新規耐熱性β-ガラクトシダーゼのX線結晶構造解析
新規耐熱性β-ガラクトシダーゼのX線結晶構造解析
批准号:
13760058
负责人:
伏信 進矢
金额:
$1.34万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
财政年份:
2001
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2001 至 2002
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英文摘要
前年度には、新規好熱菌由来β-ガラクトシダーゼ(A4-βGal)の結晶構造を解明することに成功し、nativeおよびガラクトース複合体構造において1.6Åおよび2.2Å分解能の構造がそれぞれ得られた。本構造は、糖質加水分解酵素ファミリー42としては世界初の立体構造であった。本年度は、この構造のさらに詳細な解析と、その結果の国際誌への論文発表を行い、さらに、活性が大幅に上昇した変異体の機能解析・立体構造解析を行った。A4-βGalは植木鉢状の3量体構造をとっており、全体の約20%を占める接触面において強い相互作用で結びついていた。本酵素が産業上有用な酵素である所以であるところの高い耐熱性は、この強力な相互作用によるものであることが推測された。また、活性部位の形成に、隣のサブユニットの残基が関与しており、活性の発現にも3量体化が必要であることが分かった。このように多量体化により活性部位を形成している例は糖質加水分解酵素の中では初めての例であった。なお、ガラクトースの認識機構は、構造既知の大腸菌βガラクトシダーゼとは全く異なっており、新規の基質認識機構が発見された。さらに、A4-βGalの反応機構はアノマー保持機構に従うことを、ファミリー42酵素では初めて、実験的に証明した。しかし、驚くべきことに、本酵素の全体的な立体構造は、本酵素と全く異なる反応機構(アノマー反転機構)に従うβアミラーゼとよく似ていた。従って、本酵素は糖質分解酵素で普遍的に見られる(α/β)8バレルの進化の上で特異な存在であることが明らかになった。これまで、共同研究者の大津らにより、本酵素の活性が大幅に上昇する変異体(P317S, H323Yおよびそれらの2重変異体)が得られていたが、我々はこれらの機能解析により、P317Sでk_<cat>の上昇、H323YでK_mの減少が起こり、2重変異体ではk_<cat>/K_mで約5.5倍の活性上昇が引き起こされることを見いだした。現在、2重変異体で1.8Å分解能の立体構造を得ており、変異の導入に伴う構造変化が活性中心残基へ伝わることにより、活性の上昇が引き起こされることを見いだしている。本研究の成果の一部は、「応用糖質科学誌」、Journal of Molecular Biology、「構造生物」に掲載された。現在、活性の上昇した変異体の機能・構造解析に関する論文の投稿を準備中である。
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日高 將文: "Thermus thermophilus A4株由来・新規耐熱性β-ガラクトシダーゼ及び基質複合体のX線結晶構造解析"応用糖質科学(Journal of Applied Glycoscience). 49巻2号. 175-180 (2002)
Masafumi Hidaka:“来自嗜热栖热菌 A4 菌株的新型耐热 β-半乳糖苷酶和底物复合物的 X 射线晶体结构分析”,《应用糖科学杂志》,第 49 卷,第 2 期,第 175-180 期(2002 年)。
DOI:
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发表时间:
期刊:
影响因子:
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作者:
[]
通讯作者:
伏信 進矢: "糖質加水分解酵素のバレル構造:ファミリー42と57のX線結晶構造解析"構造生物. 8巻3号. 6-15 (2003)
Shinya Fusinobu:“碳水化合物水解酶的桶结构:家族 42 和 57 的 X 射线晶体结构分析”《结构生物学》第 8 卷,第 3. 6-15 期(2003 年)。
DOI:
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发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
M.Hidaka: "Trimeric crystal structure of the glycoside hydrolase family 42 beta-galactosidase from Thermus thermophilus A4 and the structure of its complex with galactose"Journal of Molecular Biology. 322巻1号. 79-91 (2002)
M. Hidaka:“来自嗜热栖热菌 A4 的糖苷水解酶家族 42 β-半乳糖苷酶的三聚体晶体结构及其与半乳糖的复合物的结构”,《分子生物学杂志》,第 322 期,第 1. 79-91 期(2002 年)。
DOI:
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发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
日高將文: "Thermus Thermophilus A4株由来・新規耐熱性β-ガラクトシダーゼ及び基質複合体のX線結晶構造解析"応用糖質科学(Journal of Applied Glycoscience). 49巻2号(掲載予定). (2002)
Masafumi Hidaka:“源自嗜热菌 A4 菌株的新型耐热 β-半乳糖苷酶和底物复合物的 X 射线晶体结构分析”《应用糖科学杂志》第 49 卷,第 2 期(待出版)。
DOI:
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发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
Understanding the Intestinal Survival Strategy of Altruistic Bifidobacteria by Human Glycan Binding from the Molecular Structure
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批准号:23H00322
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (A)
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资助金额:$29.7万
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财政年份:2023
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负责人:伏信 進矢
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依托单位:
Molecular analysis of mirror-arabinan present in cell wall polysaccharides of Mycobacteria and its degrading enzymes
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批准号:19H00929
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (A)
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资助金额:$28.95万
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财政年份:2019
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负责人:伏信 進矢
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依托单位:
βガラクトシドのプレバイオティクス機能解明にむけたβガラクトシダーゼの構造解析
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批准号:15F15091
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项目类别:Grant-in-Aid for JSPS Fellows
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资助金额:$1.47万
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财政年份:2015
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负责人:伏信 進矢
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依托单位:
特異な反応・基質認識機構を有する糖質関連酵素の構造機能研究
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批准号:17780079
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项目类别:Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
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资助金额:$2.3万
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财政年份:2005
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负责人:伏信 進矢
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依托单位:
構造未知ファミリーに属する糖質分解・転移酵素のX線結晶構造解析
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批准号:15780067
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项目类别:Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
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资助金额:$2.5万
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财政年份:2003
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负责人:伏信 進矢
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依托单位:
X線結晶解析に基づく白麹菌キシラナーゼの好酸性・耐酸性機構の解明
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批准号:11760054
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项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
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资助金额:$1.47万
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财政年份:1999
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负责人:伏信 進矢
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依托单位:
海外基金