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比較ゲノム的アプローチを用いた真核生物ヘリカーゼ様遺伝子群の体系的機能解析

使用比较基因组方法对真核解旋酶样基因进行系统功能分析

基本信息

批准号：
13206082
负责人：
浴俊彦
金额：
$ 2.88万
依托单位：
The Institute of Physical and Chemical Research
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (C)
财政年份：
2001
资助国家：
日本
起止时间：
2001 至无数据
项目状态：
已结题

项目摘要

真核生物におけるヘリカーゼ様タンパク質ファミリーの機能を網羅的に解明する目的で、単細胞生物としては出芽酵母を、多細胞生物としては線虫を、各々モデルとして機能解析研究を進めた。まず出芽酵母の解析については、以下のような研究成果を挙げた。1.機能未知の10個の非必須ヘリカーゼ様遺伝子について、遺伝子破壊株の表現型の解析を進め、3個のミトコンドリア機能に関与すると思われる遺伝子(YDR332W,YGL064C,YOL095C)を新たに同定した。2.組換えに関与することが示唆されているYnl218wpについて、相互作用する酵母蛋白質を同定するためのタグ融合蛋白質の発現株を作成した。Ynl218wpについては、これまでに酵母two-hybrid法により同定した複数の蛋白質との相互作用についても、詳細な解析を進めた。また線虫については、ゲノムに存在するほぼ全てのヘリカーゼ様遺伝子について網羅的なRNAi解析を進め、次に示す成果を挙げた。1.現時点(2002年2月)までの段階で、125個のヘリカーゼ様遺伝子のRNAi解析を完了した。その結果、テストした遺伝子の約40%のRNAi変異体において、細胞増殖や初期発生、個体成長、あるいは形態形成に明らかな欠損が認められた。2.RNAiを利用した機能遺伝子のスクリーニング系を確立した。具体的に、紫外線やX線の照射に感受性を示すようなRNAi変異体のスクリーニングを進めた。その結果、新たに複数の候補遺伝子が同定され、RNAiを用いた機能遺伝子の有効性を実証することができた。

Eukaryotic organisms, such as yeast and multicellular organisms, have been studied for their functions. The analysis of budding yeasts was carried out, and the following research results were obtained. 1. 10 non-essential genes with unknown function, 3 non-essential genes with unknown function (YDR332W, YGL064C, YOL095C), and 3 non-essential genes with unknown function (YGL064C, YOL095C). 2. Formation of fusion protein from yeast protein by interaction Ynl218wp The results of RNAi analysis are shown below. 1. At present (February 2002), the RNAi analysis of 125 fragments has been completed. About 40% of RNAi mutants were identified as a result of cell growth, early development, individual growth, and morphogenesis. 2. RNAi is used to establish a functional DNA sequence. Specific sensitivity to ultraviolet and X-ray irradiation is indicated by RNAi heterogeneic radiation. The results of this study are as follows: 1. The effectiveness of RNAi functional vectors is demonstrated by the identification of new candidate vectors.