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Establishment of Dynamical Foundations of Selectivity and Stochasticity in Biomolecule Functions and Chemical Reaction Networks

生物分子功能和化学反应网络中选择性和随机性动力学基础的建立

基本信息

批准号：
18340124
负责人：
KOMATSUZAKI Tamiki
金额：
$ 11.17万
依托单位：
Hokkaido University (2007-2008)Kobe University (2006)
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
财政年份：
2006
资助国家：
日本
起止时间：
2006 至 2008
项目状态：
已结题

项目摘要

相空間構造に立脚して熱的環境において、頑健に存在し得る反応の選択性の起源とその崩壊原理を解明した。また、1分子の挙動の時系列データを通して、背後に存在する自由エネルギー地形および状態遷移ネットワーク構造をできるだけ自然な形で得る汎用なダイナミックス基盤を開発した。この方法論を用いて、将来的には、例えばアルツハイマー病の原因であるアミロイド凝集体の形成機構の解明などへの展開が期待される。

To explain the origin and collapse principle of phase space structure in the hot environment 1. The molecular motion of the time-series of data is communicated, and the existence of the free form of the data is reflected in the structure of the data. This methodology is applied in the future, and the reasons for this problem are discussed in detail.

项目成果

期刊论文数量（0）

专著数量（0）

科研奖励数量（0）

会议论文数量（0）

专利数量（0）

複雑な多谷ポテンシャルエネルギー面上で生起する動力学諸問題III-タンパク質とその周辺-(研究会報告)

复杂的塔亚势能面 III 上出现的动力学问题 - 蛋白质及其周围环境 -（研究组报告）

DOI：
发表时间：
2006
期刊：
物性研究 86
影响因子：
0
作者：
Nishida;et al.;渕上壮太郎編
通讯作者：
渕上壮太郎編

Extracting Protein Conformational Dynamics on a Photon-by-Photon Basisin Single Molecule Experiments

在单分子实验中逐个光子地提取蛋白质构象动力学

DOI：
发表时间：
2007
期刊：
影响因子：
0
作者：
Chun-Biu Li;Tamiki Komatsuzaki
通讯作者：
Tamiki Komatsuzaki

Dimension reduction for extracting geometrical structure of multidimensional phase space : Application to fast energy exchange in the reactionO(^1D)+N_2O→NO+NO

用于提取多维相空间几何结构的降维：应用于反应中的快速能量交换 O(^1D)+N_2O→NO+NO

DOI：
发表时间：
2007
期刊：
Physical Review A 75
影响因子：
0
作者：
Shinnosuke Kawai;Yo Fujimura;Okitsugu Kajimoto;Takefumi Yamashita,Chun Biu Li;Tamiki Komatsuzaki;and Mikito Toda
通讯作者：
and Mikito Toda

Dimension reduction for extracting geometrical structure of multidimensional phase space : Application to fast energy exchange in the reaction O(^1D)+N_2O→NO+NO

用于提取多维相空间几何结构的降维：应用于反应中的快速能量交换 O(^1D)+N_2O→NO+NO

DOI：
发表时间：
2007
期刊：
Physical Review A 75
影响因子：
0
作者：
Masahito Kinoshita;Kiyoto Kamagata;Akio Maeda;Yuji Goto;Tamiki Komatsuzaki and Satoshi Takahashi;白川智弘・郡司ペギオ幸夫・小松崎民樹;Shinnosuke Kawai
通讯作者：
Shinnosuke Kawai

Geometrical Structure buriedin the Phase Space of StochasticStructural Transition

埋藏在随机结构转变相空间中的几何结构