蛍光性有機小分子プローブによるDNA損傷検出
蛍光性有機小分子プローブによるDNA損傷検出
批准号:
16750058
负责人:
西沢 精一
金额:
$2.37万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
财政年份:
2004
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2004 至 2005
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英文摘要
本研究は,有機小分子プローブを利用するDNA損傷蛍光検出法の開発を目的とする。具体的には,DNA損傷の修復過程において"脱塩基部位"が出現することに着目し,これをDNA損傷の"マーカー"として蛍光性小分子プローブにより検出するもので,既に,小分子プローブとしてAMND (2-amino-7-methyl-1,8-naphthyridine)を用いることにより,脱塩基部位生成の有無を簡便に蛍光検出(励起波長:350nm,検出波長:410nm)できることを見出している。しかし,本系をより優れたシステムとするためには,(1)蛍光応答特性の改善(励起波長の長波長化や発蛍光・レシオタイプにすること),(2)結合定数をより強化すること,が必要である。上述の課題を克服するために,本年度は,1,8-ナフチリジン骨格に蛍光団としてニトロベンゾキサジアゾール(NBD,検出波長:544nm)基を導入したプローブ(Naph-NBD)を合成し,その機能を評価した。その結果,分析化学的に有用なレシオメトリック解析(409nm/544nm蛍光強度比解析)が可能な検出プローブとして機能することが分かった。また,より長波長励起が可能な検出プローブとして,新たにリボフラビン(励起波長:448nm,検出波長:530nm)が機能することを見出した。さらに,DNAのリン酸部位への結合サイトとしてグアニジニウム基を有するアミロライドが,脱塩基部位含有DNAに対して非常に強力な親和性を発現すること(解離定数 150nM)を見出した。以上のように,優れた蛍光特性及び結合親和力を有するDNA損傷検出用の小分子プローブ群の開発を達成した。
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Abasic Sites-Containing Oligodeoxynucleotides as Aptamers for Riboflavin
含有脱碱基位点的寡脱氧核苷酸作为核黄素适体
DOI:
--
发表时间:
2006
期刊:
Angew.Chem.Int.Ed 45
影响因子:
--
作者:
[N.B. Sankaran, Seiichi Nishizawa, Takehiro Seino, Keitaro Yoshimoto, Norio Teramae]
通讯作者:
Norio Teramae
Hydrogen bond-mediated binding of ligands to nucleobase at a gap site in a DNA duplex and its use for fluorescence detection of single-nucleotide polymorphisms
氢键介导的配体与 DNA 双链体间隙位点核碱基的结合及其在单核苷酸多态性荧光检测中的应用
DOI:
--
发表时间:
2005
期刊:
Nucleic Acids Symposium Series 49
影响因子:
--
作者:
[三野孝, 白江良章, 坂本昌巳, 藤田力, S.Nishizawa et al., N.B.Sankaran et al., C.Zhao et al., H.Satake et al., Q.Dai et al., T.Seino et al.]
通讯作者:
T.Seino et al.
Ratiometric fluorescence detection of pyrimidine/purine transversion by using a 2-amino-1,8-naphtyridine derivative
使用 2-氨基-1,8-萘啶衍生物比率荧光检测嘧啶/嘌呤转换
DOI:
--
发表时间:
2006
期刊:
Analytical Sciences 22(2)
影响因子:
--
作者:
[三野孝, 白江良章, 坂本昌巳, 藤田力, S.Nishizawa et al., N.B.Sankaran et al., C.Zhao et al., H.Satake et al.]
通讯作者:
H.Satake et al.
Fluorescence detection of thymidine-related single-nucleotide polymorphisms by 3,5-diaminopyrazine derivatives
3,5-二氨基吡嗪衍生物荧光检测胸苷相关单核苷酸多态性
DOI:
--
发表时间:
2005
期刊:
Nucleic Acids Symp.Series 49
影响因子:
--
作者:
[Zhao, C.X., Dai, Q., Seino, T., Cui, Y.Y., Nishizawa, S., Teramae, N., C.Zhao et al., C.Zhao et al.]
通讯作者:
C.Zhao et al.
Strong binding of naphthyridine derivatives to a guanine base in DNA duplexes containing an AP site
萘啶衍生物与含有 AP 位点的 DNA 双链体中的鸟嘌呤碱基强结合
DOI:
--
发表时间:
2005
期刊:
Nucleic Acids Symposium Series 49
影响因子:
--
作者:
[K.Tanaka, K.Takeishi, K.Noguchi, Q.Gao et al.]
通讯作者:
Q.Gao et al.
共 6 条
フーグスティン塩基対形成型DNA蛍光プローブに基づく点突然変異遺伝子分析法の開発
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批准号:13740417
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项目类别:Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
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资助金额:$1.6万
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财政年份:2001
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负责人:西沢 精一
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依托单位:
分子内エキサイプレックス発光制御に基づく新規イオン認識蛍光プローブの開発
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批准号:11740406
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项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
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资助金额:$1.41万
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财政年份:1999
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负责人:西沢 精一
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依托单位:
多点分子認識に伴うエキシマー発光を利用したアニオン蛍光プローブの開発
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批准号:09740549
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项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
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资助金额:$1.34万
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财政年份:1997
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负责人:西沢 精一
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依托单位:
海外基金