DNA転写制御に関わる光受容蛋白質の構造変化と分子情報伝達
DNA転写制御に関わる光受容蛋白質の構造変化と分子情報伝達
批准号:
05F05385
负责人:
寺嶋 正秀
金额:
$1.54万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
财政年份:
2005
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2005 至 2007
中文摘要
光によってDNAから蛋白質への発現をコントロールする、センサータンパク質の代表であるAppAと呼ばれる光合成細菌の持つタンパク質の光化学反応を、時間分解で調べ、拡散係数が時間変化するという新しい現象を見出した。この結果を元に、ダイマー化反応が起こっていることとその形成速度を決定することに成功している。更に、光センサーの代表的なタンパク質である、PYPというタンパク質について、その構造変化の詳細を明らかにするために、幾つかの変異体を用いた時間分解熱力学量測定を行った。特に、N末端を数残基から23残基欠損したPYPについて、時間分解熱容量測定を行い、この部分を欠損することによって、野生型で見られていた大きな熱容量増加が見られなくなるという顕著な変化を見出した。このことは、野生型での反応中問体における熱容盤増加の分子論的要因が、疎水性相互作用によるものであることを示しており、またN末端のヘリックス構造が、反応中間体で崩壊していると言う描像がよく適用できる事が分かった。さらに、初期中間体において大きな構造揺らぎの増加を見出した。こうした揺らぎが、それに続く構造変化を誘起している原因と考えられる。これは、発色団からN末端への情報伝達が、構造揺らぎを介して起こると言うスキームが妥当である事を示唆しており、この分野への大きな貢献となった。この成果も、国際誌に報告する予定で、現在結果をまとめている最中である。
英文摘要
光によってDNAから蛋白質への発現をコントロールする、センサータンパク質の代表であるAppAと呼ばれる光合成細菌の持つタンパク質の光化学反応を、時間分解で調べ、拡散係数が時間変化するという新しい現象を見出した。この結果を元に、ダイマー化反応が起こっていることとその形成速度を決定することに成功している。更に、光センサーの代表的なタンパク質である、PYPというタンパク質について、その構造変化の詳細を明らかにするために、幾つかの変異体を用いた時間分解熱力学量測定を行った。特に、N末端を数残基から23残基欠損したPYPについて、時間分解熱容量測定を行い、この部分を欠損することによって、野生型で見られていた大きな熱容量増加が見られなくなるという顕著な変化を見出した。このことは、野生型での反応中問体における熱容盤増加の分子論的要因が、疎水性相互作用によるものであることを示しており、またN末端のヘリックス構造が、反応中間体で崩壊していると言う描像がよく適用できる事が分かった。さらに、初期中間体において大きな構造揺らぎの増加を見出した。こうした揺らぎが、それに続く構造変化を誘起している原因と考えられる。これは、発色団からN末端への情報伝達が、構造揺らぎを介して起こると言うスキームが妥当である事を示唆しており、この分野への大きな貢献となった。この成果も、国際誌に報告する予定で、現在結果をまとめている最中である。
期刊论文(3)
专著(0)
科研奖励(0)
会议论文
Tetramer Formation Kinetics in the Signaling State of AppA monitored by the time-resolved diffusion
通过时间分辨扩散监测 AppA 信号状态下的四聚体形成动力学
DOI:
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发表时间:
2006
期刊:
Biophys.J. 91
影响因子:
--
作者:
[J.Sha, S.Ochiai, H.Okuda, 他6名, P.Hazra, P.Hazra]
通讯作者:
P.Hazra
Energetics and role of hydrophobic interaction during photoreaction of BLUF domain of AppA
AppA BLUF 结构域光反应过程中疏水相互作用的能量学和作用
DOI:
--
发表时间:
2008
期刊:
J. Phys. Chem. B 112
影响因子:
--
作者:
[P. Hazra, K. Inoue, W. Laan, K.J. Hellingwerf, M. Terazima]
通讯作者:
M. Terazima
Conformational change of photoactive yellow protein studied by the time-resolved thermodynanucs
时间分辨热力学研究光活性黄色蛋白的构象变化
DOI:
--
发表时间:
2007
期刊:
影响因子:
--
作者:
[J.Sha, S.Ochiai, H.Okuda, 他6名, P.Hazra, P.Hazra, P.Hazra]
通讯作者:
P.Hazra
空間制限液滴内でのタンパク質構造変化・反応の時間分解検出と液滴の特性解明
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批准号:23K21099
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
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资助金额:$1.91万
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财政年份:2024
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负责人:寺嶋 正秀
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依托单位:
Time-resolved detection of protein conformation changes and reactions in space limited liquid droplets
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批准号:21H01885
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
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资助金额:$11.07万
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财政年份:2021
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负责人:寺嶋 正秀
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依托单位:
水分子-蛋白質の動的相互作用のダイナミクス解明
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批准号:15076204
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$51.14万
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财政年份:2003
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负责人:寺嶋 正秀
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依托单位:
ナノスペースにおける非線形光学効果観測システム構築の試み
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批准号:13874069
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项目类别:Grant-in-Aid for Exploratory Research
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资助金额:$1.54万
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财政年份:2001
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负责人:寺嶋 正秀
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依托单位:
配向膜で規定された液晶系での拡散と異方的光化学反応ダイナミックスの解明
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批准号:08218230
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$1.28万
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财政年份:1996
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负责人:寺嶋 正秀
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依托单位:
過渡回折格子法を用いた分子配向液晶系でのダイナミックスの解明
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批准号:06239230
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$1.34万
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财政年份:1994
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负责人:寺嶋 正秀
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依托单位:
溶液中における反応中間体ラジカル類の高速配向緩和
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批准号:05640565
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项目类别:Grant-in-Aid for General Scientific Research (C)
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资助金额:$1.28万
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财政年份:1993
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负责人:寺嶋 正秀
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依托单位:
トランジェントグレーティングによるコヒーレートに励起された溶液分子の拡散過程
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批准号:04215215
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$1.15万
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财政年份:1992
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负责人:寺嶋 正秀
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依托单位:
短寿命種検出用トランジェントグレーティング法の用発と励起状態解明への応用
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批准号:04640441
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项目类别:Grant-in-Aid for General Scientific Research (C)
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资助金额:$1.28万
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财政年份:1992
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负责人:寺嶋 正秀
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依托单位:
熱レンズ法を用いた超臨界流体中での溶質-溶媒エネルギー移動
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批准号:01740252
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项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
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资助金额:$0.58万
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财政年份:1989
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负责人:寺嶋 正秀
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依托单位:
熱レンズ信号交換効率の振動モード依存性とその無輻射遷移機構への応用
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批准号:63540364
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项目类别:Grant-in-Aid for General Scientific Research (C)
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资助金额:$1.02万
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财政年份:1988
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负责人:寺嶋 正秀
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依托单位:
熱レンズ効果を用いた2つの非共有軌道の相互作用の研究
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批准号:62740246
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项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
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资助金额:$0.58万
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财政年份:1987
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负责人:寺嶋 正秀
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依托单位:
海外基金