Predicition and verification for the structures and thermodynamic properties of telomeric DNA quadruplex/porphyrin complexes

端粒DNA四链体/卟啉复合物结构及热力学性质的预测与验证

• 批准号: 18590098
• 负责人: ISHIKAWA Yoshinobu
• 金额: $ 2.59万
• 依托单位: University of Shizuoka (2008)Kumamoto University (2006-2007)
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
• 财政年份: 2006
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2006 至 2008
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-18590098/
• 关键词: テロメア; テロメラーゼ; 核酸; 四重鎖; ポルフィリン; 分子認識; インシリコ創薬; 薬学; 生物物理; 有機化学

新規テトラカチオン性ポルフィリン、pPy、pTm、mPy、mTm、TBzPyP3、及び無電荷のポルフィリンTBzPhP3 の合成を行った。そのカチオン性ポルフィリンとテロメア四重鎖DNA との相互作用について、紫外可視吸収、円二色性、蛍光、カロリメトリーによるインビトロ相互作用解析と、分子ドッキングや分子動力学シミュレーションによるインシリコ相互作用解析を行い、さらにテロメラーゼ阻害能と抗腫瘍細胞増殖能の評価を行った。新規に合成したものの中から、TMPyP4 に比べ著しく抗腫瘍細胞増殖能の高いカチオン性ポルフィリンが見つかった。

The synthesis of new TCPs, pPy, pTm, mPy, mTm, TBzPyP3, and TCPs without charge was carried out. Analysis of four-fold locked DNA interaction, UV visible absorption, fluorescence, fluorescence, molecular dynamics, molecular dynamics analysis of four-fold locked DNA interaction, evaluation of inhibition and anti-tumor cell proliferation The new regulation is aimed at improving the proliferation ability of anti-tumor cells.

项目成果

Binding of Cationic Bis-porphyrins Linked with p- or m- Xylylenediamine and Their Zinc(II) Complexes to Duplex DNA

与对或间苯二甲胺及其锌 (II) 配合物连接的阳离子双卟啉与双链 DNA 的结合

• 发表时间: 2008
• 期刊: Molecules 13
• 作者: Ishikawa Y;Yamakawa N;Uno T
• 通讯作者: Uno T

ヘモグロビン四量体の会合安定化に関わるアミノ酸残基

参与稳定血红蛋白四聚体缔合的氨基酸残基

• 发表时间: 2008
• 作者: 宇野公之;瀧川総太郎;石丸武史;清田浩平;甲斐俊哉;石川吉伸;富杉佳計;青山浩
• 通讯作者: 青山浩

ヒト薬物代謝酵素CYP2C19における一塩基多型と代謝活性の相関

人药物代谢酶CYP2C19单核苷酸多态性与代谢活性的相关性

• 发表时间: 2008
• 作者: 佐々木隆一;Sayed M. S. Ali;小山由希子;石川吉伸;富杉佳計;青山浩;宇野公之
• 通讯作者: 宇野公之

Molecular docking of porphyrins with cationic limbs on intramolecular G-quadruplex

卟啉与分子内 G-四链体上的阳离子肢的分子对接

• 发表时间: 2007
• 期刊: Nucleic Acids Symp.Ser. 51
• 作者: Ishikawa;Y.
• 通讯作者: Y.

カチオン性ポルフィリンTMPyP4の二分子グアニン四重鎖DNAへの分子ドッキング

阳离子卟啉 TMPyP4 与双分子鸟嘌呤四链体 DNA 的分子对接

• 发表时间: 2009
• 作者: 石川吉伸;藤井敏
• 通讯作者: 藤井敏