放射光を利用した真空紫外円二色性分散計の開発と生体分子構造解析への応用

同步辐射真空紫外圆二色性色散计的研制及其在生物分子结构分析中的应用

• 批准号: 03J08237
• 负责人: 松尾 光一
• 金额: $ 1.15万
• 依托单位: Hiroshima University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for JSPS Fellows
• 财政年份: 2003
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2003 至 2004
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-03J08237/
• 关键词: 放射光; 真空紫外円二色性; 糖類; タンパク質; 二次構造解析

広島大学放射光科学研究センターのBL-15を放射光源とした真空紫外円二色性(VUVCD)分散計を利用し,各種糖類とタンパク質(天然状態)のVUVCDスペクトルを160nmまで、変性状態のタンパク質を172nmまで測定した。6つのグルコースのα,1-4グリコシド結合から成るマルトヘキソースとα-シクロデキストリンの測定から、CDはオリゴ糖の線形と環状構造の違いを敏感に反映することがわかった。また、構成するグルコースの数が異なるα,β,γ-シクロデキストリンの比較により、糖鎖の長さに対するCDの依存性が確認された。各種コンドロイチンの測定から、硫酸基やカルボキシル基の位置や配位がVUVCDスペクトルに大きく影響することがわかった。31種類のタンパク質のVUVCDスペクトル測定から、真空紫外領域において各二次構造(α-helix、β-sheet、turn、unordered structure)に特徴的なピークが観測された。測定した31種類の基底タンパク質のVUVCDデータと二次構造データを、特異値分解法を用いたSELCON3プログラムに組み込むことにより二次構造解析を行った。その結果、測定波長領域の拡張や基底タンパク質の増加と最適な選択により予測精度が格段に向上した。これにより高精度な二次構造解析法が確立できた。Metmyoglobin(pH3.9)、thioredoxin(pH1.8)、staphylococcal nuclease(pH3.8)の酸・熱・低温変性状態のVUVCDスペクトルを用いた二次構造解析から、metmyoglobinで各変性状態の構造の違いが予測された。また、数十%のβ-sheetが各タンパク質の変性状態で形成または維持されていることが示唆された。以上の結果は、VUVCD分光法が、生体分子の構造解析に対して有効であることを示している。

The university radiation science research, BL-15 radiation light source, vacuum ultraviolet dichroism (VUVCD) dispersion program, various sugars (natural state), VUVCD (natural state), 160nm, 172nm, and so on. The combination of 6-4-year-old, 1-4-year-old compounds is used to determine the temperature, the temperature, the temperature, Please tell me how many times you need to know that your CD is dependent on your sugar content. All kinds of equipment are used to determine the temperature, the sulfuric acid base, the base position, the coordination, the VUVCD, the temperature, the temperature and the temperature. 31. In the field of vacuum Ultraviolet (VUV), there are two kinds of equipment (α-helix, β-sheet, turn, unordered structure) in the field of vacuum Ultraviolet (VUV), which are used in the field of vacuum ultraviolet. In order to determine the basic information system (such as 31), the VUVCD system is used for secondary analysis, and the special decomposition method is used to analyze the data for the second time. The result of the experiment, the measurement of the wave length in the field of measurement, the base layer of the wave length, and the selection of the most accurate range of accuracy. In order to ensure the accuracy of the secondary analytical method of high precision. Metmyoglobin (pH3.9), thioredoxin (pH1.8), staphylococcal nuclease (pH3.8), low temperature, low temperature, VUVCD, temperature, temperature and temperature. The characteristics of β-sheet and dozens of% of β-PAHs show that they are instigated and maintained. The results of the above results, VUVCD spectrophotometry and biological molecular analysis show that there is no significant difference between the two groups.

项目成果

Structure Analyses of Biomolecules using Synchrotron Radiation Circular Dichroism Spectrophotometer

使用同步辐射圆二色分光光度计进行生物分子结构分析

• 发表时间: 2005
• 期刊: J.Electron Spectros.Relat.Phenomena 144-147
• 作者: Bernard Juskowiak;Shigeori Takenaka;Michio Iwaoka;岩岡 道夫;Michio Iwaoka;Michio Iwaoka;岩岡 道夫;宮野 悟;Koichi Matsuo;Eiji Ohmae;Takayuki Fukuyama;Koichi Matsuo;Kunihiko Gekko
• 通讯作者: Kunihiko Gekko

松尾 光一: "Secondary-Structure Analysis of Proteins by Vacuum-Ultraviolet Circular Dichroism Spectroscopy"The Journal of Biochemistry. 135. 405-411 (2004)

Koichi Matsuo：“真空紫外圆二色光谱法对蛋白质的二级结构分析”生物化学杂志 135. 405-411 (2004)

放射光真空紫外円二色性分散計による生体分子の構造解析

利用同步辐射真空紫外圆二色性色散计进行生物分子结构分析

• 发表时间: 2004
• 期刊: 日本放射光学会誌 17
• 作者: 月向邦彦

Vacuum-Ultraviolet Circular Dichroism Spectrophotometer using Synchrotron Radiation

使用同步辐射的真空紫外圆二色分光光度计

• 发表时间: 2005
• 期刊: J.Electron Spectros.Relat.Phenomena 144-147
• 作者: Bernard Juskowiak;Shigeori Takenaka;Michio Iwaoka;岩岡 道夫;Michio Iwaoka;Michio Iwaoka;岩岡 道夫;宮野 悟;Koichi Matsuo;Eiji Ohmae;Takayuki Fukuyama;Koichi Matsuo
• 通讯作者: Koichi Matsuo

松尾 光一: "Vacuum-Ultraviolet Circular Dichroism Study of Saccharides by Synchrotron Radiation Spectrophotometry"Carbohydrate Research. 339. 591-597 (2004)

Koichi Matsuo：“通过同步辐射分光光度法进行糖类的真空紫外圆二色性研究”碳水化合物研究 339. 591-597 (2004)。