構造未知ファミリーに属する糖質分解・転移酵素のX線結晶構造解析
構造未知ファミリーに属する糖質分解・転移酵素のX線結晶構造解析
批准号:
15780067
负责人:
伏信 進矢
金额:
$2.5万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
财政年份:
2003
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2003 至 2004
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英文摘要
最終的に3種の新規な立体構造を決定することに成功し、それらの結晶化および結晶構造に関する国際誌への投稿論文を4報発表した(J.Biol.Chem.,Strcture, Acta Cryst)。また、研究成果を日本農芸化学会大会、応用糖質科学会などの国内学会で発表した。さらに、国際学会でも発表予定である。GH-54α-L-アラビノフラノシダーゼは、分解能約1.8ÅでMIR法により構造決定した。本構造は同ファミリーでは世界初の立体構造であり、触媒ドメインと糖質結合ドメインに分かれることが分かった。触媒ドメインは、既知の酵素とは大きく異なるフォールドを取っていたが、反応産物との複合体構造と変異体解析により、活性中心を特定できた。一方、糖質結合ドメインは基質の側鎖のみを認識することが明らかになり、このドメインの新規な構造・機能および存在普遍性から、新たな糖質結合ドメイン(CBM42)と認定された。現在、CBM-42の機能解析に関する投稿論文を準備中である。GT-36キトビオースホスホリラーゼの結晶構造は、1.6Å分解能でMAD法により決定した。本構造も、同ファミリーでは世界初の立体構造であった。また、基質との複合体構造から、反転型加リン酸分解酵素の反応機構が解明された。本酵素の立体構造と反応機構は、数種の糖加水分解酵素と有意な相同性を示すことが明らかになったために、GT-36は糖転移酵素群から糖加水分解酵素群の新たなファミリーであるGH-94に再分類されることが決定した。さらに、同ファミリーに属するもう一つの酵素(セロビオースホスホリラーゼ)も、分解能2.1ÅでMR法により立体構造を決定し、活性中心の詳細を明らかにした。現在、これらの酵素の基質特異性の変換を目指した変異体を作成中である。
期刊论文(5)
专著(0)
科研奖励(0)
会议论文
Expression, purification, crystallization and preliminary X-ray analysis of α-L-arabinofuranosidase B from Aspergillus kawachii
白曲霉α-L-阿拉伯呋喃糖苷酶 B 的表达、纯化、结晶和初步 X 射线分析
DOI:
--
发表时间:
2004
期刊:
Acta Cryst. D60(7)
影响因子:
--
作者:
[M.Hidaka et al., A.Miyanaga et al.]
通讯作者:
A.Miyanaga et al.
Crystallization and preliminary X-ray analysis of cellobiose phosphorylase from Cellvibrio gilvus
绿色细胞弧菌纤维二糖磷酸化酶的结晶和初步 X 射线分析
DOI:
--
发表时间:
2004
期刊:
Acta Cryst. D60(10)
影响因子:
--
作者:
[M.Hidaka et al., A.Miyanaga et al., M.Hidaka et al.]
通讯作者:
M.Hidaka et al.
DOI:
10.1074/jbc.m405390200
发表时间:
2004-10-22
期刊:
JOURNAL OF BIOLOGICAL CHEMISTRY
影响因子:
4.8
作者:
[Miyanaga, A, Koseki, T, Fushinobu, S]
通讯作者:
Fushinobu, S
Understanding the Intestinal Survival Strategy of Altruistic Bifidobacteria by Human Glycan Binding from the Molecular Structure
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批准号:23H00322
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (A)
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资助金额:$29.7万
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财政年份:2023
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负责人:伏信 進矢
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依托单位:
Molecular analysis of mirror-arabinan present in cell wall polysaccharides of Mycobacteria and its degrading enzymes
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批准号:19H00929
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (A)
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资助金额:$28.95万
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财政年份:2019
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负责人:伏信 進矢
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依托单位:
βガラクトシドのプレバイオティクス機能解明にむけたβガラクトシダーゼの構造解析
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批准号:15F15091
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项目类别:Grant-in-Aid for JSPS Fellows
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资助金额:$1.47万
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财政年份:2015
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负责人:伏信 進矢
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依托单位:
特異な反応・基質認識機構を有する糖質関連酵素の構造機能研究
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批准号:17780079
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项目类别:Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
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资助金额:$2.3万
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财政年份:2005
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负责人:伏信 進矢
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依托单位:
新規耐熱性β-ガラクトシダーゼのX線結晶構造解析
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批准号:13760058
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项目类别:Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
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资助金额:$1.34万
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财政年份:2001
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负责人:伏信 進矢
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依托单位:
X線結晶解析に基づく白麹菌キシラナーゼの好酸性・耐酸性機構の解明
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批准号:11760054
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项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
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资助金额:$1.47万
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财政年份:1999
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负责人:伏信 進矢
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依托单位: