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「小胞状構造体」の形成に関わる細菌細胞膜のダイナミクス

「小胞状構造体」の形成に関わる細菌細胞膜のダイナミクス
参与“囊泡结构”形成的细菌细胞膜动力学
批准号:
16013221
负责人:
村田 幸作
金额:
$2.62万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
财政年份:
2004
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2004 至 --

项目摘要

项目成果

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高分子物質アルギン酸を直接細胞質に取り込むグラム陰性(スフィンゴモナス属)細菌(A1株)において、細胞表層分子の流動再編成により生じるアルギン酸濃縮器官(体腔)の形成機構を、分子レベルで解析した。プロテオーム解析により、体腔の形成と機能に関わる候補タンパク質として、8種類の細胞表層をタンパク質[p1-p4,シデロフォア依存的鉄トランスポーター;p5-p6,フラジェリン;P7,機能不明リポタンパク質;p8,顆粒結合タンパク質(ホモロジー解析による推定)]を見出した。そこで、p5,p6,p8の機能解析を進めた。p6或いはp8遺伝子破壊株はアルギン酸最少培地において、野生株と比較して有意な生育遅延を示した。また、p6遺伝子破壊株は、野生株と比較して、細胞表層において不鮮明な襞構造と不完全な体腔を示した。抗p5抗体を用いた免疫電顕により、P5は細胞表層に点在することが分かった。表面プラズモン共鳴法により、p5とp6は、アルギン酸と濃度依存的に結合し、それらの解離定数は〜10^<-9>Mレベルであることが判明した。p8は、アルギン酸と結合するが、同時に解離する性質(K_d=10^<-7>M)も認められた。以上の結果から、A1株において、フラジェリンホモログは、鞭毛形成よりも細胞表層タンパク質として、細胞外アルギン酸との相互作用、並びに襞構造の構築と体腔の形成に機能することが明らかになった。特に、アルギン酸と高い結合性(K_d=10^<-9>M)を示すことから、「体腔」の形成や代謝酵素の発現を制御するシグナル伝達に関わるレセプターとして機能する可能性が考えられた。このことは、鞭毛の起源と進化を理解する上で重要である。また、p8が、ペリプラズム局在性アルギン酸結合タンパク質と、同等のアルギン酸解離定数を示すことは、p8のアルギン酸との結合・解離能と体腔のアルギン酸濃縮機能との関連を実証する手がかりになると判断できる。
期刊论文(12)
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会议论文
Crystal structure of unsaturated glucuronyl hydrolase, responsible for the degradation of glycosaminoglycan, from Bacillus sp.GL1 at 1.8Å resolution
芽孢杆菌属 GL1 中负责降解糖胺聚糖的不饱和葡萄糖醛酸水解酶的晶体结构,分辨率为 1.8Å
DOI: --
发表时间: 2004
期刊: Journal of Biological Chemistry 279(30)
影响因子: --
作者: [Wataru Hashimoto, Jinshan He, Takafumi Itoh]
通讯作者: Takafumi Itoh
Posttranslational processing of polysaccharide lyase : maturation route for gellan lyase in Bacillus sp.GL1.
多糖裂解酶的翻译后加工:芽孢杆菌GL1中结冷胶裂解酶的成熟途径。
DOI: --
发表时间: 2004
期刊: Arch.Biochem.Biophys. 422
影响因子: --
作者: [Masayuki Yamasaki, Takafumi Itoh, Susumu Miyake, Jinshan He, Susumu Miyake]
通讯作者: Susumu Miyake
Structure and function of a hypothetical Pseudomonas aeruginosa protein PA 1167 classified into family PL-7: a novel alginate lyase with a β-sandwich fold.
属于 PL-7 家族的假设铜绿假单胞菌蛋白 PA 1167 的结构和功能:一种具有 β-夹心折叠的新型藻酸盐裂解酶。
DOI: --
发表时间: 2004
期刊: Journal of Biological Chemistry 279(30)
影响因子: --
作者: [Yasuhiro Ooki, Toshiki Uchiumi, Yasuyo Tsukushi, Werner Klipp, Kim Y.et al., Sugiyama M. et al., Liu H.et al., Auesukaree C. et al., 杉山峰崇 他, Liu H.et al., Wataru Hashimoto, Jinshan He, Osamu Miyake, Masayuki Yamasaki]
通讯作者: Masayuki Yamasaki
Origin and diversity of bacterial alginate lyases of families PL-5 and -7 in Sphingomonas sp. strain A1
鞘氨醇单胞菌 PL-5 和 -7 家族细菌藻酸盐裂合酶的起源和多样性。
DOI: --
发表时间: 2004
期刊: Journal of Bacteriology 186(9)
影响因子: --
作者: [Yasuhiro Ooki, Toshiki Uchiumi, Yasuyo Tsukushi, Werner Klipp, Kim Y.et al., Sugiyama M. et al., Liu H.et al., Auesukaree C. et al., 杉山峰崇 他, Liu H.et al., Wataru Hashimoto, Jinshan He, Osamu Miyake, Masayuki Yamasaki, Takafumi Itoh, Osamu Miyake]
通讯作者: Osamu Miyake
タンパク質の「揺らぎ」と機能発現における水分子の役割
  • 批准号:
    18031018
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
  • 资助金额:
    $3.46万
  • 财政年份:
    2006
  • 负责人:
    村田 幸作
  • 依托单位:
体腔器官の分子移植による細菌の構造と機能の大規模改変とその応用
  • 批准号:
    18658033
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Exploratory Research
  • 资助金额:
    $2.24万
  • 财政年份:
    2006
  • 负责人:
    村田 幸作
  • 依托单位:
酵母の形質転換(DNA輸送)機構の解明
  • 批准号:
    16658037
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Exploratory Research
  • 资助金额:
    $2.3万
  • 财政年份:
    2004
  • 负责人:
    村田 幸作
  • 依托单位:
細菌の細胞膜流動による「小胞状構造体」の形成に関わる遺伝子ネットワークの解明
  • 批准号:
    15013228
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
  • 资助金额:
    $2.37万
  • 财政年份:
    2003
  • 负责人:
    村田 幸作
  • 依托单位:
国内基金
海外基金
多体腔量子电动力学理论及其在奇异量子态 精准构筑中的应用
  • 批准号:
    Z24A050007
  • 项目类别:
    省市级项目
  • 资助金额:
    --
  • 批准年份:
    2024
  • 负责人:
    董莹
  • 依托单位:
灿烂弧菌 AJ01 类真核因子 STPK 调控刺参体 腔细胞吞噬体逃逸的分子机制
  • 批准号:
    Z24C190006
  • 项目类别:
    省市级项目
  • 资助金额:
    --
  • 批准年份:
    2024
  • 负责人:
    李成华
  • 依托单位:
刺参 SIRT1 介导的脂噬在平衡灿烂弧菌诱导 的体腔细胞炎症中的作用机制
  • 批准号:
    Q24C190015
  • 项目类别:
    省市级项目
  • 资助金额:
    --
  • 批准年份:
    2024
  • 负责人:
    朱鸶
  • 依托单位: