細菌の細胞膜流動による「小胞状構造体」の形成に関わる遺伝子ネットワークの解明
細菌の細胞膜流動による「小胞状構造体」の形成に関わる遺伝子ネットワークの解明
批准号:
15013228
负责人:
村田 幸作
金额:
$2.37万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
财政年份:
2003
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2003 至 --
中文摘要
高分子物質アルギン酸を直接細胞質に取り込むグラム陰性(スフィンゴモナス属)細菌(A1株)において、細胞表層分子の流動再編成により形成される「体腔」の存在を明らかにした。「体腔」は、細胞膜が陥入して生じる小胞状構造体であり、グラム陽性細菌の「メソソーム」と類似していた。「体腔」は、細胞外のアルギン酸の存非に依存して開閉するアルギン酸濃縮器官である。そこで、「体腔」形成及び非形成細胞における発現タンパク質のディファレンシャル解析により、「体腔」形成に関わるタンパク質・遺伝子ネットワークの同定を試みた。アルギン酸存非でのA1株細胞について、細胞質、ペリプラズム、細胞内膜、及び細胞外膜に分画する方法を確立した。高分解能2次元電気泳動装置を用いて、細胞外膜画分において、アルギン酸で誘導されるタンパク質を8種類(P1〜P8)分離し、その遺伝子の同定、ホモロジー解析、並びに機能解析を行った。その結果、A1株は、アルギン醸顆粒結合タンパク質(P8)によりアルギン酸-鉄複合体を「体腔」に濃縮し、鉄トランスポーター(P1〜P4)によりアルギン酸-鉄複合体をペリプラズムに輸送することが示唆された。アルギン酸特異的に発現するフラジェリン(P5,P6)は、鞭毛形成よりも細胞表層構成タンパク質として外膜に局在し、アルギン酸結合能を示した。従って、これらフラジェリンもアルギン酸濃縮に関わっていることが考えられた。また、機能不明リポタンパク質(P7)は、「体腔」とペプチドグリカンとを架橋するタンパク質として機能することが想定された。以上のことから、アルギン酸特異的に発現する外膜タンパク質(P1〜P8)は、「体腔」形成、アルギン酸濃縮、及びアルギン酸輸送に関与している可能性が示された。枯草菌については、「メソソーム」形成条件を探索中であり、条件が決まり次第、A1株と同様のプロテオーム解析を行う予定である。
英文摘要
高分子物質アルギン酸を直接細胞質に取り込むグラム陰性(スフィンゴモナス属)細菌(A1株)において、細胞表層分子の流動再編成により形成される「体腔」の存在を明らかにした。「体腔」は、細胞膜が陥入して生じる小胞状構造体であり、グラム陽性細菌の「メソソーム」と類似していた。「体腔」は、細胞外のアルギン酸の存非に依存して開閉するアルギン酸濃縮器官である。そこで、「体腔」形成及び非形成細胞における発現タンパク質のディファレンシャル解析により、「体腔」形成に関わるタンパク質・遺伝子ネットワークの同定を試みた。アルギン酸存非でのA1株細胞について、細胞質、ペリプラズム、細胞内膜、及び細胞外膜に分画する方法を確立した。高分解能2次元電気泳動装置を用いて、細胞外膜画分において、アルギン酸で誘導されるタンパク質を8種類(P1〜P8)分離し、その遺伝子の同定、ホモロジー解析、並びに機能解析を行った。その結果、A1株は、アルギン醸顆粒結合タンパク質(P8)によりアルギン酸-鉄複合体を「体腔」に濃縮し、鉄トランスポーター(P1〜P4)によりアルギン酸-鉄複合体をペリプラズムに輸送することが示唆された。アルギン酸特異的に発現するフラジェリン(P5,P6)は、鞭毛形成よりも細胞表層構成タンパク質として外膜に局在し、アルギン酸結合能を示した。従って、これらフラジェリンもアルギン酸濃縮に関わっていることが考えられた。また、機能不明リポタンパク質(P7)は、「体腔」とペプチドグリカンとを架橋するタンパク質として機能することが想定された。以上のことから、アルギン酸特異的に発現する外膜タンパク質(P1〜P8)は、「体腔」形成、アルギン酸濃縮、及びアルギン酸輸送に関与している可能性が示された。枯草菌については、「メソソーム」形成条件を探索中であり、条件が決まり次第、A1株と同様のプロテオーム解析を行う予定である。
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Yumiko Mishima: "Crystal structure of AlgQ2,a macromolecule (alginate)-binding protein of Sphingomonas sp. A1, complexed with an alginate tetrasaccharide at 1.6-A resolution"Journal of Biological Chemistry. 278(8). 6552-6559 (2003)
Yumiko Mishima:“AlgQ2 的晶体结构,AlgQ2 是鞘氨醇单胞菌 A1 的一种大分子(藻酸盐)结合蛋白,以 1.6-A 分辨率与藻酸盐四糖复合”《生物化学杂志》。
DOI:
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发表时间:
期刊:
影响因子:
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作者:
[]
通讯作者:
Wataru Hashimoto: "Crystal structure of Bacillus sp. GL1 xanthan lyase, which acts on the side chains of xanthan"Journal of Biological Chemistry. 278(9). 7663-7673 (2003)
Wataru Hashimoto:“作用于黄原胶侧链的芽孢杆菌属 GL1 黄原胶裂解酶的晶体结构”生物化学杂志。
DOI:
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发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
Osamu Miyake: "An exotype alginate lyase in Sphingomonas sp. A1 : overexpression in Escherichiacoli, purification, and characterization of alginate lyase IV(A1-IV)"Protein Expression and Purification. 29(1). 33-41 (2003)
Osamu Miyake:“鞘氨醇单胞菌 A1 中的外型藻酸盐裂合酶:在大肠杆菌中过度表达、藻酸盐裂合酶 IV(A1-IV) 的纯化和表征”蛋白质表达和纯化。
DOI:
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发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
Masayuki Yamasaki: "Crystallization and preliminary X-ray analysis of alginate lyase, a member of polysaccharide lyase family PL-7, from Pseudomonas aeruginosa"Acta Crystallographica setion D. 59. 1499-1501 (2003)
Masayuki Yamasaki:“来自铜绿假单胞菌的藻酸盐裂解酶(多糖裂解酶家族 PL-7 的成员)的结晶和初步 X 射线分析”Acta Crystallographa 第 D. 59. 1499-1501 (2003)
DOI:
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发表时间:
期刊:
影响因子:
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作者:
[]
通讯作者:
Osamu Miyake: "Origin and diversity of bacterial alginate lyases of families PL-5 and -7 in Sphingomonas sp. strain A1"Journal of Bacteriology. (印刷中). (2004)
Osamu Miyake:“鞘氨醇单胞菌菌株 A1 中 PL-5 和 -7 家族的细菌藻酸盐裂解酶的起源和多样性”细菌学杂志(2004 年出版)。
DOI:
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发表时间:
期刊:
影响因子:
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作者:
[]
通讯作者:
共 6 条
タンパク質の「揺らぎ」と機能発現における水分子の役割
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批准号:18031018
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$3.46万
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财政年份:2006
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负责人:村田 幸作
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依托单位:
体腔器官の分子移植による細菌の構造と機能の大規模改変とその応用
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批准号:18658033
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项目类别:Grant-in-Aid for Exploratory Research
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资助金额:$2.24万
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财政年份:2006
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负责人:村田 幸作
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依托单位:
酵母の形質転換(DNA輸送)機構の解明
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批准号:16658037
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项目类别:Grant-in-Aid for Exploratory Research
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资助金额:$2.3万
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财政年份:2004
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负责人:村田 幸作
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依托单位:
「小胞状構造体」の形成に関わる細菌細胞膜のダイナミクス
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批准号:16013221
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$2.62万
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财政年份:2004
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负责人:村田 幸作
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依托单位:
スフィンゴモナス属細菌を用いる環境浄化システム構築基盤
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批准号:13896002
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
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资助金额:$1.54万
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财政年份:2001
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负责人:村田 幸作
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依托单位:
DNA分子の戦略的生存システムの解析とその応用
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批准号:12876020
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项目类别:Grant-in-Aid for Exploratory Research
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资助金额:$1.22万
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财政年份:2000
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负责人:村田 幸作
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依托单位:
細菌細胞表層における体腔の高次空間構造と高分子輸送機構
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批准号:12019237
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (A)
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资助金额:$1.28万
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财政年份:2000
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负责人:村田 幸作
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依托单位:
細菌細胞表層における体腔形成機構と体腔の高分子輸送機構
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批准号:11132237
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (A)
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资助金额:$1.28万
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财政年份:1999
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负责人:村田 幸作
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依托单位:
細菌細胞表層への体腔提示と体腔への高分子ターゲッティング機構
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批准号:10145229
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (A)
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资助金额:$1.15万
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财政年份:1998
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负责人:村田 幸作
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依托单位:
細菌細胞表層の動的構造-体腔形成と分子・情報輸送-
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批准号:09876026
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项目类别:Grant-in-Aid for Exploratory Research
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资助金额:$1.22万
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财政年份:1997
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负责人:村田 幸作
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依托单位:
細菌のC-P結合開裂酵素の活性発現および反応機構の解析とその応用
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批准号:01560122
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项目类别:Grant-in-Aid for General Scientific Research (C)
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资助金额:$0.96万
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财政年份:1989
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负责人:村田 幸作
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依托单位:
酵母細胞の増殖制御機構-解糖系バイパスの酵素活性制御機構と機能-
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批准号:61560120
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项目类别:Grant-in-Aid for General Scientific Research (C)
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资助金额:$0.83万
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财政年份:1986
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负责人:村田 幸作
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依托单位:
ケトアルデヒド耐性酵母の細胞膜透過性とそのアミノ酸・ペプチド生産への応用
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批准号:60560114
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项目类别:Grant-in-Aid for General Scientific Research (C)
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资助金额:$1.22万
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财政年份:1985
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负责人:村田 幸作
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依托单位:
新しい酵母の形質転換法の検討
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批准号:59760078
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项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
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资助金额:$0.64万
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财政年份:1984
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负责人:村田 幸作
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依托单位:
金属処理酵母を用いる形質転換‐その機構の解明と応用‐
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批准号:58760079
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项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
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资助金额:$0.7万
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财政年份:1983
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负责人:村田 幸作
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依托单位:
E.Coli B のグルタチオン高生産菌株の育種
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批准号:57760086
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项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
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资助金额:$0.51万
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财政年份:1982
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负责人:村田 幸作
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依托单位:
窒素遺伝子のクローニングとその活性発現
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批准号:56760065
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项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
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资助金额:$0.53万
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财政年份:1981
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负责人:村田 幸作
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依托单位:
国内基金
海外基金
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抗霉枯草菌素Mycosubtilin胁迫下橡胶树炭疽菌(Colletotrichum fructicola)过量合成黑色素的机制及新型抑菌机理研究
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批准号:--
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项目类别:地区科学基金项目
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资助金额:33万元
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批准年份:2022
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负责人:靳鹏飞
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依托单位:
抗霉枯草菌素触发植物诱导性系统抗性的作用受体及机制研究
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批准号:32160074
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项目类别:地区科学基金项目
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资助金额:35万元
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批准年份:2021
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负责人:赵惠新
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依托单位:
电压门控钾离子通道介导依枯草菌素A的抗真菌分子机制
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批准号:32072324
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项目类别:面上项目
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资助金额:58.0万元
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批准年份:2020
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负责人:蒋春美
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依托单位:
依枯草菌素识别、结合抗真菌作用靶点的关键结构及其作用机制
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批准号:31701722
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项目类别:青年科学基金项目
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资助金额:23.0万元
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批准年份:2017
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负责人:蒋春美
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依托单位: