ポストゲノム時代に対応する人工制限酵素の開発
ポストゲノム時代に対応する人工制限酵素の開発
批准号:
16750140
负责人:
須磨岡 淳
金额:
$2.18万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
财政年份:
2004
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2004 至 2005
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英文摘要
昨年度開発した1本鎖DNAを塩基配列特異的に切断する人工酵素が、バイオテクノロジーのツールとして実際に応用が可能であるかについて検討した。今回は、遺伝子組み換えを行うターゲット長鎖DNAとして、GFP遺伝子およびBFP遺伝子を選択した。これは、GFP遺伝子とBFP遺伝子との間で、わずか数アミノ酸が異なるだけであり、さらには同じアミノ酸をコードしているがコドンが異なる部分があるために、目的の組換え操作の実証には最適と判断したからである。まず、人工制限酵素を用いてGFP遺伝子をターゲット部位で切断し、この断片と別途調製したBFP遺伝子の一部とをリガーゼを用いて結合し、組換えDNAを調製した。塩基配列を確認したところ、目的の組換えDNAが調製されていることが確認された。さらに、この組換えDNAを大腸菌に導入し、BFPの発現に関しても確認した。これら結果は、今回開発した人工制限酵素が、遺伝子工学やゲノム機能解析などの次世代ツールとして、有効であることを強く示唆するものである。また、より高活性な人工制限酵素を構築するために、 Ce(IV)によるリン酸ジエステル結合の切断のメカニズムについて検討を行った。Ce(IV)が均一な低いpH条件での動力学的な解析の結果、 Ce(IV)は単独で働くのではなく、複核のクラスターを形成し、これがリン酸ジエステル加水分解に主要な役割を果たしていることが明らかになった。この結果は、生理条件下においても、Ce(IV)がクラスターで作用していることを強く示唆するものである。従って、より高活性な人工制限酵素の開発のためには、Ce(IV)を多核で含むような錯体の構築が必須であることが明らかになった。
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Monophosphate as eminent ligand to bind Ce(IV)/EDTA complex for site-selective DNA hydrolysis
单磷酸盐作为结合 Ce(IV)/EDTA 复合物的杰出配体,用于位点选择性 DNA 水解
DOI:
--
发表时间:
2004
期刊:
Chem.Lett. 33
影响因子:
--
作者:
[K.Yamana, others(5), T.Mori et al., D.Miyoshi et al., W.Chen et al.]
通讯作者:
W.Chen et al.
Direct attachment of double-stranded DNA to gold surface for preparation of nano-structured devices
双链DNA直接附着在金表面制备纳米结构器件
DOI:
--
发表时间:
2004
期刊:
Chem.Lett. 33
影响因子:
--
作者:
[Chen, W. et al., Sumaoka J. et al.]
通讯作者:
Sumaoka J. et al.
"Recombination of the GFP gene to the BFP gene using a man-made site-selective DNA cutter."
“使用人造位点选择性 DNA 切割器将 GFP 基因重组为 BFP 基因。”
DOI:
--
发表时间:
2006
期刊:
Journal of Biological Inorganic Chemistry 11
影响因子:
--
作者:
[Kitamura, Y., et. al.]
通讯作者:
et. al.
DOI:
10.1016/j.jallcom.2004.12.075
发表时间:
2006-02
期刊:
Journal of Alloys and Compounds
影响因子:
6.2
作者:
[J. Sumaoka;Wen Chen;Yoshihito Kitamura;T. Tomita;J. Yoshida;M. Komiyama]
通讯作者:
J. Sumaoka;Wen Chen;Yoshihito Kitamura;T. Tomita;J. Yoshida;M. Komiyama
DOI:
10.1021/ja048953a
发表时间:
2004-08-25
期刊:
JOURNAL OF THE AMERICAN CHEMICAL SOCIETY
影响因子:
15
作者:
[Chen, W, Kitamura, Y, Komiyama, M]
通讯作者:
Komiyama, M
新規ペプチド核酸を利用した二本鎖DNA中の5-メチルシトシンのピンポイント解析
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批准号:24K08484
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
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资助金额:$3.0万
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财政年份:2024
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负责人:須磨岡 淳
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依托单位:
酸化セリウムナノ粒子を触媒としたゲノム解析キットの開発
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批准号:21K05235
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
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资助金额:$2.66万
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财政年份:2021
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负责人:須磨岡 淳
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依托单位:
核酸を用いた希土類イオンの合目的的組織化高機能材料への応用
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批准号:17042009
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$2.3万
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财政年份:2005
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负责人:須磨岡 淳
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依托单位:
DNAを塩基配列特異的に切断する新規機能性核酸の合成とその応用
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批准号:13750812
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项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
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资助金额:$0.7万
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财政年份:2001
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负责人:須磨岡 淳
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依托单位:
人工制限酵素の合成と新規バイオテクノロジーへの応用
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批准号:08750919
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项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
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资助金额:$0.7万
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财政年份:1996
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负责人:須磨岡 淳
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依托单位:
海外基金