RNA分解産物をリサイクルするリガーゼリボザイムの創出

创建可回收 RNA 降解产物的连接酶核酶

• 批准号: 22K19118
• 负责人: 加藤 義雄
• 金额: $ 3.99万
• 依托单位: National Institute of Advanced Industrial Science and Technology
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Challenging Research (Exploratory)
• 财政年份: 2022
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2022-06-30 至 2025-03-31
• 项目状态: 未结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-22K19118/
• 关键词: RNA; 進化分子工学; リガーゼ; リボザイム

RNAワールド仮説では、前生物的な地球環境において、簡単な有機分子群が縮合を繰り返しながら大きな分子種へと変換され、モノマーヌクレオチドが大量に存在し得たという前提に端を発する。現代生物は、リボヌクレオチド三リン酸（NTP）を利用してポリマー化することにより、RNAを生合成している。NTPを基質として利用しポリマー化を促進する反応が、RNA自身によって触媒されるとするならば、自己複製可能なRNAが誕生できるのではないか、というのがNTP型仮説である。実際2001年に、NTPを連続的に縮合していく反応を触媒できるような酵素が人工進化によって作成されてきたことで、このNTP型仮説の実証が近づいてきた。しかし、前生物的環境において大量に存在し得たRNAモノマーはNTP型ではなく環状リン酸型ヌクレオチドである蓋然性が高いとの推測にもとづき、環状リン酸型のRNAポリメラーゼが存在し得たのではないかと仮説を立てた。この環状リン酸型仮説が成立しうるとすると、環状リン酸型ポリメラーゼ以前に環状リン酸型リガーゼリボザイムが出現し得たと推察される。そこで本研究では進化工学により、環状リン酸型リガーゼリボザイムの取得を試みる。初年度は、3’末端に環状リン酸を有する基質RNAと、5'末端にヒドロキシ基を有するリボザイムRNAを、安定的に調製供給する手法として、いくつかの手法論を検討した。また、初期配列としては微弱なリガーゼ活性を有する既知配列をスキャフォールドとして採用し、変異を導入しながらその効率を向上させる方針で、設計を進めている。

RNA ワールド仮说では, prebiotic earth environment において, simple 単なorganic molecule group がcondensation を缲り return しながThe molecular species of ら大きなへと変changes され, and the モノマーヌクレオチドが large amounts of にgets the premise of たというにEnd を発する. Modern biology uses してポリマー化することにより, RNA biosynthesis (NTP). NTP substrate is used to promote reaction, and RNA itself is used as a catalyst.るならば、Self-replication is possibleなRNAがbirthできるのではないか、というのがNTP type仮说である. In 2001, the condensation of NTP and the reaction of NTP were carried out as catalyst and enzyme. Artificially evolved によって made されてきたことで, このNTP type 仮说の実证がNearly づいてきた.しかし, prebiotic environment において exists in large quantities しget たRNA モノマーはNTP type ではなく cyclic リン acid type ヌクレオチドであIt is speculated that the high-density にもとづき and the cyclic リン acid-type のRNA ポリメラーゼが exist and the たのではないかと仮说を立てた. Cyclic acid type このリン acid type しうるとすると established, cyclic リン acid type ポリメラーIn the past, cyclic リリン acid-type リガーゼリボザイムが appeared, and I had to speculate on it. This research was carried out by the Evolution Engineering Institute and the cyclic linic acid-type linolefin. First year, 3' terminal cyclic リン acid を has matrix RNA と, 5' terminal にヒドロキシbase を hasるリボザイムRNA を, stable に modulation supply する Technique として, いくつかの Technique Theory を検 Discussion した.また、Initial arrangement としてはWeak なリガーゼActivity をHave するAlready known arrangement をスキャフォールドとして adopts し, changes を changes しながらそのefficiency を upward させる policy で, design を advances めている.