タンパク質の糖鎖・翻訳後修飾解析支援のためのスペクトルデータベース構築
构建光谱数据库以支持蛋白质糖链和翻译后修饰分析
基本信息
- 批准号:13780480
- 负责人:
- 金额:$ 1.34万
- 依托单位:
- 依托单位国家:日本
- 项目类别:Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
- 财政年份:2001
- 资助国家:日本
- 起止时间:2001 至 2002
- 项目状态:已结题
- 来源:
- 关键词:
项目摘要
タンパク質の翻訳後修飾の一つである糖鎖付加をハイスループットに質量分析計で解析するためのスペクトルデータの構築を行った。糖鎖の配列解析はこれまでのMS/MS分析で可能であるが、結合異性体などの構造異性体の識別はこれまで非常に難しい問題であったので、これを解決するために構造異性体である単純オリゴ糖鎖をMALDI-MSで測定し解析を行ったところ、ポストソース分解測定で得られるイオンの強度に注目する事で多くの構造異性体の識別に成功した。さらに最新の質量分析計である四重極/飛行時間質量分析計での測定も行い、MS/MS測定から得られるフラグメントイオンのイオン強度解析を行って、これまで得られたデータが他の質量分析法でも成立する一般的傾向である事が分かった。すなわち今回確立したMS/MSフラグメントイオンのイオン強度を解析し糖鎖構造異性体を識別する方法は第二質量分析計に飛行時間質量分析計を用いる系であれば成立することが分かった。さらに糖タンパク質糖鎖にもMS/MS強度解析法を適応し、高度に分岐した複雑な糖鎖の構造異性体の識別も行った。マンノース1-3分岐、1-6分岐に結合したガラクトース結合位置異性体の識別では分岐構造とは直接は無関係に思える部分の切断から生じるフラグメントイオンのイオン強度に明瞭なイオン強度差が現れた。イオン強度を詳細に解析する事で複合糖鎖の構造異性体を識別する事は可能であったが、どのようなメカニズムでイオン強度差が生じるのかは明確にできず、さらなる研究が必要である事が分かった。しかし、当初の目的である構造異性体の識別を行うことは達成できており、我々のイオン強度に注目した構造異性体識別法が有用な手法である事を示すに到った。
The quality of the product is determined by the quality analysis. The MS/MS analysis of the glycan sequence is possible, and the identification of the heterostructure is very difficult. The MS/MS analysis of the glycan sequence is possible, and the identification of the heterostructure is very difficult. The MS/MS analysis of the heterostructure is possible, and the MS/MS analysis of the heterostructure is successful. Recently, the latest mass analyzer, quadrupole/time-of-flight mass analyzer, MS/MS measurement, and other mass analysis methods have been established. The method for identifying the structural heteromorphs of the sugar chain by MS/MS analysis is established by the second mass analyzer and the time of flight mass analyzer. The MS/MS intensity analysis method was used to identify the structural heteromorphs of the complex carbohydrate. 1-3 bifurcation, 1-6 bifurcation, 1-6, bifurcation, bifurcation, 1 - 6, bifurcation, bifurcation The intensity of the complex sugar lock is analyzed in detail, and the structural variant is identified. The intensity difference is generated. The research is necessary. The method of structural heteromorphism identification is useful for the purpose of identifying structural heteromorphism.
项目成果
期刊论文数量(5)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
山垣 亮: "質量分析法による新たな糖鎖構造解析法:糖鎖構造における異性体の識別"質量分析(日本質量分析学会誌). (印刷中).
Ryo Yamagaki:“使用质谱的新聚糖结构分析方法:聚糖结构中异构体的鉴定”质谱(日本质谱学会杂志)(正在出版)。
- DOI:
- 发表时间:
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
- 通讯作者:
H.M.M.J.Gunaratne, Tohru Yamagaki, M.Matsumoto, M.Hoshi: "Biochemical characterization of core region sugar chains of acrosome reaction-inducing substance in jelly coat of starfish eggs"Glycobiology. (in press).
H.M.M.J.Gunaratne、Tohru Yamagaki、M.Matsumoto、M.Hoshi:“海星卵果冻层顶体反应诱导物质核心区糖链的生化特征”糖生物学。
- DOI:
- 发表时间:
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
- 通讯作者:
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Tohru Yamagaki、K.Hamayasu、H.Hashimoto、H.Nakanishi:“使用基质辅助激光解吸/电离飞行时间质谱法对新型异质糖支链环糊精进行后源衰变分析”Journal of the Mass Spectrometry So
- DOI:
- 发表时间:
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
- 通讯作者:
山垣 亮: "MALDI-MSによるポストソース分解測定およびインソース分解/ポストソース分解組み合わせ測定を利用した糖鎖構造解析"質量分析(日本質量分析学会誌). (印刷中).
Ryo Yamagaki:“使用源后降解测量和 MALDI-MS 组合源内/源后降解测量进行聚糖结构分析”质谱(日本质谱学会杂志)(正在出版)。
- DOI:
- 发表时间:
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
- 通讯作者:
Y.Hayashi, M.Kitahara, T.Yamagaki, K.Kojima, I.Matsumoto: "A potential endogenous ligand of annexin IV in the exocrine pancreas. Carbohydrate structure of GP-2, a glycosylphosphatidylinositol-anchored glycoprotein"Journal of Biological Chemistry. 277. 474
Y.Hayashi、M.Kitahara、T.Yamagaki、K.Kojima、I.Matsumoto:“外分泌胰腺中膜联蛋白 IV 的潜在内源配体。糖基磷脂酰肌醇锚定糖蛋白 GP-2 的碳水化合物结构”生物化学杂志
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