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大量ゲノム情報を活用したDNA解析による哺乳類の進化多様性に関する研究

大量ゲノム情報を活用したDNA解析による哺乳類の進化多様性に関する研究
利用大量基因组信息,通过DNA分析研究哺乳动物的进化多样性
批准号:
03J01833
负责人:
二階堂 雅人
金额:
$2.11万
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
财政年份:
2003
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2003 至 2005

项目摘要

项目成果

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本年度は、鯨類の系統関係に関する2つの題目に絞って研究を進めた。まず1つはSINE挿入イベントに基づくヒゲクジラ類の包括的系統樹の構築。次に、歯クジラ類の単系統性の再検討である。ヒゲクジラ類は非常に有名で人類にも親しまれている哺乳類であるにも関わらず、その系統関係に関しては謎が多い。現在までにいくつかの核遺伝子配列、ミトコンドリア配列を用いた系統解析がなされてきたが、その詳細な系統関係は明らかになっていなかった。そこで私はレトロポゾンの1種であるSINEの挿入イベントを指標にして、これらのグループの系統推定をおこなった。その結果、ザトウクジラとナガスクジラの単系統性を始めとする多くの新しい系統学的な発見があった。さらには、ヒゲクジラ類が過去に非常に急速な放散を遂げていたことが明らかとなり、これらの内容をまとめて研究論文を執筆し、国際誌Molecular Biology and Evolution誌に掲載されることが決定した。また歯クジラ類の単系統性に関しては我々のグループが2001年に既に報告した経緯があるのだが、これまでに我々以外でDNAレベルで歯クジラ類の単系統性を示した研究結果は報告されておらず、さらには当時の我々の研究方法にも不十分な点があることが判明したことから、その不十分な点を補いながら再度、我々の系統仮説を再検討することとした。その結果、我々が2001年に発表した歯クジラ類の単系統仮説は矛盾なく支持されることがわかり、長い間議論され続けてきたこの論争にもようやく終止符打たれることになったのではないかと考えられる。この結果は現在、論文として国際誌Molecular Phylogenetics and Evolution誌に投稿中である。
期刊论文(12)
专著(0)
科研奖励(0)
会议论文
DOI: 10.1016/j.gene.2005.09.042
发表时间: 2006-01
期刊: Gene
影响因子: 3.5
作者: [M. Watanabe;M. Nikaido;T. Tsuda;H. Inoko;D. Mindell;K. Murata;N. Okada]
通讯作者: M. Watanabe;M. Nikaido;T. Tsuda;H. Inoko;D. Mindell;K. Murata;N. Okada
Kawai K, Nikaido M, Harada M, Matsumura S, Lin L, Wu Y, Hasegawa M, Okada N: "The status of the Japanese and East Asian Bats of the Genus Myotis(Vespertilionidae) in the world based on mitochondrial sequences."Mol.Phylogenet.Evol.. 28. 297-307 (2003)
Kawai K、Nikaido M、Harada M、Matsumura S、Lin L、Wu Y、Hasekawa M、Okada N:“基于线粒体序列的日本和东亚蝙蝠属蝙蝠在世界上的地位。”
DOI: --
发表时间:
期刊:
影响因子: --
作者: []
通讯作者:
Nikaido M, Cao Y, Okada N, Hasegawa M: "The Phylogenetic Relationships of Insectivores with special reference to the lesser hedgehog tenrec as Inferred from the Complete Sequence of their Mitochondrial genome."Genes Genet.Syst.. 78. 107-112 (2003)
Nikaido M、Cao Y、Okada N、Hasekawa M:“食虫动物的系统发育关系,特别是从线粒体基因组的完整序列中推断出的小刺猬。”Genes Genet.Syst.. 78. 107-112(
DOI: --
发表时间:
期刊:
影响因子: --
作者: []
通讯作者:
Okada N, Shedlock AM, Nikaido M: "Retroposon Mapping in Molecular Systematics in : P.Capy, ed. Mobile genetic elements : Protocols and Genomic applications."Humana Press. 189-226 (2004)
Okada N、Sherlock AM、Nikaido M:“分子系统学中的反座子作图:P.Capy 编辑。移动遗传元件:协议和基因组应用。”Humana Press。
DOI: --
发表时间:
期刊:
影响因子: --
作者: []
通讯作者:
9
    脊椎動物が共有する鋤鼻受容体ancV1Rを介したフェロモン受容機構とその適応的意義
    • 批准号:
      24K02074
    • 项目类别:
      Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
    • 资助金额:
      $11.15万
    • 财政年份:
      2024
    • 负责人:
      二階堂 雅人
    • 依托单位:
    Understanding the genetic mechanism of adaptive evolution and parallel evolution in East African cichlids
    • 批准号:
      20KK0167
    • 项目类别:
      Fund for the Promotion of Joint International Research (Fostering Joint International Research (B))
    • 资助金额:
      $10.73万
    • 财政年份:
      2020
    • 负责人:
      二階堂 雅人
    • 依托单位:
    Understanding the generation of biodiversity based on whole genome comparison
    • 批准号:
      18F18385
    • 项目类别:
      Grant-in-Aid for JSPS Fellows
    • 资助金额:
      $1.41万
    • 财政年份:
      2018
    • 负责人:
      二階堂 雅人
    • 依托单位:
    散在性反復配列(SINE)を指標とした哺乳類の目内,目間レベルでの系統関係の解析
    • 批准号:
      00J10229
    • 项目类别:
      Grant-in-Aid for JSPS Fellows
    • 资助金额:
      $1.92万
    • 财政年份:
      2000
    • 负责人:
      二階堂 雅人
    • 依托单位:
    海外基金