金属錯体挿入による新規金属酵素の創製
通过插入金属配合物创建新的金属酶
基本信息
- 批准号:13740384
- 负责人:
- 金额:$ 1.6万
- 依托单位:
- 依托单位国家:日本
- 项目类别:Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
- 财政年份:2001
- 资助国家:日本
- 起止时间:2001 至 2002
- 项目状态:已结题
- 来源:
- 关键词:
项目摘要
人工酵素構築の新しい方法論として、蛋白質キャビティーに合成金属錯体を挿入し、蛋白質反応場を利用して反応制御をする試みは、当初の計画を大幅に上回る成果を生み出すことが出来たので、ここにまとめる。1.金属錯体挿入法の確立 初期の段階における、反応条件や挿入金属錯体の決定は多数のサンプルスクリーニングが必要となる。本研究では、ESI-TOF MSによる迅速スクリーニング法を確立し、数百にのぼるサンプルの解析から、安定な複合体の決定に成功した(投稿準備中)。2.人工金属酵素の構造決定 反応制御をおこなう上で、構造決定は重要である。本研究では安定な複合体を形成するM(3,3'-Me_2-salphen)・apo-A71G Mb (M=Cr^<III>, Mn^<III>, and Fe^<III>)の結晶構造解析に成功し、当初の分子設計通りに錯体がミオグロビンキャビティーに挿入され、特異的な非共有結合相互作用によって固定化されていることを明らかとした(投稿準備中)。3.反応制御方法の確立 結晶構造解析を元に、蛋白質反応場の分子設計を支援計算ソフトInsightII/Discover3によっておこない、蛋白質アミノ酸特異的部位置換法と挿入錯体の配位子をデザインすることによって、酵素反応の向上を目指した。具体的にはCr(3,3'-Me_2-salphen)・apo-A71G Mbの結晶構造をもとに、Cr(5,5'-t-Bu_2-salphen)・apo-H64D/A71G Mbを単離し、チオアニソールの不斉酸化反応に成功した。本研究は、合成錯体を非共有結合的に蛋白質に結合し、合理的な分子設計により反応制御をおこなった世界で最初の例である(Angew. Chem. Int. Ed., 2003, 42, 1005)。4.今後の展望 本研究で得られた結果は、様々な金属化合物と蛋白質の複合化に利用できる。実際、生体分子の複合体システムに金属化合物を組み込んだり、蛋白質の内部で金属錯体を合成することによって、これまでにない、化学反応システムの構築を進行中である。
作为构建人工酶的新方法,尝试将合成金属复合物插入蛋白质腔中,并使用蛋白质反应场控制反应能够产生远远超过原始计划的结果,因此我们在此处将它们汇总。 1。在早期阶段建立金属复合物插入方法,确定反应条件和插入金属络合物需要大量样品筛选。在这项研究中,我们使用ESI-TOF MS建立了一种快速筛选方法,并通过对数百个样品的分析(准备发布)成功确定了稳定的复合物。 2。在控制反应时,人工金属酶结构的结构确定很重要。在这项研究中,我们成功地分析了M(3,3'-Me_2-Salphen)和Apo-A71G MB的晶体结构(M = Cr^<iii>,Mn^<iiii>和Fe^<iiii>),它们形成了稳定的复合物,并揭示了该络合物的特定目的是由Myoglob cavity插入的,并且是由分类插入的,并且是由分类插入的。 (准备发布)。 3。建立基于晶体结构分析的反应控制方法,我们旨在通过使用支持计算的软件Insighii/Discover3以及设计蛋白氨基酸特异性位点取代方法和插入配体的蛋白质氨基酸特异性位点取代方法,以改善酶反应。具体而言,分离了基于CR(3,3'-ME_2-SALPHEN)和APO-A71G MB的晶体结构,分离出CR(5,5'-T-BU_2-盐)和APO-H64D/A71G MB的晶体结构,并成功地携带了甲异异异烷的不对称氧化。这项研究是世界上第一个通过合理的分子设计与蛋白质与蛋白质结合并控制反应的第一个研究(Angew。Chem。Int。d。,2003,42,1005)。 4。未来的前景从这项研究中获得的结果可用于结合各种金属化合物和蛋白质。实际上,我们目前正在通过将金属化合物纳入生物分子复合物系统并合成蛋白质中的金属络合物来构建前所未有的化学反应系统。
项目成果
期刊论文数量(4)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Hara I., Ueno T., Ozaki S., Itoh S., Lee K., Ueyama N., Watanabe Y.: "Oxidative Modification of Tryptophan 43 in the Heme Vicinity of the F43H/H64L Myoglobin Mutant"J. Biol. Chem. 276. 36067-36070 (2001)
Hara I.、Ueno T.、Ozaki S.、Itoh S.、Lee K.、Ueyama N.、Watanabe Y.:“F43H/H64L 肌红蛋白突变体血红素附近色氨酸 43 的氧化修饰”J。
- DOI:
- 发表时间:
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
- 通讯作者:
Shigeru Kato, Hui-jun Yang, Takafumi Ueno, Shin-ichi Ozaki, George N. Phillips, Jr., Shunichi Fukuzumi, Yoshihito Watanabe: "Asymmetric Sulfoxidation and Amine Binding by H64D/V68A and H64D/V68S Mb : Mechanistic Insight into the Chiral Discrimination Step
Shigeru Kato、Hui-jun Yang、Takafumi Ueno、Shin-ichi Ozaki、George N. Phillips, Jr.、Shunichi Fukuzumi、Yoshihito Watanabe:“H64D/V68A 和 H64D/V68S Mb 的不对称磺化和胺结合:机制洞察
- DOI:
- 发表时间:
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
- 通讯作者:
I.Hara, T.Ueno, S.Ozaki, S.Itoh, K.Lee, N.Ueyama, Y.Watanabe: "Oxidative Modification of Tryptophan 43 in the Heme Vicinity of the F43W/H64L Myoglobin Mutant"The Journal of Biological Chemistry. 276. 36067-36070 (2000)
I.Hara、T.Ueno、S.Ozaki、S.Itoh、K.Lee、N.Ueyama、Y.Watanabe:“F43W/H64L 肌红蛋白突变体血红素附近色氨酸 43 的氧化修饰”生物学杂志
- DOI:
- 发表时间:
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
- 通讯作者:
Masataka Ohashi, Tomomi Koshiyama, Takafumi Ueno, Manabu Yanase, Hiroshi Fujii, Yoshihito Watanabe: "Preparation of Artificial Metalloenzymes by Insertion of Chromium(III) Schiff Base Complexes into Apo-Myoglobin Mutants"Angew. Chem. Int. Ed.. 42. 1005-10
Masataka Ohashi、Tomomi Koshiyama、Takafumi Ueno、Manabu Yanase、Hiroshi Fujii、Yoshihito Watanabe:“通过将铬 (III) 席夫碱配合物插入 Apo-肌红蛋白突变体中制备人工金属酶”Angew。
- DOI:
- 发表时间:
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
- 通讯作者:
{{
item.title }}
{{ item.translation_title }}
- DOI:
{{ item.doi }} - 发表时间:
{{ item.publish_year }} - 期刊:
- 影响因子:{{ item.factor }}
- 作者:
{{ item.authors }} - 通讯作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ journalArticles.updateTime }}
{{ item.title }}
- 作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ monograph.updateTime }}
{{ item.title }}
- 作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ sciAawards.updateTime }}
{{ item.title }}
- 作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ conferencePapers.updateTime }}
{{ item.title }}
- 作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ patent.updateTime }}
上野 隆史其他文献
Molecular design of protein needle for norovirus vaccine
诺如病毒疫苗蛋白针的分子设计
- DOI:
- 发表时间:
2020 - 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
Nguyen Dan Que;上野 隆史 - 通讯作者:
上野 隆史
pH応答性伸縮タンパク質集合体の構造解析
pH 响应性可拉伸蛋白质聚集体的结构分析
- DOI:
- 发表时间:
2022 - 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
伊達 弘貴;PHAM Thuc Toan;内橋 貴之;上久保 裕生;Chihong Song;村田 和義;上野 隆史 - 通讯作者:
上野 隆史
In vivo Protein Crystal Engineering for Structure Analysis of Meta-stable State Mini-protein
用于亚稳态小蛋白结构分析的体内蛋白质晶体工程
- DOI:
- 发表时间:
2020 - 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
小島 摩利子;安部 聡;上野 隆史 - 通讯作者:
上野 隆史
βヘリックスタンパク質分子針の末端設計による二次元集合制御
β-螺旋蛋白分子针末端设计的二维组装控制
- DOI:
- 发表时间:
2021 - 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
菊池 幸祐;福山達也;古田 忠臣;内橋 貴之;前多裕介;上野 隆史 - 通讯作者:
上野 隆史
タンパク質ケージ内における芳香環相互作用ネットワークの熱力学・分子動力学的解析
蛋白质笼内芳环相互作用网络的热力学和分子动力学分析
- DOI:
- 发表时间:
2022 - 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
菱川 湧輝;野谷 大樹;浅沼 明日香;Basudev Maity;長門石 曉;津本 浩平;安部 聡;上野 隆史 - 通讯作者:
上野 隆史
上野 隆史的其他文献
{{
item.title }}
{{ item.translation_title }}
- DOI:
{{ item.doi }} - 发表时间:
{{ item.publish_year }} - 期刊:
- 影响因子:{{ item.factor }}
- 作者:
{{ item.authors }} - 通讯作者:
{{ item.author }}
{{ truncateString('上野 隆史', 18)}}的其他基金
複合タンパク質結晶による人工光合成システムの構築
利用复杂蛋白质晶体构建人工光合作用系统
- 批准号:
22KF0138 - 财政年份:2023
- 资助金额:
$ 1.6万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
XFEL-SFXによる化学反応解明を目指した「反応追跡結晶」の構築
构建“反应追踪晶体”,旨在使用 XFEL-SFX 阐明化学反应
- 批准号:
22H00347 - 财政年份:2022
- 资助金额:
$ 1.6万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (A)
複合タンパク質結晶による人工光合成システムの構築
利用复杂蛋白质晶体构建人工光合作用系统
- 批准号:
21F21326 - 财政年份:2021
- 资助金额:
$ 1.6万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
ナノ金クラスターの三次元精密集積による蛋白質ケージ触媒の開発
纳米金团簇三维精密组装开发蛋白质笼催化剂
- 批准号:
13F03343 - 财政年份:2013
- 资助金额:
$ 1.6万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
細胞機能制御を指向したガス吸着蛋白質材料の開発
开发旨在控制细胞功能的气体吸附蛋白材料
- 批准号:
23350080 - 财政年份:2011
- 资助金额:
$ 1.6万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
固体バイオ細孔をテンプレートとする磁性材料合成
以固体生物孔为模板合成磁性材料
- 批准号:
22655054 - 财政年份:2010
- 资助金额:
$ 1.6万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Challenging Exploratory Research
蛋白質超分子ナノチューブを利用した機能分子の創成
使用蛋白质超分子纳米管创建功能分子
- 批准号:
18685019 - 财政年份:2006
- 资助金额:
$ 1.6万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Young Scientists (A)
蛋白質結晶を用いた多細孔材料の創成
使用蛋白质晶体创建多孔材料
- 批准号:
18655054 - 财政年份:2006
- 资助金额:
$ 1.6万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Exploratory Research
蛋白質ケージを用いた金属ナノ微粒子形成機構の解明
使用蛋白质笼阐明金属纳米粒子的形成机制
- 批准号:
17655076 - 财政年份:2005
- 资助金额:
$ 1.6万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Exploratory Research
蛋白質キャビティーを反応場とする新規錯体構築法と機能制御
以蛋白质空腔为反应场的复合体构建新方法及功能控制
- 批准号:
15036229 - 财政年份:2003
- 资助金额:
$ 1.6万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
相似海外基金
Selective and stable protein complex assembly by thermodynamic control of domain swapping
通过结构域交换的热力学控制选择性且稳定的蛋白质复合物组装
- 批准号:
19K05695 - 财政年份:2019
- 资助金额:
$ 1.6万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
Development of structural control of protein oligomers toward cooperation of functional sites
开发蛋白质寡聚物的结构控制以实现功能位点的合作
- 批准号:
16K17935 - 财政年份:2016
- 资助金额:
$ 1.6万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
蛋白質結晶エッチング法による生体高次構造体の創成
使用蛋白质晶体蚀刻方法创建生物高阶结构
- 批准号:
15J11955 - 财政年份:2015
- 资助金额:
$ 1.6万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
New interaction of oxygen binding protein mediating mitochondrial function in skeletal muscle
氧结合蛋白介导骨骼肌线粒体功能的新相互作用
- 批准号:
26282183 - 财政年份:2014
- 资助金额:
$ 1.6万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
Comprehensive analysis for interaction of oxygen binding protein with mitochondrial proteins in skeletal muscle
骨骼肌氧结合蛋白与线粒体蛋白相互作用的综合分析
- 批准号:
25560336 - 财政年份:2013
- 资助金额:
$ 1.6万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Challenging Exploratory Research