細菌細胞表層における体腔の高次空間構造と高分子輸送機構
細菌細胞表層における体腔の高次空間構造と高分子輸送機構
批准号:
12019237
负责人:
村田 幸作
金额:
$1.28万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (A)
财政年份:
2000
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2000 至 --
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細菌Sphingomonas sp.Alは、細胞表層に巨大な孔(体腔)を形成し、そこから高分子物質(多糖アルギン酸)を取り込む。この高分子物質取り込み機構を明らかにするため、取り込みに関わる全タンパク質とその遺伝子の構造と機能を解析した。その結果、細胞外に存在する高分子物質は、細胞表層の孔(体腔)に濃縮された後、ペリプラスム局在性の高分子物質結合タンパク質(Q1,Q2)に補足され、膜に配位された巨大な高分子透過装置[透過酵素(M1/M2)とABCタンパク質(S/S)]に渡される。高分子のまま細胞質内に取り込まれたアルギン酸は、細胞質に存在する3種類の高分子特異的リアーゼ(A1-I,-II,-III)と1種類の低分子糖特異的リアーゼ(OAL)で単糖にまで分解、資化される。この一連の高分子取り込み反応に関わるタンパク質と遺伝子の全てを分離し、その個々の機能を明らかにし、全体的な平面構造を解明した。次に、この取り込み装置の全体を立体的に把握するため、本研究ではQ1,Q2,及びSのX線結晶構造解析を行い、これらの3次元構造を決定した。Q2結晶は、斜方晶型で、空間群P2_12_12_1に属し、a=41.8Å,b=95.5Å,c=140.3Åであった。Q2と75%の相同性を持つQ1についても、ほぼ同様な結晶定数を決定した。Sは斜方晶型で、空間群P2_1に属し、a=57.4Å,b=92.7Å,c=65.8Åであった。6回膜貫通タンパク質であるM1,M2の構造決定は現在進行中である。Q1,Q2の性質を明らかにするため、その高分子結合実験を行い、これらが高分子アルギン酸と極めて強く結合(結合定数約10^<-7>M)することを明らかにした。これらの結果から、細菌には高分子物質を丸飲みする極めて巧妙な分子器官が発達していること、及び高分子物質を取り込む体腔依存の新規なABCトランスポーターの存在を確実にした。
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Wataru Hashimoto: "Biopolymers.Volume7 : Polysaccharides I"Editor, Alexander Steinbuchel ; Publisher, Wiley-VCH(印刷中). (2001)
Wataru Hashimoto:“Biopolymers.Volume7:多糖 I”编辑,Alexander Steinbuchel 出版社,Wiley-VCH(印刷中)。
DOI:
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发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
Keiko Momma: "A novel bacterial ATP-binding cassette (ABC) transporter system that allows uptake of macromolecules"Journal of Bacteriology. 182・14. 3998-4004 (2000)
Keiko Momma:“一种允许摄取大分子的新型细菌 ATP 结合盒 (ABC) 转运系统”,细菌学杂志 182・14 (2000)。
DOI:
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发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
Hye-Jin Yoon: "Crystallization and preliminary X-ray crystallographic analysis of alginate lyase A1-II from Sphingomonas species A1"Biochimica et Biophysica Acta. 1476・2. 382-385 (2000)
Hye-Jin Yoon:“来自鞘氨醇单胞菌 A1 的藻酸盐裂解酶 A1-II 的结晶和初步 X 射线晶体分析”Biochimica et Biophysicala Acta 1476·2 (2000)。
DOI:
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发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
Wataru Hashimoto: "Molecular identification of oligoalginate lyase of Sphingomonas sp.strain A1 as one of the enzymes required for complete depolymerization of alginate"Journal of Bacteriology. 182・16. 4572-4577 (2000)
Wataru Hashimoto:“作为藻酸盐完全解聚所需的酶之一的鞘氨醇单胞菌菌株 A1 的寡聚藻酸盐裂解酶的分子鉴定”Journal of Bacteriology 182・16(2000)。
DOI:
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发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
Hye-Jin Yoon: "Overexpression in Escherichia coli, purification, and characterization of Sphingomonas sp.A1 alginate lyases"Protein Expression and Purification. 19・1. 84-90 (2000)
Hye-Jin Yoon:“鞘氨醇单胞菌 A1 藻酸盐裂解酶在大肠杆菌中的过度表达、纯化和表征”蛋白质表达和纯化 19・1 (2000)。
DOI:
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发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
共 7 条
タンパク質の「揺らぎ」と機能発現における水分子の役割
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批准号:18031018
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$3.46万
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财政年份:2006
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负责人:村田 幸作
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依托单位:
体腔器官の分子移植による細菌の構造と機能の大規模改変とその応用
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批准号:18658033
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项目类别:Grant-in-Aid for Exploratory Research
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资助金额:$2.24万
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财政年份:2006
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负责人:村田 幸作
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依托单位:
酵母の形質転換(DNA輸送)機構の解明
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批准号:16658037
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项目类别:Grant-in-Aid for Exploratory Research
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资助金额:$2.3万
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财政年份:2004
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负责人:村田 幸作
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依托单位:
「小胞状構造体」の形成に関わる細菌細胞膜のダイナミクス
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批准号:16013221
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$2.62万
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财政年份:2004
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负责人:村田 幸作
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依托单位:
細菌の細胞膜流動による「小胞状構造体」の形成に関わる遺伝子ネットワークの解明
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批准号:15013228
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$2.37万
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财政年份:2003
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负责人:村田 幸作
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依托单位:
スフィンゴモナス属細菌を用いる環境浄化システム構築基盤
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批准号:13896002
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
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资助金额:$1.54万
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财政年份:2001
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负责人:村田 幸作
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依托单位:
DNA分子の戦略的生存システムの解析とその応用
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批准号:12876020
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项目类别:Grant-in-Aid for Exploratory Research
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资助金额:$1.22万
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财政年份:2000
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负责人:村田 幸作
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依托单位:
細菌細胞表層における体腔形成機構と体腔の高分子輸送機構
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批准号:11132237
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (A)
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资助金额:$1.28万
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财政年份:1999
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负责人:村田 幸作
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依托单位:
細菌細胞表層への体腔提示と体腔への高分子ターゲッティング機構
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批准号:10145229
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (A)
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资助金额:$1.15万
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财政年份:1998
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负责人:村田 幸作
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依托单位:
細菌細胞表層の動的構造-体腔形成と分子・情報輸送-
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批准号:09876026
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项目类别:Grant-in-Aid for Exploratory Research
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资助金额:$1.22万
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财政年份:1997
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负责人:村田 幸作
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依托单位:
細菌のC-P結合開裂酵素の活性発現および反応機構の解析とその応用
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批准号:01560122
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项目类别:Grant-in-Aid for General Scientific Research (C)
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资助金额:$0.96万
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财政年份:1989
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负责人:村田 幸作
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依托单位:
酵母細胞の増殖制御機構-解糖系バイパスの酵素活性制御機構と機能-
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批准号:61560120
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项目类别:Grant-in-Aid for General Scientific Research (C)
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资助金额:$0.83万
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财政年份:1986
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负责人:村田 幸作
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依托单位:
ケトアルデヒド耐性酵母の細胞膜透過性とそのアミノ酸・ペプチド生産への応用
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批准号:60560114
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项目类别:Grant-in-Aid for General Scientific Research (C)
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资助金额:$1.22万
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财政年份:1985
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负责人:村田 幸作
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依托单位:
新しい酵母の形質転換法の検討
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批准号:59760078
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项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
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资助金额:$0.64万
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财政年份:1984
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负责人:村田 幸作
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依托单位:
金属処理酵母を用いる形質転換‐その機構の解明と応用‐
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批准号:58760079
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项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
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资助金额:$0.7万
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财政年份:1983
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负责人:村田 幸作
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依托单位:
E.Coli B のグルタチオン高生産菌株の育種
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批准号:57760086
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项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
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资助金额:$0.51万
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财政年份:1982
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负责人:村田 幸作
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依托单位:
窒素遺伝子のクローニングとその活性発現
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批准号:56760065
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项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
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资助金额:$0.53万
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财政年份:1981
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负责人:村田 幸作
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依托单位: