メチシリン耐性黄色ブドウ球菌MRSAの耐性伝播阻害に関する構造生物学研究
メチシリン耐性黄色ブドウ球菌MRSAの耐性伝播阻害に関する構造生物学研究
批准号:
16790033
负责人:
水谷 隆太
金额:
$2.24万
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
财政年份:
2004
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2004 至 2006
中文摘要
メチシリン耐性黄色ブドウ球菌MRSAの蔓延は、対感染症薬剤療法への脅威となっている。MRSAは、耐性に必須なペニシリン結合蛋白質の遺伝子mecAを有するとともに、組換え酵素の遺伝子をも有している。これらの遺伝子によりコードされる蛋白質は、耐性遺伝子カセットを部位特異的に切り出し、挿入する働きを持っており、薬剤耐性が蔓延する一因となっている。研究代表者は、耐性遺伝子組換反応がどのような三次元構造によって行われるのか明らかにするため、構造生物学的研究を進めてきた。本年度は、同様の遺伝子組み換えに関わるVDE蛋白質を、薬剤耐性遺伝子組み換え機構のモデルとしてとりあげ、その結晶解析を行った。昨年度までに得ているリコンビナントVDE粗精製画分を用い、VDE蛋白質を精製した。精製は、硫安沈殿による分画の後、カラムクロマトグラフィーにより行った。得られた精製蛋白質を用い、ポリエチレングリコールを沈殿剤として、金属イオン共存下でシッティングドロップ蒸気拡散法により結晶化した。得られた板状結晶を抗凍結剤溶液に透析法により移し、大型放射光施設SPring-8において、極低温下で回折像データの測定を行った。デンシトメトリー処理により、2.5A分解能までの解説強度データセットを得、その同価な回折点の一致度(RmergeI)は0.061であった。現在、分子置換法による初期モデル構築と結晶学的精密化を進めている。
英文摘要
メチシリン耐性黄色ブドウ球菌MRSAの蔓延は、対感染症薬剤療法への脅威となっている。MRSAは、耐性に必須なペニシリン結合蛋白質の遺伝子mecAを有するとともに、組換え酵素の遺伝子をも有している。これらの遺伝子によりコードされる蛋白質は、耐性遺伝子カセットを部位特異的に切り出し、挿入する働きを持っており、薬剤耐性が蔓延する一因となっている。研究代表者は、耐性遺伝子組換反応がどのような三次元構造によって行われるのか明らかにするため、構造生物学的研究を進めてきた。本年度は、同様の遺伝子組み換えに関わるVDE蛋白質を、薬剤耐性遺伝子組み換え機構のモデルとしてとりあげ、その結晶解析を行った。昨年度までに得ているリコンビナントVDE粗精製画分を用い、VDE蛋白質を精製した。精製は、硫安沈殿による分画の後、カラムクロマトグラフィーにより行った。得られた精製蛋白質を用い、ポリエチレングリコールを沈殿剤として、金属イオン共存下でシッティングドロップ蒸気拡散法により結晶化した。得られた板状結晶を抗凍結剤溶液に透析法により移し、大型放射光施設SPring-8において、極低温下で回折像データの測定を行った。デンシトメトリー処理により、2.5A分解能までの解説強度データセットを得、その同価な回折点の一致度(RmergeI)は0.061であった。現在、分子置換法による初期モデル構築と結晶学的精密化を進めている。
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Crystal Structure of a Humanized Fab Fragment of Anti-Tissue-Factor Antibody in Complex with Tissue Factor
抗组织因子抗体人源化 Fab 片段与组织因子复合物的晶体结构
DOI:
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发表时间:
2004
期刊:
J.Synchrotron Radiation 11
影响因子:
--
作者:
[U.Ohto, R.Mizutani, M.Nakamura, H.Adachi, Y.Satow.]
通讯作者:
Y.Satow.
Computed tomography imaging of neuronal structure of Drosophila brain
果蝇大脑神经元结构的计算机断层扫描成像
DOI:
--
发表时间:
2007
期刊:
Journal of Synchrotron Radiation 14(in press)
影响因子:
--
作者:
[Ryuta Mizutani, Akihisa Takeuchi, Tomohiro Hara, Kentaro Uesugi, Yoshio Suzuki]
通讯作者:
Yoshio Suzuki
タンパク質スプライシング反応の化学機構
蛋白质剪接反应的化学机制
DOI:
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发表时间:
2004
期刊:
蛋白質核酸酵素 49(1)
影响因子:
--
作者:
[水谷 隆太, 佐藤 能雅, 安楽 泰宏]
通讯作者:
安楽 泰宏
DOI:
10.1107/s0909049503023495
发表时间:
2004-01-01
期刊:
JOURNAL OF SYNCHROTRON RADIATION
影响因子:
2.5
作者:
[Mizutani, R, Anraku, Y, Satow, Y]
通讯作者:
Satow, Y
米国の統合失調症例脳組織のナノ三次元解析
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批准号:23K27491
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
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资助金额:$9.32万
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财政年份:2024
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负责人:水谷 隆太
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依托单位:
Nanometer-scale 3D analysis of brain tissue of schizophrenia cases in the U.S.
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批准号:23H02800
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
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资助金额:$11.73万
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财政年份:2023
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负责人:水谷 隆太
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依托单位:
メチシリン耐性黄色ブドウ球菌MRSAの耐性伝播機構の構造的解明
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批准号:14771261
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项目类别:Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
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资助金额:$2.43万
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财政年份:2002
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负责人:水谷 隆太
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依托单位:
自己スプライシングにより生成する酵母VMA1エンドヌクレアーゼの結晶解析
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批准号:09771942
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项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
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资助金额:$1.22万
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财政年份:1997
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负责人:水谷 隆太
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依托单位:
免疫二次応答の抗体3B44の親和力増大機構
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批准号:08772057
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项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
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资助金额:$0.64万
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财政年份:1996
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负责人:水谷 隆太
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依托单位:
海外基金