新規環境応答型蛍光性修飾塩基の開発
新型环境响应型荧光修饰碱基的开发
基本信息
- 批准号:07J06304
- 负责人:
- 金额:$ 0.77万
- 依托单位:
- 依托单位国家:日本
- 项目类别:Grant-in-Aid for JSPS Fellows
- 财政年份:2007
- 资助国家:日本
- 起止时间:2007 至 2008
- 项目状态:已结题
- 来源:
- 关键词:
项目摘要
極性応答型蛍光色素であるプロダンをラベル化した修飾塩基の合成を行ない、一塩基多型検出への応用を試みた。プロダン修飾ウリジンを開発した結果、コンセプト通り誘電環境の違いを利用した蛍光による-塩基の識別を実現できた。プロダン修飾ウリジンのストークスシフトは、周辺環境の誘電率に大きく依存し、相補的な二本鎖を形成した場合と非相補的な二本鎖を形成した場合とで、ストークスシフトが大きく変化した。これは、相補的二本鎖を形成した場合では、発色団がメジャーグルーブの疎水領域に留められている一方で、非相補的二本鎖を形成した場合では、塩基対間の水素結合が弱くなるため発色団が比較的自由に拡散して親水領域に移動できることに起因している。また、興味深いことに発光波長の変化に比べて吸収波長の変化が顕著であり、相補的な二本鎖を形成した場合、吸収波長が長波長シフトしていた。この性質を利用して450nmで励起することにより、相補的な塩基と非相補的な塩基を蛍光識別することに成功した。次にシトシン誘導体、アデニン誘導体、グアニン誘導体をそれぞれ合成し、蛍光特性を調べたところ、全ての修飾塩基で例外なく相補的塩基を蛍光識別できることが示された。従来のBDFプローブは、以下に示す二つの問題点を有していた。一つ目は、蛍光強度がグアニン残基に強く影響を受けることで、同じコンセプトで全ての配列に適用することができなかった。二つ目は350nm以下の短い励起波長であることであり、細胞内での検出を行なう際には他の成分由来の自家蛍光が問題となり検出感度が低下していた。本研究において開発された極性応答型BDFプローブは、発色団が核酸塩基によって蛍光消光を受けず、450nmという細胞の自家蛍光が干渉しない長波長領域で励起することが可能であるという点で極めて汎用性が高い。
Polar-type fluorescent pigments can be synthesized by chemical modification, and multi-type fluorescent pigments can be used. The results of the development of the technology and the application of the technology in the inductive environment are presented in detail. The dielectric constant of the surrounding environment is greatly dependent on and complementary to the formation of two fundamental locks. In the case of two complementary locks, the color of each pair of water elements is weak, and the color of each pair of water elements is weak. The wavelength of light emitted by the laser is different from that of the absorption wavelength, and the absorption wavelength is different from that of the long wavelength. The properties of this material are successfully identified by excitation at 450nm and by complementary light. The secondary inducer, the secondary inducer. The following is a summary of the problems encountered by BDF. A strong influence of light intensity on the distribution of residues is also observed. 2. Short excitation wavelength below 350nm, detection in cells, origin of other components, low sensitivity In this study, we developed a polar response type BDF with high versatility in the range of 450 nm, 450nm, 450nm, and 450nm.
项目成果
期刊论文数量(0)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
PRODAN-conjugated DNA: synthesis and photochemical properties.
- DOI:10.1021/ja069156a
- 发表时间:2007-03
- 期刊:
- 影响因子:15
- 作者:Kazuki Tainaka;Kazuo Tanaka;S. Ikeda;Ken-ichiro Nishiza;Tomo Unzai;Yoshimasa Fujiwara;I. Saito;A. Okamoto
- 通讯作者:Kazuki Tainaka;Kazuo Tanaka;S. Ikeda;Ken-ichiro Nishiza;Tomo Unzai;Yoshimasa Fujiwara;I. Saito;A. Okamoto
Selective oxidation of methylcytosine in single base pair mismatches by osmium complex
锇络合物选择性氧化单碱基对错配中的甲基胞嘧啶
- DOI:
- 发表时间:2007
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:Nomura;Akiko; Tainaka;Kazuki; Okamoto;Akimitsu
- 通讯作者:Akimitsu
Synthesis and fluorescence properties of dimethylaminonaphthalenedeoxyuridine conjugates as micropolarity-sensitive probes
二甲氨基萘脱氧尿苷缀合物作为微极性敏感探针的合成和荧光性质
- DOI:
- 发表时间:2007
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:Okamoto;Akimitsu; Tainaka;Kazuki; Unzai;Tomo; Saito;Isao
- 通讯作者:Isao
Direct labeling of 5-methylcytosine and its applications
- DOI:10.1021/ja068660c
- 发表时间:2007-05-02
- 期刊:
- 影响因子:15
- 作者:Tanaka, Kazuo;Tainaka, Kazuki;Okamoto, Akimitsu
- 通讯作者:Okamoto, Akimitsu
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田井中 一貫其他文献
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