RSウイルス感染症の地理情報システム(GIS)を用いた空間的分子疫学研究

利用地理信息系统（GIS）进行呼吸道合胞病毒感染的空间分子流行病学研究

• 批准号: 15790520
• 负责人: 齋藤 玲子
• 金额: $ 2.3万
• 依托单位: Niigata University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
• 财政年份: 2003
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2003 至 2004
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-15790520/
• 关键词: RSウイルス; 分子疫学; 地理情報システム(GIS); 感染症; 地理情報システム

RSウイルス(以下RSVと略す)はA型とB型に分類され、主に冬期に流行し乳幼児の下気道感染起因ウイルスとして重要である。我々は表面抗原であるG蛋白第二可変領域の塩基解析からA又はB型と遺伝子型を決定し、RSウイルスの地域内流行状況について地理情報システム(Geographic Information System)を用いて地理的・空間的に解析してきた。前年度を通じて多数の検体が集まったため今年度は分子生物学的遺伝子型解析を主に行った。平成15年度より引き続き平成16年度も新潟市内の小児科医院を受診した下気道炎を疑わせる乳幼児から、同意の上、鼻腔吸引液を採取し、患者検体からRT-PCRでA・B型の分類を行い、さらにPCR産物をシークエンスしてRSVのG蛋白第二可変部位の塩基配列を決定し、Peretらの方法(J Gen Virol, 1998)を用い樹形図に展開し遺伝子型を決定した。前回報告した平成15年7月以降、平成17年2月まで354件検体採取され、うち123件がA型、27件がB型RSVであった。平成15年は9月から11月にかけてA型を中心とした流行で、平成16年1月以降春先まで散発的にB型がみられ、同年11〜12月に再びA型が主流の大きな流行がみられた。平成15年は遺伝子型GA5がA型の主流であったが、平成16年秋からは今までの分類型に属さない新しい遺伝子型のA型RSVの流行をみており、この変化は宿主免疫を逃れるための変異と思われRSVの進化を見る上で今後の流行動勢が興味深い。B型RSVに関しては平成14年秋に初めて検出された、G蛋白第二可変部位に60塩基の挿入がみられる特殊な型が平成15年も検出され続け、この年は全例同型であった。平成16年秋以降も検出されているものの挿入の無い通常型も混じっていた。この特殊なB型RSVは平成11年にブエノスアイレスで初めて検出され、平成14年秋〜冬には当教室以外にも札幌、横浜市でも確認され全国的に流行した可能性があり、RSVの世界的な伝播形式を考える上でも非常に興味深い所見と思われ、英文雑誌発表を行った(次ページ研究発表リスト)。

RS virus (hereinafter abbreviated RSV) is classified into type A and type B, and is prevalent in winter and is important as a cause of lower tract infection in infants. We use Geographic and spatial analysis to determine the geographic prevalence of G-protein in different regions. This year's genetic analysis of molecular biology is mainly carried out in the past. In 2015, the Department of Pediatrics in Niigata City received a diagnosis of lower respiratory tract inflammation, suspected breast cancer, consent to upper and nasal aspirate collection, patient identification, RT-PCR, classification of A and B types, PCR product selection, and determination of the nucleotide sequence of RSV's G protein second variable site.(J Gen Virol, 1998) The use of trees to expand and determine the sub-types Previous report Since July 2015, February 2017, 354 samples have been taken, 123 samples have been A type, and 27 samples have been B type RSV. Type A became popular in September 2015, Type B became popular in January 2016, and Type A became popular in November 2016. In the autumn of Heisei 15, the main trend of RSV type A was found, and in the autumn of Heisei 16, the sub-types of RSV type A were found to be new. The epidemic trend of RSV type A was changed, and the host immunity was escaped. Type B RSV was detected in the autumn of 14th year of Heisei, the second variable site of G protein was detected in the autumn of 15th year of Heisei, and the second variable site of G protein was detected in the autumn of 15th year. In the autumn of 16th year of Heisei, the general pattern of the flower was changed. This special RSV type B was first detected in Heisei 11, and confirmed in Sapporo and Yokohama cities outside the classroom in autumn and winter of Heisei 14. The possibility of spreading RSV in the whole country was examined. The spread pattern of RSV in the world was very interesting.

项目成果

Molecular epidemiology of respiratory syncytial virus infections among children with acute respiratory symptoms in a community over three seasons

• DOI: 10.1128/jcm.43.1.36-40.2005
• 发表时间: 2005-01-01
• 期刊: JOURNAL OF CLINICAL MICROBIOLOGY
• 影响因子: 9.4
• 作者: Sato, M;Saito, R;Suzuki, H
• 通讯作者: Suzuki, H