权益分类	功能权益	普通用户	{{item.name}}会员
{{category.name}}	{{benefitItem.name}}

バクテリアの細胞死に関与する蛋白質の構造生物学的研究

参与细菌细胞死亡的蛋白质的结构生物学研究

基本信息

批准号：
15770075
负责人：
鎌田勝彦
金额：
$ 2.3万
依托单位：
The Institute of Physical and Chemical Research
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
财政年份：
2003
资助国家：
日本
起止时间：
2003 至 2004
项目状态：
已结题

来源：
https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-15770075/
关键词：
X線結晶構造解析蛋白質複合体バクテリア細胞死 MazEF YefM YoeB

项目摘要

大腸菌には、その細胞死に関与すると考えられる二つの蛋白質を担うantitoxinとtoxinの遺伝子セットが5種類存在している。申請者は、X線結晶構造解析によって、これらの遺伝子産物複合体の構造学的知見を得ることによって、両蛋白質間の相互作用領域がtoxinの機能にどのように影響しているか、そしてtoxin活性がantitoxinによってどのように中和されるかを研究した。バクテリアの細胞死に関与すると考えられる二つの蛋白質、MazE(antidote), MazF(toxin)、の複合体の結晶化に成功し1.7Å分解能で立体構造解析した。MazE-MazF複合体は2:4のヘテロヘキサマーを構成している。特徴的なMazEのC末端は、隣に配置するMazFダイマーの一方の分子と密接な相互作用を有している。その結合部位は大きく4つ(Site 1-4)にわけられ、特にSite1では、toxinとantidoteに保存された残基間の相互作用がみられる。また、類似Toxinの構造比較から、Antidoteの結合に際してのみ見られるコンフォメーション変化が明らかになった。これまでに得られた分子生物学知見により、toxinの標的蛋白質の認識とantidoteによる不活性化は、addiction systemに保存された共通な機構であることが示唆された。YefM(antidote)とYoeB(toxin)も、バクテリアの細胞死に関わるリボヌクレアーゼであることが示唆されている。申請者は、さらにYefM-YoeB複合体の立体構造を決定した。YoeBはバクテリアに共通して見られるリボヌクレアーゼの構造を有しており、YefMは二量体で一分子のYoeBに結合していた。

E. coli is related to cell death, and there are five kinds of proteins that contain antitoxin and toxin The applicant has been studying the influence of the interaction domain between proteins on the function of toxin and the neutralization of toxin activity in X-ray crystal structure analysis. The crystallization of protein, MazE(antidote), MazF(toxin), and their complexes was successfully resolved by 1.7 μ m decomposition energy. MazE-MazF complex is composed of 2:4 elements. The C-terminal configuration of MazE is characterized by the presence of molecular interactions on one side of MazF The binding sites are large and 4 (Sites 1-4), and the interaction between residues is preserved in Site1, toxin and antidot. The structure comparison of Toxin-like and Antidote is very important. The molecular biology knowledge, antidote, inactivation and addiction system are the common mechanisms. YefM(antidote) and YoeB(toxin) are the most common forms of cell death. The applicant decided on the three-dimensional structure of the YefM-YoeB complex. YoeB is a molecule of YefM.