体腔器官の分子移植による細菌の構造と機能の大規模改変とその応用
体腔器官の分子移植による細菌の構造と機能の大規模改変とその応用
批准号:
18658033
负责人:
村田 幸作
金额:
$2.24万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Exploratory Research
财政年份:
2006
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2006 至 2007
中文摘要
細菌細胞表層は、微細な構造と機能を除いて構造的・機能的に均一かつ固定的と想定される。しかし、Sphingomonas属細菌においては、細胞表層分子の再編によって細胞表層に巨大な孔「体腔」が形成されることを見出し、微生物の形態形成と細胞表層の構造と機能に関して新たな局面を拓いた。この開閉自在の体腔は、メソソームやエンドサイトーシスの形成と機能、更にはそれらの分子進化の理解にも関わる重要な内容を有している。また、本申請研究では、体腔を他の細菌に分子移植する、つまり器官の移植による大規模な細胞改変技術の確立を目指した。その結果、体腔は同じ属の細菌には効率よく分子移植できることを明らかにした。移植された細胞では巨大な体腔が形成され、アルギン酸、ダイオキシン、ポリプロピレングリコール、ポリデキストロースなど、分子サイズと分子構造を問わず体腔から丸呑みされ、細胞内で効率よく分解されることを明らかにした。環境有害物質の分解は、基本的には強い分解能を有する微生物の選択に依拠しているが、環境有害物質の分子サイズや溶・不溶的多様性に十分対応するものではない。しかし、分子移植した体腔は、低分子物質から不溶性顆粒をも含めた巨大物質を呑み込む能力を有することから、体腔の分子移植によって創成される細菌は、バイオレメディエーションの画期的な発展を促す可能性を示唆した。特に、ダイオキシン分解能を有するSphingomonas wittichii RW1に体腔を移植することにより、ダイオキシンを格段に強く分解する菌株を育種された。ただ、体腔の移植は現段階ではSphingomonas属細菌に限定されるが、新たにAgrobacterium属細菌にも分子移植できる可能性を明確にした。これにより、全ての細菌に体腔を分子育種する基本的条件の設定に目途が付いた。
英文摘要
細菌細胞表層は、微細な構造と機能を除いて構造的・機能的に均一かつ固定的と想定される。しかし、Sphingomonas属細菌においては、細胞表層分子の再編によって細胞表層に巨大な孔「体腔」が形成されることを見出し、微生物の形態形成と細胞表層の構造と機能に関して新たな局面を拓いた。この開閉自在の体腔は、メソソームやエンドサイトーシスの形成と機能、更にはそれらの分子進化の理解にも関わる重要な内容を有している。また、本申請研究では、体腔を他の細菌に分子移植する、つまり器官の移植による大規模な細胞改変技術の確立を目指した。その結果、体腔は同じ属の細菌には効率よく分子移植できることを明らかにした。移植された細胞では巨大な体腔が形成され、アルギン酸、ダイオキシン、ポリプロピレングリコール、ポリデキストロースなど、分子サイズと分子構造を問わず体腔から丸呑みされ、細胞内で効率よく分解されることを明らかにした。環境有害物質の分解は、基本的には強い分解能を有する微生物の選択に依拠しているが、環境有害物質の分子サイズや溶・不溶的多様性に十分対応するものではない。しかし、分子移植した体腔は、低分子物質から不溶性顆粒をも含めた巨大物質を呑み込む能力を有することから、体腔の分子移植によって創成される細菌は、バイオレメディエーションの画期的な発展を促す可能性を示唆した。特に、ダイオキシン分解能を有するSphingomonas wittichii RW1に体腔を移植することにより、ダイオキシンを格段に強く分解する菌株を育種された。ただ、体腔の移植は現段階ではSphingomonas属細菌に限定されるが、新たにAgrobacterium属細菌にも分子移植できる可能性を明確にした。これにより、全ての細菌に体腔を分子育種する基本的条件の設定に目途が付いた。
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DOI:
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发表时间:
2007-12
期刊:
International microbiology : the official journal of the Spanish Society for Microbiology
影响因子:
--
作者:
[W. Hashimoto;T. Itoh;Y. Maruyama;B. Mikami;K. Murata]
通讯作者:
W. Hashimoto;T. Itoh;Y. Maruyama;B. Mikami;K. Murata
微生物を創る -口を持ったスーパー細菌-
创造微生物——用嘴创造超级细菌——
DOI:
--
发表时间:
2006
期刊:
バイオニクス 4月号
影响因子:
--
作者:
[Nakano, R., Y. Ishikawa, S. Tatsuki, A. Surlykke, N. Skals and T. Takanashi, 中野・石川・田付・Skals・Surlykke・高梨, Kousaku Murata, Yukie Maruyama, Zhongli Cui, Akihito Ochiai, Yukie Maruyama, Wataru Hashimoto, 橋本 渉, Yuji Aso, Akihito Ochiai, 麻生祐司, 宮本裕希子]
通讯作者:
宮本裕希子
DOI:
10.1038/nbt1181
发表时间:
2006-02-01
期刊:
NATURE BIOTECHNOLOGY
影响因子:
46.9
作者:
[Aso, Y, Miyamoto, Y, Murata, K]
通讯作者:
Murata, K
サルモネラ菌由来機能不明タンパク質YihSの構造・機能解析:ポスト構造ゲノミクスに向けて
YihS(一种源自肠沙门氏菌的功能未知的蛋白质)的结构和功能分析:迈向后结构基因组学
DOI:
--
发表时间:
2008
期刊:
影响因子:
--
作者:
[Takafumi, Itoh, Wataru, Hashimoto, Bunzo, Mikami, Kousaku, Murata, Takafumi Itoh, Takafumi Itoh, Takafumi Itoh, Akihito Ochiai, Takafumi Itoh, 伊藤貴文]
通讯作者:
伊藤貴文
A structural factor responsible for substrate recognition by Bacillus sp. GLl xanthanlyase that acts specifically on pyruvated side chains of xanthan
负责芽孢杆菌属底物识别的结构因子。
DOI:
--
发表时间:
2007
期刊:
Biochemistry 46
影响因子:
--
作者:
[Yukie, Maruyama, Bunzo, Mikami, Wataru, Hashimoto, Kousaku, Murata, Zhongli Cui, Akihito Ochiai, Akihito Ochiai, Yukie Maruyama]
通讯作者:
Yukie Maruyama
共 22 条
タンパク質の「揺らぎ」と機能発現における水分子の役割
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批准号:18031018
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$3.46万
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财政年份:2006
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负责人:村田 幸作
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依托单位:
酵母の形質転換(DNA輸送)機構の解明
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批准号:16658037
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项目类别:Grant-in-Aid for Exploratory Research
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资助金额:$2.3万
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财政年份:2004
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负责人:村田 幸作
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依托单位:
「小胞状構造体」の形成に関わる細菌細胞膜のダイナミクス
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批准号:16013221
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$2.62万
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财政年份:2004
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负责人:村田 幸作
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依托单位:
細菌の細胞膜流動による「小胞状構造体」の形成に関わる遺伝子ネットワークの解明
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批准号:15013228
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$2.37万
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财政年份:2003
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负责人:村田 幸作
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依托单位:
スフィンゴモナス属細菌を用いる環境浄化システム構築基盤
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批准号:13896002
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
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资助金额:$1.54万
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财政年份:2001
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负责人:村田 幸作
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依托单位:
DNA分子の戦略的生存システムの解析とその応用
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批准号:12876020
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项目类别:Grant-in-Aid for Exploratory Research
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资助金额:$1.22万
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财政年份:2000
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负责人:村田 幸作
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依托单位:
細菌細胞表層における体腔の高次空間構造と高分子輸送機構
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批准号:12019237
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (A)
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资助金额:$1.28万
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财政年份:2000
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负责人:村田 幸作
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依托单位:
細菌細胞表層における体腔形成機構と体腔の高分子輸送機構
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批准号:11132237
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (A)
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资助金额:$1.28万
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财政年份:1999
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负责人:村田 幸作
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依托单位:
細菌細胞表層への体腔提示と体腔への高分子ターゲッティング機構
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批准号:10145229
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (A)
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资助金额:$1.15万
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财政年份:1998
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负责人:村田 幸作
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依托单位:
細菌細胞表層の動的構造-体腔形成と分子・情報輸送-
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批准号:09876026
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项目类别:Grant-in-Aid for Exploratory Research
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资助金额:$1.22万
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财政年份:1997
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负责人:村田 幸作
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依托单位:
細菌のC-P結合開裂酵素の活性発現および反応機構の解析とその応用
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批准号:01560122
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项目类别:Grant-in-Aid for General Scientific Research (C)
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资助金额:$0.96万
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财政年份:1989
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负责人:村田 幸作
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依托单位:
酵母細胞の増殖制御機構-解糖系バイパスの酵素活性制御機構と機能-
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批准号:61560120
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项目类别:Grant-in-Aid for General Scientific Research (C)
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资助金额:$0.83万
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财政年份:1986
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负责人:村田 幸作
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依托单位:
ケトアルデヒド耐性酵母の細胞膜透過性とそのアミノ酸・ペプチド生産への応用
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批准号:60560114
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项目类别:Grant-in-Aid for General Scientific Research (C)
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资助金额:$1.22万
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财政年份:1985
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负责人:村田 幸作
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依托单位:
新しい酵母の形質転換法の検討
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批准号:59760078
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项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
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资助金额:$0.64万
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财政年份:1984
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负责人:村田 幸作
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依托单位:
金属処理酵母を用いる形質転換‐その機構の解明と応用‐
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批准号:58760079
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项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
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资助金额:$0.7万
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财政年份:1983
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负责人:村田 幸作
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依托单位:
E.Coli B のグルタチオン高生産菌株の育種
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批准号:57760086
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项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
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资助金额:$0.51万
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财政年份:1982
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负责人:村田 幸作
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依托单位:
窒素遺伝子のクローニングとその活性発現
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批准号:56760065
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项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
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资助金额:$0.53万
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财政年份:1981
-
负责人:村田 幸作
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依托单位: