有機フッ素化合物のバイオコンバージョン:フッ素脱離・導入の酵素触媒機構と応用
有機フッ素化合物のバイオコンバージョン:フッ素脱離・導入の酵素触媒機構と応用
批准号:
14703021
负责人:
栗原 達夫
金额:
$18.39万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Young Scientists (A)
财政年份:
2002
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2002 至 2004
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1.フルオロ酢酸デハロゲナーゼの構造と機能フルオロ酢酸デハロゲナーゼはフルオロ酢酸の加水分解的脱ハロゲン反応を触媒し、グリコール酸を与える。脂肪族フッ素化合物の強固な炭素-フッ素結合の切断を触媒する唯一の既知酵素である。本酵素はフルオロ酢酸を最も良好な基質とするが、クロロ酢酸にも、その4%の活性を示す。本酵素反応では、触媒中心アスパラギン酸残基の側鎖カルボキシル基が基質のα-炭素を求核攻撃し、ハライドイオンが脱離するとともに、酵素と基質が共有結合したエステル中間体が生成する。続いてヒスチジン残基が活性化した水分子によって中間体が加水分解され、グリコール酸が遊離するとともに、触媒中心アスパラギン酸残基が再生する。本研究では、Burkholderia sp.FA1が生産する本酵素の構造と機能を解析した。結晶構造解析によって活性部位に存在することが示されたアミノ酸残基を部位特異的変異法で改変し、触媒能への影響を調べた。触媒中心のAsp104、His271のほか、これらの近傍に存在するArg105、His149、Arg108、Tyr147、Phe34、Tyr212、Phe272、His103をアラニン残基に改変すると、フルオロ酢酸とクロロ酢酸のいずれに対する活性も消失した。一方、Trp150をアラニン残基に改変した酵素では、クロロ酢酸に対する活性は野生型酵素の71%残存したにもかかわらず、フルオロ酢酸に対する活性は完全に消失した。Trp150はフッ化物イオンの脱離に必須の役割を果たすことが示された。2.2-ハロアクリル酸レダクターゼの発見と機能解析2-クロロアクリル酸資化性菌Burkholderia sp.WSが、NADPHを還元剤として2-ハロアクリル酸の不斉還元を触媒する新奇酵素2-ハロアクリル酸レダクターゼを生産することを明らかにした。本酵素と補酵素再生系を組み合わせることにより、除草剤の原料として有用な(S)-2-クロロプロピオン酸を効率よく生産することに成功した。
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N-Methyl-L-amino acid dehydrogenase from Pseudomonas putida.A novel member of an unusual NAD(P)-dependent oxidoreductase superfamily
来自恶臭假单胞菌的 N-甲基-L-氨基酸脱氢酶。不寻常的 NAD(P) 依赖性氧化还原酶超家族的新成员
DOI:
--
发表时间:
2005
期刊:
FEBS J. 272・5
影响因子:
--
作者:
[Mihara, Hisaaki et al.]
通讯作者:
Hisaaki et al.
Ichiyama, Susumu et al.: "Catalysis-linked inactivation of fluoroacetate dehalogenase by ammonia : a novel approach to probe the active-site environment"J. Biochem.. 131・5. 671-677 (2002)
Ichiyama, Susumu 等:“氨对氟乙酸脱卤酶的催化相关灭活:探测活性位点环境的新方法” J. Biochem.. 131・5 (2002)。
DOI:
--
发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
2-Haloacrylate reductase : A novel enzyme of the medium-chain dehydorogenase/reductase superfamily that catalyzes the reduction of a carbon-carbon double bond of unsaturated organohalogen compounds
2-卤代丙烯酸酯还原酶:中链脱氢酶/还原酶超家族的一种新型酶,可催化不饱和有机卤素化合物碳-碳双键的还原
DOI:
--
发表时间:
2005
期刊:
J.Biol.Chem. (In press)
影响因子:
--
作者:
[Kurata, Atsushi et al.]
通讯作者:
Atsushi et al.
Kurihara, Tatsuo at al.: "Purification, characterization, and gene cloning of a novel fluoroacetate dehalogenase from Burkholderia sp. FA1"J.Mol.Catal.B : Enzym.. 23. 347-355 (2003)
Kurihara, Tatsuo 等人:“来自伯克霍尔德菌属 FA1 的新型氟乙酸脱卤酶的纯化、表征和基因克隆”J.Mol.Catal.B : Enzym.. 23. 347-355 (2003)
DOI:
--
发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
Park, Chung et al.: "A new DL-2-haloacid dehalogenase acting on 2-haloacid amides : purification, characterization, and mechanism"J. Mol. Catal. B : Enzym.. (In press). (2003)
Park, Chung 等人:“一种作用于 2-卤代酰胺的新型 DL-2-卤代酸脱卤酶:纯化、表征和机制”J.
DOI:
--
发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
Enzymatic manipulation of biomembrane lipids to enhance cellular function
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批准号:23K17991
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项目类别:Grant-in-Aid for Challenging Research (Exploratory)
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资助金额:$4.16万
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财政年份:2023
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负责人:栗原 達夫
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依托单位:
Molecular basis for generation of the diversity of bacterial membrane phospholipid acyl chains and mechanisms underlying their physiological functions
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批准号:21H02102
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
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资助金额:$10.98万
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财政年份:2021
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负责人:栗原 達夫
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依托单位:
Dissection of the molecular basis of membrane vesicle biogenesis and construction of an extracellular platform for substance production by using a hyper-vesiculating bacterium
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批准号:20K20570
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项目类别:Grant-in-Aid for Challenging Research (Pioneering)
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资助金额:$16.64万
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财政年份:2020
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负责人:栗原 達夫
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依托单位:
封入体形成を抑制する低温タンパク質生産システムの開発
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批准号:16658044
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项目类别:Grant-in-Aid for Exploratory Research
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资助金额:$2.3万
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财政年份:2004
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负责人:栗原 達夫
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依托单位:
含硫黄・含セレンバイオファクターの構造形成を司る類縁酵素群の構造・機能・役割分担
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批准号:12780470
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项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
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资助金额:$1.41万
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财政年份:2000
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负责人:栗原 達夫
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依托单位:
フルオロ酢酸デハロゲナーゼによる炭素-フッ素結合の切断機構
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批准号:08760080
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项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
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资助金额:$0.7万
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财政年份:1996
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负责人:栗原 達夫
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依托单位:
2-ハロ酸デハロゲナーゼの構造と反応機構の解析、それに基づく酵素機能の改変
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批准号:07780535
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项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
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资助金额:$0.7万
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财政年份:1995
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负责人:栗原 達夫
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依托单位:
微生物のハロ酸デハロゲナーゼの分子生物学的研究と応用
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批准号:05760069
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项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
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资助金额:$0.58万
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财政年份:1993
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负责人:栗原 達夫
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依托单位:
海外基金