超好熱性古細菌の糖代謝に関与する酵素の機能解析とX線結晶構造解析
超好熱性古細菌の糖代謝に関与する酵素の機能解析とX線結晶構造解析
批准号:
06J10865
负责人:
西増 弘志
金额:
$1.22万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
财政年份:
2006
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2006 至 2007
中文摘要
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英文摘要
超好熱性古細菌Sulfolobus tokodaii由来のATP依存性新規ヘキソキナーゼ(StHK)の特徴的な基質認識機構の分子基盤を解明するために、StHKと数種類の基質分子との複合体のX線結晶構造を決定することを目指した。前年度までに、4つの異なる状態[(1)アポ状態、(2)グルコース複合体、(3)ADP複合体、(4)キシロース・Mg^<2+>・ADP複合体]の結晶構造を決定し、StHKはヌクレオチドの結合ではなく糖基質の結合により大きな構造変化を起こすことや、StHKは他のヘキソキナーゼの酵素と大きくことなる基質結合部位ループをもつごとなどを明ちかにした。本年度は、StHKの基質認識機構とリン酸転移反応機構をより詳細に理解するために、(1)N-アセチルグルコサミン・(GlcNAc)との二者複合体、および(2)グルコース、ADP、Mg^<2+>との四者複合体のX線結晶構造解析を目指した。GlcNAc複合体については、結晶化スクリーニングを行い、単結晶を得ることに成功したが、X線をほとんど回折しなかった。一方、グルコース、ADP、Mg^<2+>複合体については、複合体結晶を得て、2AまでのX線回折データを収集し、分子置換法により位相を決定し、現在精密化を行っている。これまでに得られた結果を、2007年9月に東京大学で開催された東京大学生命科学研究シンポジウム2007にてポスター発表し、さらにPFトピックスおよびPFニュースにて発表した。
期刊论文(0)
专著(0)
科研奖励(0)
会议论文
DOI:
10.1128/jb.188.5.2014-2019.2006
发表时间:
2006-03-01
期刊:
JOURNAL OF BACTERIOLOGY
影响因子:
3.2
作者:
[Nishimasu, H, Fushinobu, S, Wakagi, T]
通讯作者:
Wakagi, T
DOI:
10.1074/jbc.m610678200
发表时间:
2007-03-30
期刊:
JOURNAL OF BIOLOGICAL CHEMISTRY
影响因子:
4.8
作者:
[Nishimasu, Hiroshi, Fushinobu, Shinya, Wakagi, Takayoshi]
通讯作者:
Wakagi, Takayoshi
Structural and functional analysis of diverse RNA helicases involved in innate immunity
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批准号:22H00403
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (A)
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资助金额:$27.46万
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财政年份:2022
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负责人:西増 弘志
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依托单位:
CRISPRを用いた新規ゲノム改変技術の開発
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批准号:20K20579
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项目类别:Grant-in-Aid for Challenging Research (Pioneering)
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资助金额:$16.64万
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财政年份:2020
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负责人:西増 弘志
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依托单位:
小分子非翻訳RNAの成熟・多様機能の構造基盤の解明
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批准号:08J08664
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项目类别:Grant-in-Aid for JSPS Fellows
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资助金额:$0.51万
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财政年份:2008
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负责人:西増 弘志
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依托单位:
海外基金