SNPs検索による動脈硬化症の遺伝的解析

通过 SNP 搜索进行动脉硬化的遗传分析

• 批准号: 12204103
• 负责人: 原田 晴仁
• 金额: --
• 依托单位: Nippon Medical School
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (C)
• 财政年份: 2000
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2000 至 无数据
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-12204103/
• 关键词: SNP; 動脈硬化; 家族性高脂血症; 遺伝解析; 虚血性心疾患

背景と目的:動脈硬化症は高血圧、虚血性心疾患、脳血管障害の原因となることが知られており、多因子疾患であると考えられている。しかしながら、実際に多因子疾患の関連遺伝子を同定することはしばしば困難なことも多い。そこで我々は、動脈硬化症の基礎疾患となる高脂血症に注目した。すでに原因変異が証明されているアメリカユタ州の高脂血症一大家系を用い,高脂血症関連遺伝子や脂質代謝関連遺伝子の一塩基多型(SNPs)と血清脂質値との間で相関解析を行うことにより、高脂血症の増悪因子と考えられる関連遺伝子を明らかにする。また、血管の収縮、拡張に直接関与すると思われる遺伝子のSNP検索を行い虚血性心疾患との関連解析を行う。検討結果:高脂血症一大家系のなかでLDL受容体に変異をもつ79名の患者を対象に、高脂血症関連遺伝子、脂質代謝関連遺伝子など46候補遺伝子のSNPsを検討する。SNPsのタイピングは、NCBI,HGBASEなどデータベースに報告されているものや、文献で報告されているアリル頻度の比較的高いものを選び、ダイレクトシーケンス法およびSNaP shot法にてを行った。なかでもアミノ酸置換を伴うcoding領域のSNPやプロモーター領域のSNPを中心に、血清脂質値との間で相関解析を行った。現在までの解析では、Apo H、Apo A2、HTGL、LCATにおいて、SNPsと血清脂質値の間で相関が認められた。これらの遺伝子が、高脂血症を増悪させる修飾因子となっている可能性がある。SNP検索においては血管拡張に関与するCRLR遺伝子に日本人において8箇所新規SNPを同定した。考察:今後、有意差の認められた4つの遺伝子につき同家系内の変異をもたない患者において年齢と性別を厳密にあわせ関連解析を行う。これによりLDL受容体変異の相乗効果により高脂血症を増悪させているのか、あるいは変異に関係なく単独で高脂血症を増悪させうる因子なのかが推測できる。日本人で同定した血管の収縮、拡張因子のSNP検索と虚血性心疾患との関連解析も継続していく。

Background and Purpose: Arteriosclerosis is a cause of high blood pressure, ischemic heart disease, and vascular disease, and is a cause of multifactorial disease.しかしながら、実记にassociated with multi-factor disease の伝子を同定することはしばしばdifficultyなことも多い. This is a basic disease of arteriosclerosis and hyperlipidemia. The cause of the disease is different. It is proved that the cause of hyperlipidemia is a large family. Hyperlipidemia is related to lipid metabolism. Hyperlipidemia is related to lipid metabolism. Polytype (SNPs) and serum lipid values are correlated with each other and are related to hyperlipidemia and hyperlipidemia factors.また, vasoconstriction, and tension are directly related to すると思われる伝子のSNP検SOを行いblood-deficient heart disease and を行う.検Results of the discussion: A large family of hyperlipidemia, a large family of LDL receptors, and 79 patients with different LDL receptors were identified. , hyperlipidemia-related genetic syndrome, lipid metabolism-related genetic syndrome, 46 candidate SNPs related to lipid metabolism, and research on SNPs. SNPs のタイピングは, NCBI, HGBASE などデータベースに report されているものや, text Donate to report the frequency of the comparison of the high frequency of the selection of the high いものをselect び, ダイレクトシーケンス法およびSNaP The shot method is fine.なかでもアミノAcid replacement をband うcoding field のSNP やプロモーターfield のSNP をcenter に, serum lipid との间でCorrelation analysis を行った. Now we are analyzing the correlation between Apo H, Apo A2, HTGL, LCAT, SNPs and serum lipids.これらの缝子が, hyperlipidemia を Increase 悗させるmodifying factor となっている possibility がある. SNP検検検検恫拡拡张に关 and するCRLR 伝子に日本人において8箇 The new regulations of SNP are the same. Investigation: In the future, there will be differences in the same family lineage.をもたないpatient において年颢とgender を厳 density にあわせassociated analysis を行う.これによりLDL receptor divergence and multiplication effect of によりhyperlipidemia をincrease 悪させているのか,あるいは変different relationshipなく単多でhyperlipidemiaをincreaseなさせうるfactorなのかがspeculationできる. Japanese people have determined the SNP correlation of vasoconstriction and expansion factors and the association analysis of blood-deficient heart disease.

项目成果

Harada,H.,Terada,Y. et al.: "Nine novel single-nucleotide polymorphisms of the Intergrin beta4 gene in the Japanese population."J.Hum.Genet.. 46. 35-37 (2001)

原田，H.，寺田，Y.

Harada,H.,Nagai,H. et al.: "Molecular cloning, tissue expression, and chromosomal assignment of a novel gene encoding a subunit of the human signal-recognition particle."J.Hum.Genet.. 46. 70-75 (2001)

原田 H.，永井 H.

Harada,H.,Ishigami,T. et al.: "Human calcitonin receptor-like receptor for adrenomedullin : genomic structure, eight single-nucleotide polymorphisms, and haplotype analysis."J.Hum.Genet.. 46. 132-136 (2001)

原田 H.、石上 T.

Harada,H.,Nagai,H. et al.: "Identification of DMC1,a novel gene in the TOC region on 17q25.1, that shows loss of expression in multiple human cancers."J.Hum.Genet.. 46. 90-95 (2001)

原田 H.，永井 H.

Mikami,I.,Harada,H. et al.: "Down-regulation in multiple human cancers of a novel gene from 17q25.1 that encodes an integral membrane protein."Jpn.J.Cancer Res.. 1-6 (2001)

三上，I.，原田，H.