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放射光真空紫外円二色性による生体分子の構造解析

利用同步加速器真空紫外圆二色性进行生物分子结构分析

基本信息

批准号：
18750151
负责人：
松尾光一
金额：
$ 2.18万
依托单位：
Hiroshima University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
财政年份：
2006
资助国家：
日本
起止时间：
2006 至 2007
项目状态：
已结题

项目摘要

広島大学放射光科学研究センターの真空紫外円二色性(VUVCD)分散計を用い,多糖類や変性タンパク質のVUVCDスペクトルを測定し、VUVCD分光法の生体分子構造解析への有用性を検討した。硫酸基やカルボキシル基を持つ6種類の多糖類(コンドロイチン・コンドロイチン硫酸(A, B, C)・ヒアルロン酸・ヘパリン)のVUVCDスペクトルを160nmまで行い、これら発色団の位置や配向に依存した特徴的なCDを得ることができた。また、分光学的解析法からCDと多糖類の立体構造との関係を明らかにすると共に、単糖類と同様に多糖類においてもC-5位のヒドロキシメチル基の平衡状態(トランス・ゴーシュ)の変化が、CDに大きく寄与していることが分かった。3種類のタンパク質(Metmyoglobin・thioredoxin・staphylococcal nuclease)の酸・熱・低温変性状態のVUVCDスペクトルを172nmまで測定し、塩酸グアニジン変性状態との比較からこれら変性状態においても多くの二次構造が保持されていることが分かった。31種類の天然タンパク質のVUVCDスペクトルを参照データとし、プログラムSELCON3で二次構造解析をした結果、天然状態に比べHelixは減少、Strand・PPII・Unorderedは増加することが確認された。また、これらの変性状態には、水素結合を持たないStrand構造が多く存在していることが明らかとなった。以上の結果から、VUVCD分光法が、生体分子の構造解析に対して有効であることが示された。

Hiroshima University Radiation Science Research Laboratory of Vacuum Ultraviolet Dichroism (VUVCD) Dispersion Meter, Polysaccharide Dispersion Meter The usefulness of VUVCD spectroscopy in biomolecular structure analysis and analysis of biomolecular structure by VUVCD spectrometry is as follows. Six types of sulfate-based polysaccharides (コンドロイチン・コンドロイチンsulfate (A, B, C)・ヒアルロン acid・ヘパリン)のVUVCDスペクトルを160nmまで行い、これら発色団の Position やalignment にdepends した特徴的なCDを得ることができた.また、Spectroscopic analysis method からCDとThe three-dimensional structure of polysaccharides and the relationship between them -The balance state of the 5-bit のヒドロキシメチルbase (トランス・ゴーシュ)の変化が, CDに大きく发 and していることが分かった. 3 types of metmyoglobin・thioredoxin・staphylococcal nuclease) acid, heat, low temperature changing state of VUVCD test 172nm test test, acid test testニジン変性STATEとのComparisonからこれら変性STATEにおいても多くのSecondary structureがKEEP されていることが分かった. 31 kinds of natural materials, VUVCD, スペクトルを, refer to データとし, プログラムSELCON3でSecondary structure analysisをしたAs a result, the natural state is reduced compared to Helix, and Strand・PPII・Unordered is increased and confirmed.また, これらの変性state には, water element combined をhold たないStrand structure が多くexistent していることが明らかとなった. The above results are valid and effective based on VUVCD spectroscopy and structural analysis of biological molecules.