細菌の細胞膜流動による「小胞状構造体」の形成に関わる遺伝子ネットワークの解明
阐明细菌细胞膜流形成“囊泡结构”所涉及的基因网络
基本信息
- 批准号:15013228
- 负责人:
- 金额:$ 2.37万
- 依托单位:
- 依托单位国家:日本
- 项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
- 财政年份:2003
- 资助国家:日本
- 起止时间:2003 至 无数据
- 项目状态:已结题
- 来源:
- 关键词:
项目摘要
高分子物質アルギン酸を直接細胞質に取り込むグラム陰性(スフィンゴモナス属)細菌(A1株)において、細胞表層分子の流動再編成により形成される「体腔」の存在を明らかにした。「体腔」は、細胞膜が陥入して生じる小胞状構造体であり、グラム陽性細菌の「メソソーム」と類似していた。「体腔」は、細胞外のアルギン酸の存非に依存して開閉するアルギン酸濃縮器官である。そこで、「体腔」形成及び非形成細胞における発現タンパク質のディファレンシャル解析により、「体腔」形成に関わるタンパク質・遺伝子ネットワークの同定を試みた。アルギン酸存非でのA1株細胞について、細胞質、ペリプラズム、細胞内膜、及び細胞外膜に分画する方法を確立した。高分解能2次元電気泳動装置を用いて、細胞外膜画分において、アルギン酸で誘導されるタンパク質を8種類(P1〜P8)分離し、その遺伝子の同定、ホモロジー解析、並びに機能解析を行った。その結果、A1株は、アルギン醸顆粒結合タンパク質(P8)によりアルギン酸-鉄複合体を「体腔」に濃縮し、鉄トランスポーター(P1〜P4)によりアルギン酸-鉄複合体をペリプラズムに輸送することが示唆された。アルギン酸特異的に発現するフラジェリン(P5,P6)は、鞭毛形成よりも細胞表層構成タンパク質として外膜に局在し、アルギン酸結合能を示した。従って、これらフラジェリンもアルギン酸濃縮に関わっていることが考えられた。また、機能不明リポタンパク質(P7)は、「体腔」とペプチドグリカンとを架橋するタンパク質として機能することが想定された。以上のことから、アルギン酸特異的に発現する外膜タンパク質(P1〜P8)は、「体腔」形成、アルギン酸濃縮、及びアルギン酸輸送に関与している可能性が示された。枯草菌については、「メソソーム」形成条件を探索中であり、条件が決まり次第、A1株と同様のプロテオーム解析を行う予定である。
The presence of a "coelom" in the form of a cell surface molecule flowing and reorganizing in bacteria (strain A1) is clearly indicated by the presence of a polymer substance, such as acid, directly in the cytoplasm. "Body cavity", cell membrane into the formation of small cellular structures, such as "good" and "good" bacteria. "Body cavity" refers to the existence of extracellular acid, which is independent of the opening and closing of intracellular acid concentration organs. In addition, it is necessary to analyze the relationship between "body cavity" formation and "non-body cavity" formation, and try to determine the identity of "body cavity" formation. A method was established to separate the cytoplasm, cytoplasm, membrane, inner cell membrane, and outer cell membrane of A1 cell line in which alkaline phosphatase is present. High resolution energy 2-D electrokinetic device application, cell outer membrane characterization, acid induction, separation of eight species (P1 ~ P8), identification of all species, molecular analysis, and functional analysis. As a result, strain A1 and strain A2 were able to bind to the protein (P8), which was able to concentrate and transport the iron acid-iron complex into the body cavity (P1 ~ P4). The acid binding activity of the cell surface layer was demonstrated by the expression of P5,P6 and the formation of flagella. The first step is to reduce the concentration of acid in the medium and reduce the concentration of acid in the medium. The function is unknown, the quality is unknown (P7), the body cavity is unknown, the quality is unknown, and the function is unknown. The above results indicate the possibility of the formation of "body cavity", the concentration of alpha-acid, and the transport of alpha-acid in the outer membrane (P1 ~ P8). The conditions for the formation of Bacillus subtilis are explored, and the conditions for the formation of Bacillus subtilis are determined. The analysis of A1 strain and the same species is determined.
项目成果
期刊论文数量(12)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Yumiko Mishima: "Crystal structure of AlgQ2,a macromolecule (alginate)-binding protein of Sphingomonas sp. A1, complexed with an alginate tetrasaccharide at 1.6-A resolution"Journal of Biological Chemistry. 278(8). 6552-6559 (2003)
Yumiko Mishima:“AlgQ2 的晶体结构,AlgQ2 是鞘氨醇单胞菌 A1 的一种大分子(藻酸盐)结合蛋白,以 1.6-A 分辨率与藻酸盐四糖复合”《生物化学杂志》。
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- 通讯作者:
Wataru Hashimoto: "Crystal structure of Bacillus sp. GL1 xanthan lyase, which acts on the side chains of xanthan"Journal of Biological Chemistry. 278(9). 7663-7673 (2003)
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- 发表时间:
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
- 通讯作者:
Osamu Miyake: "An exotype alginate lyase in Sphingomonas sp. A1 : overexpression in Escherichiacoli, purification, and characterization of alginate lyase IV(A1-IV)"Protein Expression and Purification. 29(1). 33-41 (2003)
Osamu Miyake:“鞘氨醇单胞菌 A1 中的外型藻酸盐裂合酶:在大肠杆菌中过度表达、藻酸盐裂合酶 IV(A1-IV) 的纯化和表征”蛋白质表达和纯化。
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- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
- 通讯作者:
Masayuki Yamasaki: "Crystallization and preliminary X-ray analysis of alginate lyase, a member of polysaccharide lyase family PL-7, from Pseudomonas aeruginosa"Acta Crystallographica setion D. 59. 1499-1501 (2003)
Masayuki Yamasaki:“来自铜绿假单胞菌的藻酸盐裂解酶(多糖裂解酶家族 PL-7 的成员)的结晶和初步 X 射线分析”Acta Crystallographa 第 D. 59. 1499-1501 (2003)
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- 作者:
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Osamu Miyake: "Origin and diversity of bacterial alginate lyases of families PL-5 and -7 in Sphingomonas sp. strain A1"Journal of Bacteriology. (印刷中). (2004)
Osamu Miyake:“鞘氨醇单胞菌菌株 A1 中 PL-5 和 -7 家族的细菌藻酸盐裂解酶的起源和多样性”细菌学杂志(2004 年出版)。
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