机理研究