权益分类	功能权益	普通用户	{{item.name}}会员
{{category.name}}	{{benefitItem.name}}

放線菌の線状ゲノムのダイナミックな構造変化の解析

放线菌线性基因组动态结构变化分析

基本信息

批准号：
13206055
负责人：
木梨陽康
金额：
$ 4.16万
依托单位：
Hiroshima University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (C)
财政年份：
2001
资助国家：
日本
起止时间：
2001 至无数据
项目状态：
已结题

来源：
https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-13206055/
关键词：
放線菌線状染色体線状プラスミドゲノム構造ゲノム再編成

项目摘要

(1)Streptomyces griseusの線状染色体のダイナミックな構造変化の解析染色体欠失後も線状構造を維持していると思われた301-22株は、異なる欠失サイズをもつ変異株の混合物であることが分かった。単離した変異株の一つでは、両欠失末端を結んで大きなパリンドローム構造が形成され、染色体が環状化していることが明らかになった。このような構造は左右の末端逆位配列がその途中で組み換えを起こして形成されたと思われる。402-2株の線状染色体上に生じた約2Mbの逆位の接合部と親株の対応する領域をクローン化し塩基配列を決定した。塩基配列の比較から、単純に逆位が起こったのではなく、逆位に隣接してDNAの欠失をともなっていることが分かった。(2)Streptomyces coelicolor A3(2)の線状染色体とSCP1の相互作用の解析2106株では8700kbの線状染色体と360kbのSCP1の一点交差によって2つのキメラ染色体が生じたと思われた。2つのキメラ染色体の接合部の塩基配列を決定し、対応するS.coelicolor染色体及びSCP1の配列と比較して一点交差を確認した。これは線状染色体の複数化のモデルとしてたいへん興味深い。これまで解析された放線菌の線状ゲノムは全て末端逆位配列をもつ。一方、SCP1と染色体の末端配列は全く異なるので、2つのキメラDNAは末端逆位配列をもたないように思われた。1984株は、SCP1の中に染色体断片が挿入されたプラスミドSCP1'-cysB(600kb)をもつ。解析の結果、これはSCP1の左側260kbと染色体断片40kbが、後者を中心にして左右対称に折り返して形成されたプラスミドであることが明らかになった。

(1)Streptomyces griseus linear chromosome structure and transformation analysis chromosome loss after linear structure and maintenance of the 301-22 strains, heterozygotes and heterozygotes mixture. The structure of the chromosome is formed, and the chromosome is circularized. The structure of the structure is opposite to the end of the structure. On the way, the structure is formed. 402-2 The genetic diversity of the linear chromosomes of the plants is determined by the genetic diversity of the plants and the genetic diversity of the plants. Comparison of nucleotide sequences, pure-reverse sequences, and adjacent sequences of DNA (2) Analysis of the interaction between Streptomyces coelicolor A3(2) linear chromosome and SCP1 2106 strains: 8700kb linear chromosome and 360kb SCP1. 2. To determine the base alignment at the junction of the chromosome, compare the alignment of the S.coelicolor chromosome with that of SCP1 and confirm the point intersection. This is the case with linear chromosomes. This analysis shows that the linear structure of the radioactive bacteria is completely reversed at the end. One side, SCP1, chromosome terminal alignment is completely different, 2, chromosome terminal alignment is reversed 1984 strain, SCP1 chromosome fragment was inserted into the genome of SCP1'-cysB(600kb). The analysis results showed that the left 260kb fragment of SCP1 and the left 40kb fragment of SCP 1 were formed in the center and the left 40 kb fragment of SCP 1 was formed in the center.