アラビドプシス花序で発現するcDNAの系統的解析

拟南芥花序中表达的 cDNA 的系统分析

• 批准号: 12024216
• 负责人: 河内 孝之
• 金额: $ 1.34万
• 依托单位: Nara Institute of Science and Technology
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (A)
• 财政年份: 2000
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2000 至 无数据
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-12024216/
• 关键词: シロイヌナズナ; アラビドプシス; 茎頂; 分裂組織; 遺伝子発現

我々はアラビドプシス花序茎頂で発現する遺伝子に注目して系統的な機能解析を進めてることにより、分裂組織での遺伝子による細胞の増殖分化の制御ネットワークを理解することを目指している。これまでに、アラビドプシスの花序分裂組織を含む茎頂組織から調製した均一化cDNAライブラリーを使用したディファレンシャルハイブリダーゼーションにより発現する遺伝子を発現の特異性と発現レベルに基づいて分類した。低い発現レベルでかつ茎頂特異的に発現すると期待されている遺伝子については、ゲノム解析の進行に伴い、様々な生物種の機能未知遺伝子と相同性を示すことが極めて多くなったが、機能予測が困難なものであった。このことから実験による実証的な機能解析が重要であることが改めて認識された。そこで、発現パターン解析が重要と考え、cDNAマイクロアレイを検討した。スライドグラスに約1200スポットを固定したテストアレイと6000のクローンを固定した高密度アレイを作成した。また、テストアレイを用いて、組織特異性およびストレス誘導性遺伝子を探索した結果、既知の遺伝子に加え、機能未知の遺伝子の発現変動を同定できた。RNAを単離する条件を更に詳細に設定することにより、生長の全体像を描く遺伝子発現プロフィーリングを更に進めている。一方、系統的突然変異体の選抜のために、遺伝子破壊系統のスクリーニングし、破壊系統を同定した。現在、順次機能解析を進めている。

We aim to further understand the function analysis of cell proliferation and differentiation by analyzing the gene expression of the inflorescence stem apex and the gene expression of mitotic tissue. The inflorescence division tissue of this plant contains the apical tissue of the stem, and the uniform cDNA sequence is used to produce the specific gene. The low level of occurrence of apex-specific gene expression is expected to increase the likelihood of gene expression, and the analysis of gene expression is carried out in association with the function of unknown gene in biological species and the identification of gene expression is difficult. The function analysis of this paper is very important. The analysis of the gene expression is very important. The cDNA expression is very important. The size of the box is about 1200. The results of the exploration of tissue-specific and inducible genes, the addition of known genes, and the development of genes with unknown functions were determined. The conditions of RNA isolation are set in detail. A sudden change in the selection of a party or system, a change in the selection of a child or system, and a change in the selection of a child or system Now, sequential function analysis.

项目成果

Hyodo,H.: "Systematic isolation of highly transcribed genes in inflorescence apices in Arabidopsis thaliana from an equalized cDNA library."Biosci.Biotechnol Biochem.. 64(7). 1538-1541 (2000)

Hyodo, H.：“从均衡的 cDNA 文库中系统分离拟南芥花序顶端的高度转录基因。”Biosci.Biotechnol Biochem.. 64(7)。

Brucker,G.: "Microinjection of heme oxygenase genes rescues phytochrome-chromophore-deficient mutants of the moss Ceratodon purpureus."Planta. 210. 529-535 (2000)

Brucker,G.：“显微注射血红素加氧酶基因可拯救苔藓 Ceratodon purpureus 光敏色素发色团缺陷突变体。”Planta。

Nishii,A.: "Characterization of a novel gene encoding a putative single zinc-finger protein, ZIM, expressed during reproductive phase in Arabidopsis thaliana."Biosci.Biotechnol.Biochem.. 64(7). 1402-1407 (2000)

Nishii,A.：“编码假定的单一锌指蛋白 ZIM 的新基因的表征，该蛋白在拟南芥繁殖期表达。”Biosci.Biotechnol.Biochem.. 64(7)。

Kawasaki,S.: "Responses of wild watermelon to drought stress : accumulation of an ArgE homologue and citrulline in leaves during water deficits."Plant Cell Physiol.. 41(7). 864-873 (2000)

Kawasaki,S.：“野生西瓜对干旱胁迫的反应：缺水期间叶片中 ArgE 同源物和瓜氨酸的积累。”植物细胞生理学.. 41(7)。

Kohchi,T.: "The Arabidopsis HY2 Gene Encodes Phytochromobilin Synthase, a Ferredoxin-Dependent Biliverdin Reductase."Plant Cell. 13(2). 425-436 (2001)

Kohchi,T.：“拟南芥 HY2 基因编码植物色素合酶，一种铁氧还蛋白依赖性胆绿素还原酶。”植物细胞。