マイクロサテライト解析によるびまん性汎細気管支炎の主要感受性遺伝子座の推定

微卫星分析估计弥漫性全细支气管炎主要易感位点

• 批准号: 12877092
• 负责人: 徳永 勝士
• 金额: $ 1.15万
• 依托单位: The University of Tokyo
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Exploratory Research
• 财政年份: 2000
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2000 至 无数据
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-12877092/
• 关键词: びまん性汎細気管支炎; ヒト白血球抗原; HLA-B; マイクロサテライト; ハプロタイプ

びまん性汎細気管支炎は我々を中心としたこれまでの検討により、第6染色体短腕上のヒト白血球抗原をコードするHLA-A,-B両遺伝子座間に主要疾患感受性遺伝子が存在する可能性がある。そこでその候補領域を明確にする目的で、疾患群92例、対照群93例を対象に、計14の遺伝マーカーを利用したハプロタイプ解析と関連分析を行った。疾患群で高頻度に見られる7座位の対立遺伝子型のうちカイ2乗値が高い5座位で組まれるハプロタイプの頻度を最大尤度法により推定し、3種の疾患感受性ハプロタイプを見いだした。さらに患者11例については、14マーカー座位のハプロタイプを直接決定し、上記疾患感受性ハプロタイプの存在を確認した。それらの疾患感受性ハプロタイプで共有される領域(共有分節)は、200kbにわたり、その分節内のマーカー対立遺伝子は、韓国人患者、20名中17名に見いだされた。疾患とマーカーとの関連性の強さを表すオッズ比やデルタ値も、推定された領域の中で最大値を示した。すなわち、いずれの解析方法によっても、HLA-B遺伝子座より300kbほどテロメアよりにある、S遺伝子とTFIIH遺伝子に挟まれた200kbの領域に感受性遺伝子が存在する可能性が強く示唆された。この領域には既知の遺伝子は報告されていないが、各種遺伝子予測プログラムでその存在が予想される少なくとも12の部位が存在したため、さらに候補領域を絞り込む目的で、新たに3種のマイクロサテライトマーカーを開発してタイピングを行い、候補領域内のセントロメア側の100kbに疾患感受性遺伝子が存在する可能性が高いことを見いだした。現在、この候補補領域内のSNPsの同定を進めている。これら一連の研究に対して、遺伝要因の関わるヒトの疾患および遺伝子の国際番号であるMIM number:604809が初めて本疾患に対して付与された。

The possibility of the presence of a major disease-susceptible gene between loci of HLA-A,-B leukocytes on the short arm of chromosome 6 is also discussed. For example, 92 cases of disease group and 93 cases of disease group were analyzed. The disease group is high frequency, 7 loci, 2 loci, 5 loci, 3 loci, 4 loci, 3, In 11 cases, 14 cases were directly determined by the presence of disease susceptibility. There were 17 Korean patients out of 20 who were diagnosed with the disease. The relationship between the disease and the maximum value is shown in the table. The analysis method of HLA-B gene is 300kb, and the possibility of the existence of a susceptible gene in a 200kb domain is strongly indicated by HLA-B gene and TFIIH gene. This domain is known to have a number of known genes, such as those reported in the report, various genes, such as those predicted in the report, and the existence of these genes. This domain is expected to have a number of 12 sites, such as those found in the report, and the candidate domain is expected to have a number of new genes, such as those reported in the report. The probability of the presence of a disease-susceptible gene in the candidate domain is higher than that in the 100kb region. Now, the SNPs in the candidate field are determined simultaneously. This study was conducted in conjunction with MIM number:604809 for the first time.

项目成果

Keicho N.,J.Ohashi, et al.: "Fine localization of a major disease-susceptibility locus for diffuse panbronchiolitis."Am.J.Hum.Genet.. 66・2. 501-507 (2000)

Keicho N.、J. Ohashi 等人：“弥漫性全细支气管炎的主要疾病易感位点的精细定位”。Am.J.Hum.Genet.. 501-507 (2000)。

慶長直人,土屋朋子,中田光: "びまん性汎細気管支炎と分子遺伝学の接点"Ther.Res.. 21・8. 1900-1903 (2000)

Naoto Keicho、Tomoko Tsuchiya、Hikaru Nakata：“弥漫性全细支气管炎与分子遗传学的交叉点”Ther.Res.. 21・8（2000）。

土屋朋子,慶長直人,中田光: "びまん性汎細気管支炎の病態生理"内科. 86・4. 733-736 (2000)

土屋智子、庆长直人、中田光：“弥漫性全细支气管炎的病理生理学”内科 86・4（2000）。

Kanai T,Fujii T, et al.: "Polymorphism of Human Leukocyte Antigen-E Gene in the Japanese Population with or without Recurrent Abortion."Am J Reprod Immunol Microbiol.. 45・3. 168-173 (2001)

Kanai T、Fujii T 等人：“有或没有复发性流产的日本人群中人类白细胞抗原 E 基因的多态性”。Am J Reprod Immunol Microbiol.. 168-173 (2001)。

慶長直人 et al.: "びまん性汎細気管支炎とHLA"血液フロンティア. 11・1. 39-46 (2001)

Naoto Keicho 等：“弥漫性全细支气管炎和 HLA”《血液前沿》11・1（2001 年）。