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ニホンウズラにおける遺伝連鎖地図と比較染色体地図の作製

日本鹌鹑遗传连锁图谱和比较染色体图谱的制作

基本信息

批准号：
15780181
负责人：
万年英之
金额：
$ 2.43万
依托单位：
Kobe University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
财政年份：
2003
资助国家：
日本
起止时间：
2003 至 2004
项目状态：
已结题

项目摘要

本研究は最小の家禽であるニホンウズラ(Coturnix japonica)の遺伝連鎖地図の構築およびその連鎖地図とニワトリ遺伝子地図間での比較染色体地図の構築を目的とした。近年、家畜・家禽においても遺伝子地図の構築が急速に進められているが、鳥類の実験動物および経済動物として多くの利点を有する日本ウズラについては遺伝子連鎖地図の構築が行われてこなかった。この観点から申請者は1)AFLP (amplified fragment length polymorphism)法を用いたニホンウズラの連鎖地図構築、2)機能遺伝子の連鎖地図上への位置付け、3)ニワトリとの比較染色体分析を行い、相同染色体領域を同定する、の3点を目的とした。最終的に、1933のAFLPマーカーを得ることで高密度な連鎖グループの構築に成功した。この、実際の遺伝子座数としては646であった。この地図は66の連鎖グループからなり、その全長は3200cMであった。マイクロサテライトを含む機能遺伝子に対するマーカー開発、cDNA-AFLPを用いたマーカー開発、ニワトリゲノム情報を生かした機能遺伝子に対するマーカー開発により、合計30の機能遺伝子が構築した連鎖地図上に位置付けられた。この機能遺伝子マッピングの結果から、構築したニホンウズラ第1、2、3、4、6連鎖群がそれぞれニワトリ第1、2、3、4、5染色体と相同であることが示された。特に第2連鎖群に関しては物理マッピングによって、ニホンウズラの第2染色体に位置付けられた機能遺伝子VIPRが位置付けられたので第2染色体であると断定した。この日本ウズラ-ニワトリ間の相同遺伝子領域はよく保存されており、その比較染色体地図分析から機能遺伝子の順序までよく保存されていることが示された。本家系は筋ジストロフィーとニューロフィラメント欠損の表現型を持ち、これらと連鎖グループ間での連鎖解析を行ったところ、ニューロフィラメント欠損は第6連鎖群に位置付けられ、また筋ジストロフィー表現型とは連鎖が認められなかった。本研究の結果、日本ウズラにおける遺伝子地図の構築に成功した。そのニワトリとの比較染色体地図から、日本ウズラとニワトリは染色体情報においてもよく保存され、近縁種であることを裏付けている。課題としては、マイクロ染色体における保存性、マクロ染色体における染色変化の箇所を同定するために、より多くの機能遺伝子をこの地図上に位置付けることが期待される。

The aim of this study is to construct a genetic linkage map between the smallest avian species (Coturnix japonica) and the smallest avian species (Coturnix japonica). In recent years, the construction of animal and poultry genetic sites has been rapidly advancing, and the construction of animal and bird genetic sites has been rapidly advancing. The applicants for this study include 1)AFLP (amplified fragment length polymorphism) method for constructing linkage loci, 2) positional assignment of linkage loci of functional genes, 3) comparative chromosome analysis for performing the same chromosome domain identification, and 3) target identification. Finally, AFLP of 1933 was successfully constructed. 646. The number of constellations is 646. The total length of the chain is 3200cM. A total of 30 functional gene pairs were constructed based on cDNA sequences. The results of this functional linkage analysis are as follows: 1, 2, 3, 4, 6 linkage groups are identical to chromosomes 1, 2, 3, 4, 5. In particular, the second linkage group is related to the position of the second chromosome and the position of the second chromosome is related to the position of the second chromosome. The sequence of functional genes is preserved in the same gene domain as in the comparative chromosome analysis. The phenotype of this gene is linked to the position of the sixth linkage group. The results of this study show that the construction of the Japanese soil is successful. The chromosome information is preserved in the near future. The topic is the preservation of chromosomes, the identification of chromosomes, the identification of functional chromosomes, and the identification of geographical locations.