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放射光を利用した真空紫外円二色性分散計の開発と生体分子構造解析への応用

放射光を利用した真空紫外円二色性分散計の開発と生体分子構造解析への応用
同步辐射真空紫外圆二色性色散计的研制及其在生物分子结构分析中的应用
批准号:
03J08237
负责人:
松尾 光一
金额:
$1.15万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
财政年份:
2003
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2003 至 2004

项目摘要

项目成果

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広島大学放射光科学研究センターのBL-15を放射光源とした真空紫外円二色性(VUVCD)分散計を利用し,各種糖類とタンパク質(天然状態)のVUVCDスペクトルを160nmまで、変性状態のタンパク質を172nmまで測定した。6つのグルコースのα,1-4グリコシド結合から成るマルトヘキソースとα-シクロデキストリンの測定から、CDはオリゴ糖の線形と環状構造の違いを敏感に反映することがわかった。また、構成するグルコースの数が異なるα,β,γ-シクロデキストリンの比較により、糖鎖の長さに対するCDの依存性が確認された。各種コンドロイチンの測定から、硫酸基やカルボキシル基の位置や配位がVUVCDスペクトルに大きく影響することがわかった。31種類のタンパク質のVUVCDスペクトル測定から、真空紫外領域において各二次構造(α-helix、β-sheet、turn、unordered structure)に特徴的なピークが観測された。測定した31種類の基底タンパク質のVUVCDデータと二次構造データを、特異値分解法を用いたSELCON3プログラムに組み込むことにより二次構造解析を行った。その結果、測定波長領域の拡張や基底タンパク質の増加と最適な選択により予測精度が格段に向上した。これにより高精度な二次構造解析法が確立できた。Metmyoglobin(pH3.9)、thioredoxin(pH1.8)、staphylococcal nuclease(pH3.8)の酸・熱・低温変性状態のVUVCDスペクトルを用いた二次構造解析から、metmyoglobinで各変性状態の構造の違いが予測された。また、数十%のβ-sheetが各タンパク質の変性状態で形成または維持されていることが示唆された。以上の結果は、VUVCD分光法が、生体分子の構造解析に対して有効であることを示している。
期刊论文(5)
专著(0)
科研奖励(0)
会议论文
Structure Analyses of Biomolecules using Synchrotron Radiation Circular Dichroism Spectrophotometer
使用同步辐射圆二色分光光度计进行生物分子结构分析
DOI: --
发表时间: 2005
期刊: J.Electron Spectros.Relat.Phenomena 144-147
影响因子: --
作者: [Bernard Juskowiak, Shigeori Takenaka, Michio Iwaoka, 岩岡 道夫, Michio Iwaoka, Michio Iwaoka, 岩岡 道夫, 宮野 悟, Koichi Matsuo, Eiji Ohmae, Takayuki Fukuyama, Koichi Matsuo, Kunihiko Gekko]
通讯作者: Kunihiko Gekko
松尾 光一: "Secondary-Structure Analysis of Proteins by Vacuum-Ultraviolet Circular Dichroism Spectroscopy"The Journal of Biochemistry. 135. 405-411 (2004)
Koichi Matsuo:“真空紫外圆二色光谱法对蛋白质的二级结构分析”生物化学杂志 135. 405-411 (2004)
DOI: --
发表时间:
期刊:
影响因子: --
作者: []
通讯作者:
放射光真空紫外円二色性分散計による生体分子の構造解析
利用同步辐射真空紫外圆二色性色散计进行生物分子结构分析
DOI: --
发表时间: 2004
期刊: 日本放射光学会誌 17
影响因子: --
作者: [月向邦彦]
通讯作者: 月向邦彦
Vacuum-Ultraviolet Circular Dichroism Spectrophotometer using Synchrotron Radiation
使用同步辐射的真空紫外圆二色分光光度计
DOI: --
发表时间: 2005
期刊: J.Electron Spectros.Relat.Phenomena 144-147
影响因子: --
作者: [Bernard Juskowiak, Shigeori Takenaka, Michio Iwaoka, 岩岡 道夫, Michio Iwaoka, Michio Iwaoka, 岩岡 道夫, 宮野 悟, Koichi Matsuo, Eiji Ohmae, Takayuki Fukuyama, Koichi Matsuo]
通讯作者: Koichi Matsuo
左右対称性の骨格が形成される細胞機構の理解に向けて
  • 批准号:
    23K21467
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
  • 资助金额:
    $1.08万
  • 财政年份:
    2024
  • 负责人:
    松尾 光一
  • 依托单位:
Conformation of protein bound to membrane characterized by time-resolved vacuum-ultraviolet circular dichroism spectroscopy
  • 批准号:
    22K06163
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
  • 资助金额:
    $2.66万
  • 财政年份:
    2022
  • 负责人:
    松尾 光一
  • 依托单位:
Understanding the cellular basis of left-right symmetry in the skeleton
  • 批准号:
    21H03060
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
  • 资助金额:
    $11.15万
  • 财政年份:
    2021
  • 负责人:
    松尾 光一
  • 依托单位:
放射光真空紫外円二色性による蛋白質の精密構造解析
  • 批准号:
    22870021
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Research Activity Start-up
  • 资助金额:
    $2.0万
  • 财政年份:
    2010
  • 负责人:
    松尾 光一
  • 依托单位:
海外基金