ラディキシンFERMドメインと三量体Gタンパク質αサブユニットの複合体結晶解析
ラディキシンFERMドメインと三量体Gタンパク質αサブユニットの複合体結晶解析
批准号:
15770068
负责人:
北野 健
金额:
$2.3万
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
财政年份:
2003
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2003 至 2004
中文摘要
本研究では,ERM (ezrin/radixin/moesin)タンパク質のひとつであるラディキシンのFERMドメインと,三量体Gタンパク質αサブユニットの複合体を調製・共結晶化し,その複合体構造を決定することを目的とした研究をおこなった。前年度に,GαとFERMドメインを複合体形成させた状態で精製することを試みたが,Gαが不溶化してしまう問題を解決することができなかった。そこで,Gαを全長ではなく,FERMドメインと相互作用する部位のみを切り出して発現させることを試みた。特定の二次構造を形成しておらず,フレキシブルと考えられる部位については,ペプチド合成による試料調製をおこなった。これらのGαドメインおよびペプチドと,前年度に精製したFERMドメインを用いて,プルダウンおよび表面プラズモン共鳴センサーによる分子間結合実験をおこなった。その結果,細胞内シグナル伝達における結合能として妥当と考えられる結合を観測することができた。ふたつのタンパク質を用いた共結晶化実験を行ったところ,複合体の結晶はまだ得られていないが,FERMドメインの単体が2量体形成した新しい結晶系の結晶を得ることができた。SPring-8でX線回折実験をおこない,分解能2.9Åのフルデータを収集した。分子置換法による位相決定をおこない,構造の精密化をおこなった結果,信頼度因子R/R_<free>=25/28%の立体構造を決定することができた。現在,論文を投稿準備中である。また,ゲノムの安定性を維持するのに重要なヒト由来のタンパク質複合体であるFEN1-PCNAと,細菌A.xylanus由来の過酸化物分解酵素ペルオキシレドキシンン(AhpC)の結晶構造解析に成功し,それぞれを国際科学雑誌にて発表した。
英文摘要
本研究では,ERM (ezrin/radixin/moesin)タンパク質のひとつであるラディキシンのFERMドメインと,三量体Gタンパク質αサブユニットの複合体を調製・共結晶化し,その複合体構造を決定することを目的とした研究をおこなった。前年度に,GαとFERMドメインを複合体形成させた状態で精製することを試みたが,Gαが不溶化してしまう問題を解決することができなかった。そこで,Gαを全長ではなく,FERMドメインと相互作用する部位のみを切り出して発現させることを試みた。特定の二次構造を形成しておらず,フレキシブルと考えられる部位については,ペプチド合成による試料調製をおこなった。これらのGαドメインおよびペプチドと,前年度に精製したFERMドメインを用いて,プルダウンおよび表面プラズモン共鳴センサーによる分子間結合実験をおこなった。その結果,細胞内シグナル伝達における結合能として妥当と考えられる結合を観測することができた。ふたつのタンパク質を用いた共結晶化実験を行ったところ,複合体の結晶はまだ得られていないが,FERMドメインの単体が2量体形成した新しい結晶系の結晶を得ることができた。SPring-8でX線回折実験をおこない,分解能2.9Åのフルデータを収集した。分子置換法による位相決定をおこない,構造の精密化をおこなった結果,信頼度因子R/R_<free>=25/28%の立体構造を決定することができた。現在,論文を投稿準備中である。また,ゲノムの安定性を維持するのに重要なヒト由来のタンパク質複合体であるFEN1-PCNAと,細菌A.xylanus由来の過酸化物分解酵素ペルオキシレドキシンン(AhpC)の結晶構造解析に成功し,それぞれを国際科学雑誌にて発表した。
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DOI:
10.1002/prot.20412
发表时间:
2005-05-15
期刊:
PROTEINS-STRUCTURE FUNCTION AND BIOINFORMATICS
影响因子:
2.9
作者:
[Kitano, K, Kita, A, Miki, K]
通讯作者:
Miki, K
DOI:
10.1038/sj.emboj.7600519
发表时间:
2005-02-23
期刊:
EMBO JOURNAL
影响因子:
11.4
作者:
[Sakurai, S, Kitano, K, Hakoshima, T]
通讯作者:
Hakoshima, T
微小重力下でのタンパク質結晶化と放射光による構造解析
微重力下的蛋白质结晶和使用同步辐射的结构分析
DOI:
--
发表时间:
2005
期刊:
日本マイクログラビティ応用学会誌 (未定)
影响因子:
--
作者:
[Kitano, K., 北野 健]
通讯作者:
北野 健
Preparation and crystallization of human flap endonuclease FEN-1 in complex with proliferating-cell nuclear antigen, PCNA.
人皮瓣核酸内切酶 FEN-1 与增殖细胞核抗原 PCNA 复合物的制备和结晶。
DOI:
--
发表时间:
2003
期刊:
Acta Crystallogr.D 59
影响因子:
--
作者:
[Sakurai, S.]
通讯作者:
S.
核内受容体PPARを標的とした新たな魚類の性統御法の開発
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批准号:24K01853
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
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资助金额:$11.81万
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财政年份:2024
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负责人:北野 健
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依托单位:
タンパク質によるグアニン四重鎖の巻き戻し原理の解明
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批准号:18K06181
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
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资助金额:$2.75万
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财政年份:2018
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负责人:北野 健
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依托单位:
温度依存性性決定の分子メカニズム
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批准号:19040021
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$4.1万
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财政年份:2007
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负责人:北野 健
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依托单位:
温度依存性性決定の分子メカニズム
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批准号:17052018
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$4.8万
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财政年份:2005
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负责人:北野 健
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依托单位:
メダカにおける性転換変異体の解析による雌化機構
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批准号:17770054
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项目类别:Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
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资助金额:$2.3万
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财政年份:2005
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负责人:北野 健
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依托单位:
複製・修復のプラットホーム蛋白質の形成する複合体構造
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批准号:17053016
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$2.3万
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财政年份:2005
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负责人:北野 健
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依托单位:
X線結晶構造解析によるタンパク質の構造機能相関の研究
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批准号:98J09605
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项目类别:Grant-in-Aid for JSPS Fellows
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资助金额:$1.73万
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财政年份:1998
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负责人:北野 健
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依托单位:
海外基金