Parametric and nonparametric linkage analysis with dense marker maps.
Parametric and nonparametric linkage analysis with dense marker maps.
批准号:
5310406
负责人:
Professor Dr. Konstantin Strauch
金额:
$0.0万
依托单位国家:
德国
项目类别:
Research Units
财政年份:
2001
资助国家:
德国
项目状态:
已结题
起止时间:
2000-12-31 至 2007-12-31
中文摘要
Die Genetische Epidemiology befaßt sich mit der Identifizierung und Charakterisierung von Genen,die ursächlich an der Entstehung von Krankheiten beteiligt sind. 第一个字母是字母,今天的字母是字母。 一个基因组的测量方法也不能用基因扫描。 我们将通过对最佳市场预测和最佳风险管理的分析来确定最佳的韦尔登比例。Ist dies der Fall,so spricht dies für die cancertenz eines krankheitsverursachenden Gens in der chromosomalen Region.技术和方法论的堡垒一样,已经被广泛使用,但它也是一个主要的或基本的问题,梅尔。最先进的多态性标记系统的诞生是为了在计算机程序中实现现代生物统计学和生物遗传学的发展。 Deutlich schwieriger ist die Genkartierung bei solchen Phänotypen,die neinem einfachen Mendelschen Erbgang unterliegen,sondern been die Ausprägung von Umweltfaktoren or der zusätzlichen genetischen Faktoren abhängt. In solchen Fällen können Personen betroffen seen,ohne die betrefficient Mutation zu haben(sporadische Fälle oder Phänokopien),oder umgekehrt gesund seen,obwohl sie die Mutation tragen(unvollständige Penetranz). 一个基因组印记的基础是,这些印记也会产生原始父母的效应。 一般来说,这些印记会从父亲那里进入,或者从母亲那里进入,或者从母亲那里进入。 Wenn dieses ein krankheitsverursachendes Allen ist,so kommt es nicht zur Krankheitsausprägung.In diesem methodischen Projekt geht es darum,mathematisch-statistische Methoden der Kopplungsanalyze für genetisch-komplex Krankheiten weiterzuentwickeln,methodische Entwicklungen in Software zu implementieren und schließlich diese Hilfsmittel bei der Kartierung bestimmter Krankheiten anzuden. Geplant sind nichtparametrische Methoden('allele-sharing'-Verfahren)für viele genetische Marker und komplexe Stammbäcker,die das genomische Imprinting berücksichtigen.本文通过建立一个基于LOD值的最大化Krankheitsmodells参数的自动化模型,为韦尔登提供了一种新的工具。Ein anderer wichtiger Punkt ist die Möglichkeit,geschlechtsspezière Markerabstände in Kopplungsanalyse-Programmen zu verwenden. 这一成果已被广泛应用,并已被广泛应用于建模和分析中。新发展的遗传学项目的实施、算法验证和分析,在Rahmen的研究小组中也有类似的研究,这是一种基本的方法,用于Kopplungsanalysis的Bereich,并可以直接进行。
英文摘要
Die Genetische Epidemiologie befaßt sich mit der Identifizierung und Charakterisierung von Genen, die ursächlich an der Entstehung von Krankheiten beteiligt sind. Der erste Schritt dazu ist die Genkartierung, die heute meistens genom-weit durchgeführt wird. Eine solche Durchmusterung des Genoms nennt man auch Genom-Scan. Mittels der Kopplungsanalyse wird untersucht, ob bestimmte Markerausprägungen und Krankheitsphänotypen überproportional häufig gemeinsam vererbt werden. Ist dies der Fall, so spricht dies für die Existenz eines krankheitsverursachenden Gens in der chromosomalen Region. Technologischer wie methodischer Fortschritt haben gemeinsam dazu beigetragen, daß die Kartierung genetisch einfacher, also dominanter oder rezessiver Erbkrankheiten kein prinzipielles Problem mehr darstellt. Neben der Entdeckung hochpolymorpher Markersysteme war dabei die Implementation moderner Algorithmen und biometrisch-genetischer Verfahren in Computerprogramme von wesentlicher Bedeutung. Deutlich schwieriger ist die Genkartierung bei solchen Phänotypen, die keinem einfachen Mendelschen Erbgang unterliegen, sondern bei denen die Ausprägung von Umweltfaktoren oder zusätzlichen genetischen Faktoren abhängt. In solchen Fällen können Personen betroffen sein, ohne die betreffende Mutation zu haben (sporadische Fälle oder Phänokopien), oder umgekehrt gesund sein, obwohl sie die Mutation tragen (unvollständige Penetranz). Eine Besonderheit stellt das genomische Imprinting dar, das auch als parent-of-origin-Effekt bezeichnet wird. An Genorten, die dem Imprinting unterliegen, wird entweder das vom Vater oder das von der Mutter geerbte Allel ganz oder teilweise deaktiviert. Wenn dieses ein krankheitsverursachendes Allel ist, so kommt es nicht zur Krankheitsausprägung.In diesem methodischen Projekt geht es darum, mathematisch-statistische Methoden der Kopplungsanalyse für genetisch-komplexe Krankheiten weiterzuentwickeln, methodische Entwicklungen in Software zu implementieren und schließlich diese Hilfsmittel bei der Kartierung bestimmter Krankheiten anzuwenden. Geplant sind nichtparametrische Methoden (´allele-sharing´-Verfahren) für viele genetische Marker und komplexe Stammbäume, die das genomische Imprinting berücksichtigen. Darüberhinaus soll ein Hilfsmittel für die sogenannte exploratorische Kopplungsanalyse entwickelt werden, welches automatisch modell-basierte LOD-Scores über die Parameter des Krankheitsmodells maximiert. Ein anderer wichtiger Punkt ist die Möglichkeit, geschlechtsspezifische Markerabstände in Kopplungsanalyse-Programmen zu verwenden. Diese Erweiterungen haben das Ziel, genetisch bedingte Krankheiten adäquat zu modellieren und damit die Trennschärfe der Kopplungsanalyse zu erhöhen. Die Implementation, algorithmische Verfeinerung und Anwendung der neuen Entwicklungen bietet klinisch-genetischen Projekten, sowohl im Rahmen dieser Forschergruppe als auch in anderen Gruppen, eine fundierte methodische Unterstützung für den Bereich der Kopplungsanalyse und kommt ihnen damit direkt zugute.
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会议论文
Methods and algorithms for haplotype-based linkage and association analysis of rare genetic variants
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批准号:179606676
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项目类别:Research Grants
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资助金额:$0.0万
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财政年份:2010
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负责人:Professor Dr. Konstantin Strauch
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依托单位:
Development and implementation of linkage-analysis methods for the genetic mapping of complex traits
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批准号:43639535
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项目类别:Research Grants
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资助金额:$0.0万
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财政年份:2007
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负责人:Professor Dr. Konstantin Strauch
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依托单位:
Linkage analysis of genetically complex diseases with genomic imprinting and two-locus trait models
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批准号:5346368
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项目类别:Publication Grants
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资助金额:$0.0万
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财政年份:2001
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负责人:Professor Dr. Konstantin Strauch
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依托单位:
国内基金
海外基金
半参数空间自回归面板模型的有效估计与应用研究
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批准号:71961011
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项目类别:地区科学基金项目
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资助金额:16.0万元
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批准年份:2019
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负责人:丁飞鹏
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依托单位: