比較ゲノム的アプローチを用いた真核生物ヘリカーゼ様遺伝子群の体系的機能解析

使用比较基因组方法对真核解旋酶样基因进行系统功能分析

基本信息

  • 批准号:
    12206084
  • 负责人:
  • 金额:
    --
  • 依托单位:
  • 依托单位国家:
    日本
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (C)
  • 财政年份:
    2000
  • 资助国家:
    日本
  • 起止时间:
    2000 至 无数据
  • 项目状态:
    已结题

项目摘要

1.我々が出芽酵母ゲノムの解析から新規に見出したヘリカーゼ様遺伝子のうち、増殖に必須でない遺伝子(YDR332W,YDR291W,YGL064C,YHR031C,YIR002C,YLR419W,YLR247C,YKL017C,YNL218W,YOL095W)、および遺伝子産物がRNA-dependent ATPaseであることを独自に実証した増殖必須遺伝子YDL084Wの合計11個について、lexAシステムを利用した酵母two-hybrid法によって、酵母ゲノムライブラリーから相互作用を持つ蛋白質のスクリーニングを行った。解析が不可能であったYIR002Cを除く10個の遺伝子のうちで、現在までにYKL017Cがそれ自身と、YNL218Wが少なくとも5個の遺伝子産物(YNL218W,SNF1,YMR102C,TEM1など)と相互作用することなどを見出した。特にYNL218Wについては詳細な生理機能の解析を進めている。2.ゲノム配列データベースから相同性解析によってヘリカーゼ様蛋白質を網羅的に同定し、比較生物学的解析を行った結果、(1)バクテリア、古細菌と真核生物との間ではファミリー構成に明確な違いが存在すること、(2)真核生物間の配列比較から、種特異的な遺伝子群と多様化したサブファミリーが存在することを明らかにした。3.多細胞生物におけるヘリカーゼ様蛋白質群の生理機能を網羅的に解明することを目的として、遺伝子機能破壊のためのRNAi実験系の立ち上げを行った。モデルとしてYDL084Wの線虫ホモログ(C26D10.2)の機能破壊を行ったところ、胚性致死となり、種を超えて真核細胞の増殖に必須な機能を果たしていることが示唆された。現在、約120個の線虫ヘリカーゼ様遺伝子について、feeding RNAiによる解析を進めている。これまでに発生の遅延、形態異常などの興味深い表現型を示す遺伝子が存在することを確認している。
1. We found that budding yeasts need to be analyzed, new rules found, new rules found (YDR332W,YDR291W,YGL064C,YHR031C,YIR002C,YLR419W,YLR247C,YKL017C,YNL218W,YOL095W), RNA-dependent ATPase products, RNA-dependent ATPase The yeast two-hybrid method is used to determine the protein content and the yeast interaction. YKL017C is itself, YNL218W is less than 5 genetic products (YNL218W, SNF1, YMR102C,TEM1), and interaction products are found in the analysis. Specifically, the YNL 218W provides a detailed analysis of physiological functions. 2. The results of comparative biology analysis show that (1) there is no difference between archaea and eukaryotes,(2) there is no difference between eukaryotes and eukaryotes, and (3) there is no difference between eukaryotes and eukaryotes. 3. The physiological functions of multicellular organisms include the understanding of the purpose and function of the RNAi system. YDL084W's line worm (C26D10.2) has a functional breakdown, embryonic lethality, and a functional breakdown that is essential for eukaryotic reproduction. Now, about 120 lines of worms are in the middle of the game, feeding RNAi is in the middle of the game. The phenotype of this disease indicates the existence of a gene and confirms its existence.

项目成果

期刊论文数量(2)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Yuasa,A.: "Genomic structure, chromosomal localization and identification of mutations in the xeroderma pigmentosum variant (XPV) gene"Oncogene. 19(41). 4721-4728 (2000)
Yuasa,A.:“着色性干皮病变异(XPV)基因的基因组结构、染色体定位和突变鉴定”癌基因。
  • DOI:
  • 发表时间:
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    0
  • 作者:
  • 通讯作者:
浴 俊彦: "DNA複製関連因子"Biotherapy. 14(8). 759-765 (2000)
Toshihiko Yu:“DNA复制相关因素”生物治疗14(8)759-765(2000)。
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