T2-MITE転移因子の大量増幅・転移機構に関する研究

T2-MITE转座元件的质量扩增及易位机制研究

• 批准号: 15770001
• 负责人: 彦坂 暁
• 金额: $ 2.37万
• 依托单位: Hiroshima University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
• 财政年份: 2003
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2003 至 2004
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-15770001/
• 关键词: MITE; Xenopus; T2-family; Transposon; Transposase; Terminal Inverted Repeat (TIR); T2 family

T2-MITE転移因子の転移に関係することが予想されるpiggyBac転移酵素遺伝子をアフリカツメガエル(Xenopus laevis)から2種類単離し、mRNAをin vitroで合成した。T2-MITEの1種であるXmixを挿入したプラスミドDNAを、この合成mRNAとともにアフリカツメガエル卵母細胞に顕微注入した。一晩培養したのち、DNAを抽出し、ベクターからのT2-MITEの切り出しが起きているかをPCR法により調べたが、切り出しは確認されなかった。そこで、(1)転移酵素が変異の蓄積によって不活性化している可能性があるので、近縁種から新たなpiggyBac転移酵素遺伝子を単離し、それらとの比較解析によってその可能性を検討する、(2)piggyBac転移酵素自身のTerminal Inverted Repeat (TIR)を単離し、これを用いて再度活性を調べる、(3)T2-MITEの転移に関連する他の転移酵素がゲノム中に存在する可能性をデータベース解析によって検討する、という3つの方向で研究を進めた。(1)については、X.tropicalisから新しいタィプの2種類のpiggyBac転移酵素遺伝子をPCRにより単離し、既知の転移酵素遺伝子との比較解析を行なった。(2)については、X.tropicalisゲノムデータベースの解析からTIRのコンセンサス配列を見いだし、これをプライマーに用いて、X.laevisとX.tropicalisからPCRによってTIRを単離した。(3)については、MITEのTIRの間に転移酵素が採まれた構造をもつ配列をデータベースから網羅的に探索するプログラムを作成し、X.tropicalisとゼブラフイッシュからT2-MITEのTIRの間にある転移酵素候補配列を見いだし、これらについてより詳しい解析を行なった。

Move move T2 - MITE planning factor の planning に masato is す る こ と が to think さ れ る piggyBac heritage planning shift enzyme 伝 son を ア フ リ カ ツ メ ガ エ ル (Xenopus laevis) か ら 2 kinds 単 し, mRNA を in vitro で synthetic し た. 1 T2 - MITE の で あ る Xmix を scions into し た プ ラ ス ミ ド DNA を, こ の synthesis mRNA と と も に ア フ リ カ ツ メ ガ エ ル oocytes に 顕 micro injection し た. A rainy night training し た の ち し, pump, DNA を ベ ク タ ー か ら の T2 - MITE の り cutting out し が up き て い る か を PCR method に よ り adjustable べ た が, cut り し は confirm さ れ な か っ た. そ こ で が, (1) planning enzyme - different の accumulation に よ っ て not activeness し て い る possibility が あ る の で, nearly try か ら new た な piggyBac heritage planning shift enzyme 伝 son を 単 し, そ れ ら と の comparative analytic に よ っ て そ の possibility を beg す 検 る, (2) piggyBac planning shift enzyme itself の Terminal Inverted Repeat (TIR) を 単 し, こ れ を with い て activity を adjustment again べ る, (3) T2 - MITE の planning move に masato even す る he の planning shift enzyme が ゲ ノ ム に exist す る possibility を デ ー タ ベ ー ス parsing に よ っ て beg す 検 る, と い う 3 つ の direction を で research into め た. (1) に つ い て は, X.t ropicalis か ら new し い タ ィ プ の 2 kinds の piggyBac heritage planning shift enzyme 伝 son を PCR に よ り 単, both from し の heritage planning shift enzyme 伝 son と の comparative analytical line を な っ た. (2) に つ い て は, X.t ropicalis ゲ ノ ム デ ー タ ベ ー ス の parsing か ら TIR の コ ン セ ン サ ス go see を い だ し, こ れ を プ ラ イ マ ー に with い て, X.l aevis と X.t ropicalis か ら PCR に よ っ て TIR を 単 from し た. (3) に つ い て は, MITE の TIR の に between planning が shift enzyme by ま れ た tectonic を も つ match column を デ ー タ ベ ー ス か ら snare に explore す る プ ロ グ ラ ム を make し, X.t ropicalis と ゼ ブ ラ フ イ ッ シ ュ か ら T2 - MITE の TIR の between に あ る planning alternate with shift enzyme column を see い だ し, こ れ ら に Youdaoplaceholder0 てよ を detailed explanation of を line なった.